RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427389.5

JOSD1-204, Transcript of Josephin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene JOSD1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JOSD1-204ENST00000427389 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.77■■■■■ 4.44
JOSD1-204ENST00000427389 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
JOSD1-204ENST00000427389 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.66■■■■■ 4.42
JOSD1-204ENST00000427389 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
JOSD1-204ENST00000427389 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.43■■■■■ 4.38
JOSD1-204ENST00000427389 IQGAP2Q13576 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
JOSD1-204ENST00000427389 PRXQ9BXM0 1461 aa42.21■■■■■ 4.35
JOSD1-204ENST00000427389 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.16■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 PTPRGP23470 1445 aa42.14■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.14■■■■■ 4.34
JOSD1-204ENST00000427389 DISP1Q96F81 1524 aa42.13■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.12■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.1■■■■■ 4.33
JOSD1-204ENST00000427389 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.04■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
JOSD1-204ENST00000427389 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.97■■■■■ 4.31
JOSD1-204ENST00000427389 MAPKBP1O60336 1514 aa41.95■■■■■ 4.31
JOSD1-204ENST00000427389 KIAA0556O60303 1618 aa41.92■■■■■ 4.3
JOSD1-204ENST00000427389 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.9■■■■■ 4.3
JOSD1-204ENST00000427389 EEA1Q15075 1411 aa41.9■■■■■ 4.3
JOSD1-204ENST00000427389 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.89■■■■■ 4.3
JOSD1-204ENST00000427389 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.85■■■■■ 4.29
JOSD1-204ENST00000427389 UACAQ9BZF9 1416 aa41.84■■■■■ 4.29
JOSD1-204ENST00000427389 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.84■■■■■ 4.29
JOSD1-204ENST00000427389 ABCC2Q92887 1545 aa41.82■■■■■ 4.29
JOSD1-204ENST00000427389 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.8■■■■■ 4.28
JOSD1-204ENST00000427389 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
JOSD1-204ENST00000427389 GOLGA3Q08378 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
JOSD1-204ENST00000427389 DIP2BQ9P265 1576 aa41.74■■■■■ 4.27
JOSD1-204ENST00000427389 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.65■■■■■ 4.26
JOSD1-204ENST00000427389 ASXL2Q76L83 1435 aa41.63■■■■■ 4.26
JOSD1-204ENST00000427389 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.62■■■■■ 4.25
JOSD1-204ENST00000427389 P3H3Q8IVL6 736 aa41.55■■■■■ 4.24
JOSD1-204ENST00000427389 ABCA8O94911 1581 aa41.54■■■■■ 4.24
JOSD1-204ENST00000427389 KIF21BO75037 1637 aa41.52■■■■■ 4.24
JOSD1-204ENST00000427389 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
JOSD1-204ENST00000427389 SAMD9Q5K651 1589 aa41.49■■■■■ 4.23
JOSD1-204ENST00000427389 GLI2P10070 1586 aa41.42■■■■■ 4.22
JOSD1-204ENST00000427389 TSPOAP1O95153 1857 aa41.39■■■■■ 4.22
JOSD1-204ENST00000427389 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
JOSD1-204ENST00000427389 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
JOSD1-204ENST00000427389 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.3■■■■■ 4.2
JOSD1-204ENST00000427389 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.29■■■■■ 4.2
JOSD1-204ENST00000427389 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
JOSD1-204ENST00000427389 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.25■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 ATP10BO94823 1461 aa41.23■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 ARID3CA6NKF2 412 aa41.21■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.2■■■■■ 4.19
JOSD1-204ENST00000427389 KDM6BO15054 1643 aa41.16■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.16■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.15■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 KCNH8Q96L42 1107 aa41.14■■■■■ 4.18
JOSD1-204ENST00000427389 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
JOSD1-204ENST00000427389 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.16
JOSD1-204ENST00000427389 CD109Q6YHK3 1445 aa41■■■■■ 4.15
JOSD1-204ENST00000427389 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.99■■■■■ 4.15
JOSD1-204ENST00000427389 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.96■■■■■ 4.15
JOSD1-204ENST00000427389 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.96■■■■■ 4.15
JOSD1-204ENST00000427389 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.94■■■■■ 4.14
JOSD1-204ENST00000427389 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
JOSD1-204ENST00000427389 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
JOSD1-204ENST00000427389 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.82■■■■■ 4.12
JOSD1-204ENST00000427389 FMN1Q68DA7 1419 aa40.79■■■■■ 4.12
JOSD1-204ENST00000427389 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.77■■■■■ 4.12
JOSD1-204ENST00000427389 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
JOSD1-204ENST00000427389 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
JOSD1-204ENST00000427389 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
JOSD1-204ENST00000427389 HECW1Q76N89 1606 aa40.63■■■■■ 4.09
JOSD1-204ENST00000427389 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.62■■■■■ 4.09
JOSD1-204ENST00000427389 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.62■■■■■ 4.09
JOSD1-204ENST00000427389 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.086e-6■■■■□ 21.5
JOSD1-204ENST00000427389 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.56■■■■■ 4.08
JOSD1-204ENST00000427389 NEO1Q92859 1461 aa40.53■■■■■ 4.08
JOSD1-204ENST00000427389 CLIP1P30622 1438 aa40.51■■■■■ 4.08
JOSD1-204ENST00000427389 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.49■■■■■ 4.07
JOSD1-204ENST00000427389 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.48■■■■■ 4.07
JOSD1-204ENST00000427389 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.47■■■■■ 4.07
JOSD1-204ENST00000427389 RAPGEF3O95398 923 aa40.43■■■■■ 4.06
JOSD1-204ENST00000427389 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
JOSD1-204ENST00000427389 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.43■■■■■ 4.06
JOSD1-204ENST00000427389 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 FANCAO15360 1455 aa40.37■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 AKNAQ7Z591 1439 aa40.36■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 ADGRL1O94910 1474 aa40.36■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 PLCH2O75038 1416 aa40.33■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.32■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 KIF14Q15058 1648 aa40.32■■■■■ 4.05
JOSD1-204ENST00000427389 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.3■■■■■ 4.04
JOSD1-204ENST00000427389 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.29■■■■■ 4.04
JOSD1-204ENST00000427389 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.26■■■■■ 4.04
JOSD1-204ENST00000427389 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 CEP162Q5TB80 1403 aa40.22■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.21■■■■■ 4.03
JOSD1-204ENST00000427389 RICTORQ6R327 1708 aa40.19■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.17■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.15■■■■■ 4.02
JOSD1-204ENST00000427389 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.12■■■■■ 4.01
JOSD1-204ENST00000427389 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms