RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424076.7

MEG3-207, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 5

Gene MEG3, Length 2,672 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-207ENST00000424076 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.38■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.35■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.35■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 MAP3K1Q13233 1512 aa21.35■■□□□ 1.01
MEG3-207ENST00000424076 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.32■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.31■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 ITGAEP38570 1179 aa21.29■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.28■■□□□ 1
MEG3-207ENST00000424076 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.25■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.23■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.23■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.22■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
MEG3-207ENST00000424076 PBRM1Q86U86 1689 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-207ENST00000424076 SAMD9Q5K651 1589 aa21.19■□□□□ 0.98
MEG3-207ENST00000424076 FMN1Q68DA7 1419 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-207ENST00000424076 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.17■□□□□ 0.98
MEG3-207ENST00000424076 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.13■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.11■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.1■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 ADAMTS12P58397 1594 aa21.1■□□□□ 0.97
MEG3-207ENST00000424076 WDR62O43379 1518 aa21.07■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 GRIN2BQ13224 1484 aa21.06■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 IFT140Q96RY7 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.02■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.02■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 IQGAP2Q13576 1575 aa21.02■□□□□ 0.96
MEG3-207ENST00000424076 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.98■□□□□ 0.95
MEG3-207ENST00000424076 MAPKBP1O60336 1514 aa20.98■□□□□ 0.95
MEG3-207ENST00000424076 ERCC6Q03468 1493 aa20.97■□□□□ 0.95
MEG3-207ENST00000424076 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
MEG3-207ENST00000424076 NCOA2Q15596 1464 aa20.94■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.93■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.9■□□□□ 0.94
MEG3-207ENST00000424076 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.88■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.88■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 ARID3CA6NKF2 412 aa20.88■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 MIER1Q8N108 512 aa20.88■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 PTPRKQ15262 1439 aa20.88■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 HECW1Q76N89 1606 aa20.87■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.87■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 GRIN2AQ12879 1464 aa20.86■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 NEUROD1Q13562 356 aa20.85■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.85■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 ARHGEF11O15085 1522 aa20.83■□□□□ 0.93
MEG3-207ENST00000424076 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.83■□□□□ 0.92
MEG3-207ENST00000424076 DISP1Q96F81 1524 aa20.83■□□□□ 0.92
MEG3-207ENST00000424076 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
MEG3-207ENST00000424076 KIAA0556O60303 1618 aa20.8■□□□□ 0.92
MEG3-207ENST00000424076 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.8■□□□□ 0.92
MEG3-207ENST00000424076 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 HFM1A2PYH4 1435 aa20.76■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 FBLN2P98095 1184 aa20.75■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 CEP170Q5SW79 1584 aa20.74■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 SYNJ2O15056 1496 aa20.73■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 NAIPQ13075 1403 aa20.73■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
MEG3-207ENST00000424076 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
MEG3-207ENST00000424076 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.69■□□□□ 0.9
MEG3-207ENST00000424076 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.68■□□□□ 0.9
MEG3-207ENST00000424076 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.67■□□□□ 0.9
MEG3-207ENST00000424076 UACAQ9BZF9 1416 aa20.67■□□□□ 0.9
MEG3-207ENST00000424076 MIA2Q96PC5 1412 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 NUP160Q12769 1436 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.63■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 JPH4Q96JJ6 628 aa20.61■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 KDM6BO15054 1643 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.59■□□□□ 0.89
MEG3-207ENST00000424076 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.57■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.54■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 AKNAQ7Z591 1439 aa20.53■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 TONSLQ96HA7 1378 aa20.53■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
MEG3-207ENST00000424076 DAPK1P53355 1430 aa20.51■□□□□ 0.87
MEG3-207ENST00000424076 TRIM52Q96A61 297 aa20.5■□□□□ 0.87
MEG3-207ENST00000424076 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
MEG3-207ENST00000424076 ABCC5O15440 1437 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms