RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422806.1

NKX1-1-201, Transcript of NK1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NKX1-1, Length 1,236 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1-201ENST00000422806 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.34■■■■■ 5.49
NKX1-1-201ENST00000422806 CUL7Q14999 1698 aa49.22■■■■■ 5.47
NKX1-1-201ENST00000422806 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.15■■■■■ 5.46
NKX1-1-201ENST00000422806 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa49.1■■■■■ 5.45
NKX1-1-201ENST00000422806 KIF13AQ9H1H9 1805 aa48.92■■■■■ 5.42
NKX1-1-201ENST00000422806 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP48.9■■■■■ 5.42
NKX1-1-201ENST00000422806 MAPKBP1O60336 1514 aa48.87■■■■■ 5.41
NKX1-1-201ENST00000422806 ADCY10Q96PN6 1610 aa48.83■■■■■ 5.41
NKX1-1-201ENST00000422806 ABCC10Q5T3U5 1492 aa48.81■■■■■ 5.4
NKX1-1-201ENST00000422806 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.79■■■■■ 5.4
NKX1-1-201ENST00000422806 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.75■■■■■ 5.4
NKX1-1-201ENST00000422806 FAM69CQ0P6D2 419 aa48.71■■■■■ 5.39
NKX1-1-201ENST00000422806 DIP2BQ9P265 1576 aa48.66■■■■■ 5.38
NKX1-1-201ENST00000422806 PTPRGP23470 1445 aa48.65■■■■■ 5.38
NKX1-1-201ENST00000422806 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa48.64■■■■■ 5.38
NKX1-1-201ENST00000422806 IQGAP2Q13576 1575 aa48.6■■■■■ 5.37
NKX1-1-201ENST00000422806 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.58■■■■■ 5.37
NKX1-1-201ENST00000422806 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP48.5■■■■■ 5.35
NKX1-1-201ENST00000422806 ABCC2Q92887 1545 aa48.42■■■■■ 5.34
NKX1-1-201ENST00000422806 PRXQ9BXM0 1461 aa48.38■■■■■ 5.34
NKX1-1-201ENST00000422806 DISP1Q96F81 1524 aa48.36■■■■■ 5.33
NKX1-1-201ENST00000422806 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.35■■■■■ 5.33
NKX1-1-201ENST00000422806 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa48.35■■■■■ 5.33
NKX1-1-201ENST00000422806 UGGT2Q9NYU1 1516 aa48.32■■■■■ 5.33
NKX1-1-201ENST00000422806 UACAQ9BZF9 1416 aa48.29■■■■■ 5.32
NKX1-1-201ENST00000422806 PLB1Q6P1J6 1458 aa48.26■■■■■ 5.32
NKX1-1-201ENST00000422806 KDM6BO15054 1643 aa48.25■■■■■ 5.32
NKX1-1-201ENST00000422806 ASXL2Q76L83 1435 aa48.24■■■■■ 5.31
NKX1-1-201ENST00000422806 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa48.23■■■■■ 5.31
NKX1-1-201ENST00000422806 TSPOAP1O95153 1857 aa48.19■■■■■ 5.31
NKX1-1-201ENST00000422806 EEA1Q15075 1411 aa48.19■■■■■ 5.31
NKX1-1-201ENST00000422806 KIAA0556O60303 1618 aa48.16■■■■■ 5.3
NKX1-1-201ENST00000422806 GLI2P10070 1586 aa48.15■■■■■ 5.3
NKX1-1-201ENST00000422806 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
NKX1-1-201ENST00000422806 KDM5BQ9UGL1 1544 aa48.12■■■■■ 5.29
NKX1-1-201ENST00000422806 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.1■■■■■ 5.29
NKX1-1-201ENST00000422806 GOLGA3Q08378 1498 aa48.04■■■■■ 5.28
NKX1-1-201ENST00000422806 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
NKX1-1-201ENST00000422806 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
NKX1-1-201ENST00000422806 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
NKX1-1-201ENST00000422806 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa47.83■■■■■ 5.25
NKX1-1-201ENST00000422806 P3H3Q8IVL6 736 aa47.82■■■■■ 5.25
NKX1-1-201ENST00000422806 TEX14Q8IWB6 1497 aa47.78■■■■■ 5.24
NKX1-1-201ENST00000422806 WDR7Q9Y4E6 1490 aa47.78■■■■■ 5.24
NKX1-1-201ENST00000422806 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa47.76■■■■■ 5.24
NKX1-1-201ENST00000422806 ABCA8O94911 1581 aa47.73■■■■■ 5.23
NKX1-1-201ENST00000422806 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
NKX1-1-201ENST00000422806 KIF21BO75037 1637 aa47.67■■■■■ 5.22
NKX1-1-201ENST00000422806 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
NKX1-1-201ENST00000422806 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.62■■■■■ 5.21
NKX1-1-201ENST00000422806 SAMD9Q5K651 1589 aa47.56■■■■■ 5.2
NKX1-1-201ENST00000422806 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
NKX1-1-201ENST00000422806 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa47.49■■■■■ 5.19
NKX1-1-201ENST00000422806 CFAP43Q8NDM7 1665 aa47.48■■■■■ 5.19
NKX1-1-201ENST00000422806 CD109Q6YHK3 1445 aa47.47■■■■■ 5.19
NKX1-1-201ENST00000422806 ARID3CA6NKF2 412 aa47.45■■■■■ 5.19
NKX1-1-201ENST00000422806 ADGRL1O94910 1474 aa47.41■■■■■ 5.18
NKX1-1-201ENST00000422806 KCNH8Q96L42 1107 aa47.41■■■■■ 5.18
NKX1-1-201ENST00000422806 FHOD3Q2V2M9 1422 aa47.38■■■■■ 5.17
NKX1-1-201ENST00000422806 ATP10BO94823 1461 aa47.31■■■■■ 5.16
NKX1-1-201ENST00000422806 EFCAB5A4FU69 1503 aa47.29■■■■■ 5.16
NKX1-1-201ENST00000422806 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa47.28■■■■■ 5.16
NKX1-1-201ENST00000422806 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
NKX1-1-201ENST00000422806 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
NKX1-1-201ENST00000422806 ABCA9Q8IUA7 1624 aa47.11■■■■■ 5.13
NKX1-1-201ENST00000422806 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.1■■■■■ 5.13
NKX1-1-201ENST00000422806 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
NKX1-1-201ENST00000422806 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.07■■■■■ 5.13
NKX1-1-201ENST00000422806 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.99■■■■■ 5.11
NKX1-1-201ENST00000422806 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.97■■■■■ 5.11
NKX1-1-201ENST00000422806 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP46.96■■■■■ 5.11
NKX1-1-201ENST00000422806 FMN1Q68DA7 1419 aa46.94■■■■■ 5.1
NKX1-1-201ENST00000422806 NEO1Q92859 1461 aa46.93■■■■■ 5.1
NKX1-1-201ENST00000422806 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.77■■■■■ 5.08
NKX1-1-201ENST00000422806 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP46.74■■■■■ 5.07
NKX1-1-201ENST00000422806 RAPGEF3O95398 923 aa46.73■■■■■ 5.07
NKX1-1-201ENST00000422806 HECW1Q76N89 1606 aa46.72■■■■■ 5.07
NKX1-1-201ENST00000422806 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.66■■■■■ 5.06
NKX1-1-201ENST00000422806 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
NKX1-1-201ENST00000422806 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
NKX1-1-201ENST00000422806 CLIP1P30622 1438 aa46.59■■■■■ 5.05
NKX1-1-201ENST00000422806 CFAP74Q9C0B2 1584 aa46.58■■■■■ 5.05
NKX1-1-201ENST00000422806 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.04
NKX1-1-201ENST00000422806 FANCAO15360 1455 aa46.56■■■■■ 5.04
NKX1-1-201ENST00000422806 AKNAQ7Z591 1439 aa46.54■■■■■ 5.04
NKX1-1-201ENST00000422806 ADAMTSL3P82987 1691 aa46.53■■■■■ 5.04
NKX1-1-201ENST00000422806 TTC37Q6PGP7 1564 aa46.51■■■■■ 5.04
NKX1-1-201ENST00000422806 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.49■■■■■ 5.03
NKX1-1-201ENST00000422806 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.47■■■■■ 5.03
NKX1-1-201ENST00000422806 PTPRMP28827 1452 aa46.46■■■■■ 5.03
NKX1-1-201ENST00000422806 RICTORQ6R327 1708 aa46.46■■■■■ 5.03
NKX1-1-201ENST00000422806 BCORL1Q5H9F3 1711 aa46.42■■■■■ 5.02
NKX1-1-201ENST00000422806 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
NKX1-1-201ENST00000422806 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
NKX1-1-201ENST00000422806 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.38■■■■■ 5.02
NKX1-1-201ENST00000422806 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
NKX1-1-201ENST00000422806 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa46.37■■■■■ 5.01
NKX1-1-201ENST00000422806 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
NKX1-1-201ENST00000422806 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.35■■■■■ 5.01
NKX1-1-201ENST00000422806 PLCH2O75038 1416 aa46.34■■■■■ 5.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms