RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

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Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 CUL7Q14999 1698 aa20.77■□□□□ 0.92
RPSAP46-201ENST00000428316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.75■□□□□ 0.91
RPSAP46-201ENST00000428316 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.65■□□□□ 0.9
RPSAP46-201ENST00000428316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
RPSAP46-201ENST00000428316 PRXQ9BXM0 1461 aa20.57■□□□□ 0.88
RPSAP46-201ENST00000428316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.53■□□□□ 0.88
RPSAP46-201ENST00000428316 IQGAP2Q13576 1575 aa20.52■□□□□ 0.88
RPSAP46-201ENST00000428316 PTPRGP23470 1445 aa20.5■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 DISP1Q96F81 1524 aa20.49■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.49■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.48■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.48■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.47■□□□□ 0.87
RPSAP46-201ENST00000428316 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.44■□□□□ 0.86
RPSAP46-201ENST00000428316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
RPSAP46-201ENST00000428316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RPSAP46-201ENST00000428316 EEA1Q15075 1411 aa20.4■□□□□ 0.86
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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RPSAP46-201ENST00000428316 UACAQ9BZF9 1416 aa20.35■□□□□ 0.85
RPSAP46-201ENST00000428316 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.34■□□□□ 0.85
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA0556O60303 1618 aa20.34■□□□□ 0.85
RPSAP46-201ENST00000428316 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.33■□□□□ 0.85
RPSAP46-201ENST00000428316 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.32■□□□□ 0.84
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.32■□□□□ 0.84
RPSAP46-201ENST00000428316 ABCC2Q92887 1545 aa20.31■□□□□ 0.84
RPSAP46-201ENST00000428316 GOLGA3Q08378 1498 aa20.28■□□□□ 0.84
RPSAP46-201ENST00000428316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.27■□□□□ 0.84
RPSAP46-201ENST00000428316 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.25■□□□□ 0.83
RPSAP46-201ENST00000428316 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.24■□□□□ 0.83
RPSAP46-201ENST00000428316 P3H3Q8IVL6 736 aa20.23■□□□□ 0.83
RPSAP46-201ENST00000428316 DIP2BQ9P265 1576 aa20.22■□□□□ 0.83
RPSAP46-201ENST00000428316 ASXL2Q76L83 1435 aa20.22■□□□□ 0.83
RPSAP46-201ENST00000428316 ABCA8O94911 1581 aa20.18■□□□□ 0.82
RPSAP46-201ENST00000428316 KIF21BO75037 1637 aa20.18■□□□□ 0.82
RPSAP46-201ENST00000428316 SAMD9Q5K651 1589 aa20.15■□□□□ 0.82
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RPSAP46-201ENST00000428316 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RPSAP46-201ENST00000428316 GLI2P10070 1586 aa20.11■□□□□ 0.81
RPSAP46-201ENST00000428316 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RPSAP46-201ENST00000428316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.1■□□□□ 0.81
RPSAP46-201ENST00000428316 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RPSAP46-201ENST00000428316 ATP10BO94823 1461 aa20.07■□□□□ 0.8
RPSAP46-201ENST00000428316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.06■□□□□ 0.8
RPSAP46-201ENST00000428316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.05■□□□□ 0.8
RPSAP46-201ENST00000428316 ARID3CA6NKF2 412 aa20.03■□□□□ 0.8
RPSAP46-201ENST00000428316 KCNH8Q96L42 1107 aa20.02■□□□□ 0.8
RPSAP46-201ENST00000428316 TSPOAP1O95153 1857 aa20■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.99■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.98■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.98■□□□□ 0.79
RPSAP46-201ENST00000428316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.95■□□□□ 0.78
RPSAP46-201ENST00000428316 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
RPSAP46-201ENST00000428316 CD109Q6YHK3 1445 aa19.93■□□□□ 0.78
RPSAP46-201ENST00000428316 KDM6BO15054 1643 aa19.91■□□□□ 0.78
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RPSAP46-201ENST00000428316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
RPSAP46-201ENST00000428316 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
RPSAP46-201ENST00000428316 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.87■□□□□ 0.77
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RPSAP46-201ENST00000428316 FMN1Q68DA7 1419 aa19.85■□□□□ 0.77
RPSAP46-201ENST00000428316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.84■□□□□ 0.77
RPSAP46-201ENST00000428316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.81■□□□□ 0.76
RPSAP46-201ENST00000428316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RPSAP46-201ENST00000428316 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
RPSAP46-201ENST00000428316 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.76■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.74■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.73■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 CLIP1P30622 1438 aa19.72■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.71■□□□□ 0.75
RPSAP46-201ENST00000428316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.7■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 HECW1Q76N89 1606 aa19.7■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 NEO1Q92859 1461 aa19.69■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.67■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 RAPGEF3O95398 923 aa19.67■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.65■□□□□ 0.74
RPSAP46-201ENST00000428316 PLCH2O75038 1416 aa19.64■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.64■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 AKNAQ7Z591 1439 aa19.62■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 FANCAO15360 1455 aa19.6■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.59■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP162Q5TB80 1403 aa19.59■□□□□ 0.73
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.57■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 KIF14Q15058 1648 aa19.57■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.56■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.55■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 ADGRL1O94910 1474 aa19.54■□□□□ 0.72
RPSAP46-201ENST00000428316 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.51■□□□□ 0.71
RPSAP46-201ENST00000428316 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.49■□□□□ 0.71
RPSAP46-201ENST00000428316 RICTORQ6R327 1708 aa19.48■□□□□ 0.71
RPSAP46-201ENST00000428316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.45■□□□□ 0.7
RPSAP46-201ENST00000428316 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.44■□□□□ 0.7
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