RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADGRL1O94910 1474 aa16.11■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DIP2BQ9P265 1576 aa16.11■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.1■□□□□ 0.17
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.05■□□□□ 0.16
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.05■□□□□ 0.16
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TSPOAP1O95153 1857 aa16■□□□□ 0.15
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LMTK3Q96Q04 1460 aa16■□□□□ 0.15
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADAMTS12P58397 1594 aa16■□□□□ 0.15
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.94■□□□□ 0.14
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SOCS7O14512 581 aa15.93■□□□□ 0.14
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.88■□□□□ 0.13
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.85■□□□□ 0.13
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TOP2BQ02880 1626 aa15.85■□□□□ 0.13
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GLI2P10070 1586 aa15.83■□□□□ 0.13
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTPRGP23470 1445 aa15.81■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ASXL2Q76L83 1435 aa15.8■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.79■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ILDR2Q71H61 639 aa15.79■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.78■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.77■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCC2Q92887 1545 aa15.77■□□□□ 0.11
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.75■□□□□ 0.11
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.7■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.68■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CERKQ8TCT0 537 aa15.67■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.65■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.65■□□□□ 0.1
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UACAQ9BZF9 1416 aa15.63■□□□□ 0.09
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTPRMP28827 1452 aa15.62■□□□□ 0.09
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.61■□□□□ 0.09
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.58■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CUL7Q14999 1698 aa15.57■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CD109Q6YHK3 1445 aa15.56■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.54■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGF1RP08069 1367 aa15.54■□□□□ 0.08
RTCA-AS1-201ENST00000421185 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.51■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIF21BO75037 1637 aa15.5■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.49■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HSPA2P54652 639 aa15.49■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNH8Q96L42 1107 aa15.49■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.45■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.44■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.44■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIF27Q86VH2 1401 aa15.43■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.43■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.41■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.41■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DISP1Q96F81 1524 aa15.41■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IQGAP2Q13576 1575 aa15.4■□□□□ 0.06
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAPGEF3O95398 923 aa15.37■□□□□ 0.05
RTCA-AS1-201ENST00000421185 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.36■□□□□ 0.05
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MADDQ8WXG6 1647 aa15.35■□□□□ 0.05
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.34■□□□□ 0.05
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.3■□□□□ 0.04
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.29■□□□□ 0.04
RTCA-AS1-201ENST00000421185 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.29■□□□□ 0.04
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NEO1Q92859 1461 aa15.26■□□□□ 0.03
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIAA0556O60303 1618 aa15.25■□□□□ 0.03
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FANCAO15360 1455 aa15.2■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.19■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCA8O94911 1581 aa15.19■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 AKNAQ7Z591 1439 aa15.18■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GOLGA3Q08378 1498 aa15.18■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MLECQ14165 292 aa15.17■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTPRTO14522 1441 aa15.17■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.16■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.15■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.15■□□□□ 0.02
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.14■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ARID3CA6NKF2 412 aa15.13■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.13■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.12■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ATP10BO94823 1461 aa15.12■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.1■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.1■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.1■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 STRCQ7RTU9 1775 aa15.09■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.09■□□□□ 0.01
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.08■□□□□ 0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.07■□□□□ 0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.05■□□□□ -0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.04■□□□□ -0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.03■□□□□ -0
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms