RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.31■■■□□ 2.44
HERC3-205ENST00000426683 JPH4Q96JJ6 628 aa30.3■■■□□ 2.44
HERC3-205ENST00000426683 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.29■■■□□ 2.44
HERC3-205ENST00000426683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.28■■■□□ 2.44
HERC3-205ENST00000426683 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
HERC3-205ENST00000426683 PRXQ9BXM0 1461 aa30.19■■■□□ 2.42
HERC3-205ENST00000426683 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.18■■■□□ 2.42
HERC3-205ENST00000426683 EEA1Q15075 1411 aa30.18■■■□□ 2.42
HERC3-205ENST00000426683 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HERC3-205ENST00000426683 IQGAP2Q13576 1575 aa30.1■■■□□ 2.41
HERC3-205ENST00000426683 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.97■■■□□ 2.39
HERC3-205ENST00000426683 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.95■■■□□ 2.38
HERC3-205ENST00000426683 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.94■■■□□ 2.38
HERC3-205ENST00000426683 DISP1Q96F81 1524 aa29.91■■■□□ 2.38
HERC3-205ENST00000426683 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.9■■■□□ 2.38
HERC3-205ENST00000426683 PTPRGP23470 1445 aa29.88■■■□□ 2.37
HERC3-205ENST00000426683 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
HERC3-205ENST00000426683 KIF21BO75037 1637 aa29.85■■■□□ 2.37
HERC3-205ENST00000426683 KIAA0556O60303 1618 aa29.82■■■□□ 2.36
HERC3-205ENST00000426683 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
HERC3-205ENST00000426683 GOLGA3Q08378 1498 aa29.79■■■□□ 2.36
HERC3-205ENST00000426683 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.75■■■□□ 2.35
HERC3-205ENST00000426683 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.74■■■□□ 2.35
HERC3-205ENST00000426683 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
HERC3-205ENST00000426683 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HERC3-205ENST00000426683 UACAQ9BZF9 1416 aa29.67■■■□□ 2.34
HERC3-205ENST00000426683 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HERC3-205ENST00000426683 P3H3Q8IVL6 736 aa29.65■■■□□ 2.34
HERC3-205ENST00000426683 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.62■■■□□ 2.33
HERC3-205ENST00000426683 ABCC2Q92887 1545 aa29.6■■■□□ 2.33
HERC3-205ENST00000426683 SAMD9Q5K651 1589 aa29.6■■■□□ 2.33
HERC3-205ENST00000426683 MAPKBP1O60336 1514 aa29.57■■■□□ 2.32
HERC3-205ENST00000426683 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.55■■■□□ 2.32
HERC3-205ENST00000426683 ABCA8O94911 1581 aa29.5■■■□□ 2.31
HERC3-205ENST00000426683 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.48■■■□□ 2.31
HERC3-205ENST00000426683 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
HERC3-205ENST00000426683 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.48■■■□□ 2.31
HERC3-205ENST00000426683 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.45■■■□□ 2.31
HERC3-205ENST00000426683 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.43■■■□□ 2.3
HERC3-205ENST00000426683 ASXL2Q76L83 1435 aa29.42■■■□□ 2.3
HERC3-205ENST00000426683 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
HERC3-205ENST00000426683 DIP2BQ9P265 1576 aa29.38■■■□□ 2.29
HERC3-205ENST00000426683 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.38■■■□□ 2.29
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.35■■■□□ 2.29
HERC3-205ENST00000426683 ARID3CA6NKF2 412 aa29.34■■■□□ 2.29
HERC3-205ENST00000426683 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.34■■■□□ 2.29
HERC3-205ENST00000426683 ATP10BO94823 1461 aa29.28■■■□□ 2.28
HERC3-205ENST00000426683 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.26■■■□□ 2.27
HERC3-205ENST00000426683 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HERC3-205ENST00000426683 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
HERC3-205ENST00000426683 FMN1Q68DA7 1419 aa29.22■■■□□ 2.27
HERC3-205ENST00000426683 GLI2P10070 1586 aa29.22■■■□□ 2.27
HERC3-205ENST00000426683 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
HERC3-205ENST00000426683 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
HERC3-205ENST00000426683 CLIP1P30622 1438 aa29.18■■■□□ 2.26
HERC3-205ENST00000426683 KCNH8Q96L42 1107 aa29.16■■■□□ 2.26
HERC3-205ENST00000426683 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.12■■■□□ 2.25
HERC3-205ENST00000426683 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HERC3-205ENST00000426683 TSPOAP1O95153 1857 aa29.1■■■□□ 2.25
HERC3-205ENST00000426683 HECW1Q76N89 1606 aa29.07■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.07■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.04■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 CEP162Q5TB80 1403 aa29.03■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HERC3-205ENST00000426683 CD109Q6YHK3 1445 aa29.01■■■□□ 2.23
HERC3-205ENST00000426683 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.99■■■□□ 2.23
HERC3-205ENST00000426683 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HERC3-205ENST00000426683 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.97■■■□□ 2.23
HERC3-205ENST00000426683 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.97■■■□□ 2.23
HERC3-205ENST00000426683 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.94■■■□□ 2.22
HERC3-205ENST00000426683 KDM6BO15054 1643 aa28.93■■■□□ 2.22
HERC3-205ENST00000426683 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.92■■■□□ 2.22
HERC3-205ENST00000426683 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
HERC3-205ENST00000426683 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.91■■■□□ 2.22
HERC3-205ENST00000426683 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.87■■■□□ 2.21
HERC3-205ENST00000426683 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.87■■■□□ 2.21
HERC3-205ENST00000426683 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
HERC3-205ENST00000426683 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
HERC3-205ENST00000426683 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
HERC3-205ENST00000426683 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.77■■■□□ 2.2
HERC3-205ENST00000426683 KIF14Q15058 1648 aa28.73■■■□□ 2.19
HERC3-205ENST00000426683 NEO1Q92859 1461 aa28.72■■■□□ 2.19
HERC3-205ENST00000426683 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.71■■■□□ 2.19
HERC3-205ENST00000426683 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.69■■■□□ 2.18
HERC3-205ENST00000426683 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.67■■■□□ 2.18
HERC3-205ENST00000426683 PLCH2O75038 1416 aa28.67■■■□□ 2.18
HERC3-205ENST00000426683 FANCAO15360 1455 aa28.66■■■□□ 2.18
HERC3-205ENST00000426683 AKNAQ7Z591 1439 aa28.62■■■□□ 2.17
HERC3-205ENST00000426683 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.61■■■□□ 2.17
HERC3-205ENST00000426683 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.61■■■□□ 2.17
HERC3-205ENST00000426683 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.59■■■□□ 2.17
HERC3-205ENST00000426683 RAPGEF3O95398 923 aa28.58■■■□□ 2.17
HERC3-205ENST00000426683 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.57■■■□□ 2.16
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.54■■■□□ 2.16
HERC3-205ENST00000426683 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
HERC3-205ENST00000426683 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.52■■■□□ 2.16
HERC3-205ENST00000426683 ADGRL1O94910 1474 aa28.51■■■□□ 2.15
HERC3-205ENST00000426683 TIAM1Q13009 1591 aa28.5■■■□□ 2.15
HERC3-205ENST00000426683 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms