RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423097.5

EIF4ENIF1-208, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1, human

TSL 2

Gene EIF4ENIF1, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.58	■■■□□ 2.97
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.55	■■■□□ 2.96
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		33.46	■■■□□ 2.95
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.37	■■■□□ 2.93
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.28	■■■□□ 2.92
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.27	■■■□□ 2.92
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PTPRG	P23470	1445 aa		33.2	■■■□□ 2.91
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.18	■■■□□ 2.9
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.17	■■■□□ 2.9
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.15	■■■□□ 2.9
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.13	■■■□□ 2.89
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.04	■■■□□ 2.88
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	EEA1	Q15075	1411 aa		33.03	■■■□□ 2.88
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.02	■■■□□ 2.88
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		32.97	■■■□□ 2.87
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.96	■■■□□ 2.87
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.94	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.93	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.92	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.91	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.9	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.89	■■■□□ 2.86
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.87	■■■□□ 2.85
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KIAA0556	O60303	1618 aa		32.83	■■■□□ 2.85
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		32.79	■■■□□ 2.84
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.74	■■■□□ 2.83
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.71	■■■□□ 2.83
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.71	■■■□□ 2.83
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.69	■■■□□ 2.82
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.69	■■■□□ 2.82
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.68	■■■□□ 2.82
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ABCA8	O94911	1581 aa		32.54	■■■□□ 2.8
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KIF21B	O75037	1637 aa		32.54	■■■□□ 2.8
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	GLI2	P10070	1586 aa		32.52	■■■□□ 2.8
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.47	■■■□□ 2.79
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.46	■■■□□ 2.79
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.44	■■■□□ 2.78
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.44	■■■□□ 2.78
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.39	■■■□□ 2.78
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ATP10B	O94823	1461 aa		32.38	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.37	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.34	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.33	■■■□□ 2.77
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.31	■■■□□ 2.76
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KDM6B	O15054	1643 aa		32.29	■■■□□ 2.76
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.28	■■■□□ 2.76
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.26	■■■□□ 2.75
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.24	■■■□□ 2.75
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.22	■■■□□ 2.75
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.19	■■■□□ 2.74
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.15	■■■□□ 2.74
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.12	■■■□□ 2.73
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.1	■■■□□ 2.73
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.07	■■■□□ 2.72
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		31.98	■■■□□ 2.71
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.92	■■■□□ 2.7
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		31.92	■■■□□ 2.7
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	NEO1	Q92859	1461 aa		31.91	■■■□□ 2.7
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.87	■■■□□ 2.69
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CLIP1	P30622	1438 aa		31.86	■■■□□ 2.69
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.82	■■■□□ 2.68
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		31.82	■■■□□ 2.68
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	31.8	■■■□□ 2.68
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.75	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FANCA	O15360	1455 aa		31.74	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PLCH2	O75038	1416 aa		31.74	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.73	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		31.71	■■■□□ 2.67
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.67	■■■□□ 2.66
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.66	■■■□□ 2.66
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.66	■■■□□ 2.66
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.62	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.59	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.58	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	KIF14	Q15058	1648 aa		31.58	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.58	■■■□□ 2.65
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.5	■■■□□ 2.63
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		31.49	■■■□□ 2.63
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.48	■■■□□ 2.63
EIF4ENIF1-208	ENST00000423097	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.47	■■■□□ 2.63

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