RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428732.1

DEPDC1-AS1-201, DEPDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DEPDC1-AS1, Length 1,247 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ADAMTS12P58397 1594 aa23.5■■□□□ 1.35
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.38■■□□□ 1.33
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SHROOM2Q13796 1616 aa23.35■■□□□ 1.33
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ASXL2Q76L83 1435 aa22.68■■□□□ 1.22
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GLI2P10070 1586 aa22.62■■□□□ 1.21
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.34■■□□□ 1.17
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CD109Q6YHK3 1445 aa22.31■■□□□ 1.16
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.3■■□□□ 1.16
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.3■■□□□ 1.16
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ATP10BO94823 1461 aa22.21■■□□□ 1.15
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RNF39Q9H2S5 420 aa22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 SAMD9Q5K651 1589 aa22.19■■□□□ 1.14
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.12■■□□□ 1.13
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.11■■□□□ 1.13
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.1■■□□□ 1.13
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 KIF21BO75037 1637 aa22.09■■□□□ 1.13
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 EEA1Q15075 1411 aa22.08■■□□□ 1.13
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.05■■□□□ 1.12
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 NEO1Q92859 1461 aa22.02■■□□□ 1.12
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DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.95■■□□□ 1.11
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.93■■□□□ 1.1
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.91■■□□□ 1.1
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 PTPRMP28827 1452 aa21.89■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 AKNAQ7Z591 1439 aa21.86■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 FANCAO15360 1455 aa21.85■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.85■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.85■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.84■■□□□ 1.09
DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 RICTORQ6R327 1708 aa21.83■■□□□ 1.09
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