RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417295.6

SH3GL1-202, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3GL1, Length 1,404 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-202ENST00000417295 SHROOM2Q13796 1616 aa48.12■■■■■ 5.29
SH3GL1-202ENST00000417295 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa48.11■■■■■ 5.29
SH3GL1-202ENST00000417295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.11■■■■■ 5.29
SH3GL1-202ENST00000417295 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.09■■■■■ 5.29
SH3GL1-202ENST00000417295 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.02■■■■■ 5.28
SH3GL1-202ENST00000417295 PRXQ9BXM0 1461 aa47.98■■■■■ 5.27
SH3GL1-202ENST00000417295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.95■■■■■ 5.27
SH3GL1-202ENST00000417295 EEA1Q15075 1411 aa47.9■■■■■ 5.26
SH3GL1-202ENST00000417295 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.85■■■■■ 5.25
SH3GL1-202ENST00000417295 IQGAP2Q13576 1575 aa47.78■■■■■ 5.24
SH3GL1-202ENST00000417295 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.56■■■■■ 5.2
SH3GL1-202ENST00000417295 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.55■■■■■ 5.2
SH3GL1-202ENST00000417295 DISP1Q96F81 1524 aa47.52■■■■■ 5.2
SH3GL1-202ENST00000417295 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.5■■■■■ 5.2
SH3GL1-202ENST00000417295 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.45■■■■■ 5.19
SH3GL1-202ENST00000417295 PTPRGP23470 1445 aa47.43■■■■■ 5.18
SH3GL1-202ENST00000417295 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.43■■■■■ 5.18
SH3GL1-202ENST00000417295 KIF21BO75037 1637 aa47.38■■■■■ 5.18
SH3GL1-202ENST00000417295 KIAA0556O60303 1618 aa47.33■■■■■ 5.17
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SH3GL1-202ENST00000417295 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.28■■■■■ 5.16
SH3GL1-202ENST00000417295 GOLGA3Q08378 1498 aa47.25■■■■■ 5.15
SH3GL1-202ENST00000417295 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.24■■■■■ 5.15
SH3GL1-202ENST00000417295 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.13■■■■■ 5.13
SH3GL1-202ENST00000417295 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
SH3GL1-202ENST00000417295 UACAQ9BZF9 1416 aa47.1■■■■■ 5.13
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SH3GL1-202ENST00000417295 P3H3Q8IVL6 736 aa47.1■■■■■ 5.13
SH3GL1-202ENST00000417295 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.03■■■■■ 5.12
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SH3GL1-202ENST00000417295 ABCC2Q92887 1545 aa46.98■■■■■ 5.11
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SH3GL1-202ENST00000417295 MAPKBP1O60336 1514 aa46.93■■■■■ 5.1
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SH3GL1-202ENST00000417295 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.77■■■■■ 5.08
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.75■■■■■ 5.07
SH3GL1-202ENST00000417295 ASXL2Q76L83 1435 aa46.72■■■■■ 5.07
SH3GL1-202ENST00000417295 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.71■■■■■ 5.07
SH3GL1-202ENST00000417295 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
SH3GL1-202ENST00000417295 DIP2BQ9P265 1576 aa46.64■■■■■ 5.06
SH3GL1-202ENST00000417295 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.63■■■■■ 5.06
SH3GL1-202ENST00000417295 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.63■■■■■ 5.05
SH3GL1-202ENST00000417295 ARID3CA6NKF2 412 aa46.6■■■■■ 5.05
SH3GL1-202ENST00000417295 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.54■■■■■ 5.04
SH3GL1-202ENST00000417295 ATP10BO94823 1461 aa46.51■■■■■ 5.04
SH3GL1-202ENST00000417295 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.46■■■■■ 5.03
SH3GL1-202ENST00000417295 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.45■■■■■ 5.03
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SH3GL1-202ENST00000417295 GLI2P10070 1586 aa46.36■■■■■ 5.01
SH3GL1-202ENST00000417295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.34■■■■■ 5.01
SH3GL1-202ENST00000417295 CLIP1P30622 1438 aa46.34■■■■■ 5.01
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SH3GL1-202ENST00000417295 CEP162Q5TB80 1403 aa46.13■■■■■ 4.97
SH3GL1-202ENST00000417295 HECW1Q76N89 1606 aa46.11■■■■■ 4.97
SH3GL1-202ENST00000417295 PLEKHD1A6NEE1 506 aa46.1■■■■■ 4.97
SH3GL1-202ENST00000417295 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.07■■■■■ 4.97
SH3GL1-202ENST00000417295 CD109Q6YHK3 1445 aa46.06■■■■■ 4.96
SH3GL1-202ENST00000417295 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa46.04■■■■■ 4.96
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SH3GL1-202ENST00000417295 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.95■■■■■ 4.95
SH3GL1-202ENST00000417295 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.94■■■■■ 4.94
SH3GL1-202ENST00000417295 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.92■■■■■ 4.94
SH3GL1-202ENST00000417295 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.91■■■■■ 4.94
SH3GL1-202ENST00000417295 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.89■■■■■ 4.94
SH3GL1-202ENST00000417295 KDM6BO15054 1643 aa45.88■■■■■ 4.93
SH3GL1-202ENST00000417295 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.86■■■■■ 4.93
SH3GL1-202ENST00000417295 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.86■■■■■ 4.93
SH3GL1-202ENST00000417295 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.81■■■■■ 4.92
SH3GL1-202ENST00000417295 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
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SH3GL1-202ENST00000417295 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.68■■■■■ 4.9
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SH3GL1-202ENST00000417295 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.56■■■■■ 4.88
SH3GL1-202ENST00000417295 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.55■■■■■ 4.88
SH3GL1-202ENST00000417295 PLCH2O75038 1416 aa45.52■■■■■ 4.88
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SH3GL1-202ENST00000417295 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.35■■■■■ 4.85
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SH3GL1-202ENST00000417295 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
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SH3GL1-202ENST00000417295 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.24■■■■■ 4.83
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