RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.72■■□□□ 1.55
HPS1-205ENST00000414009 ADAMTS12P58397 1594 aa24.71■■□□□ 1.55
HPS1-205ENST00000414009 IGF1RP08069 1367 aa24.67■■□□□ 1.54
HPS1-205ENST00000414009 CUL7Q14999 1698 aa24.65■■□□□ 1.54
HPS1-205ENST00000414009 GRIN2AQ12879 1464 aa24.63■■□□□ 1.53
HPS1-205ENST00000414009 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.62■■□□□ 1.53
HPS1-205ENST00000414009 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.6■■□□□ 1.53
HPS1-205ENST00000414009 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HPS1-205ENST00000414009 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.57■■□□□ 1.52
HPS1-205ENST00000414009 EEA1Q15075 1411 aa24.52■■□□□ 1.52
HPS1-205ENST00000414009 NUP160Q12769 1436 aa24.48■■□□□ 1.51
HPS1-205ENST00000414009 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.48■■□□□ 1.51
HPS1-205ENST00000414009 CEP170Q5SW79 1584 aa24.47■■□□□ 1.51
HPS1-205ENST00000414009 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.46■■□□□ 1.51
HPS1-205ENST00000414009 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.45■■□□□ 1.51
HPS1-205ENST00000414009 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF11O15085 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 PRXQ9BXM0 1461 aa24.36■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.35■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.34■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
HPS1-205ENST00000414009 JPH4Q96JJ6 628 aa24.29■■□□□ 1.48
HPS1-205ENST00000414009 SHROOM2Q13796 1616 aa24.27■■□□□ 1.48
HPS1-205ENST00000414009 IQGAP2Q13576 1575 aa24.24■■□□□ 1.47
HPS1-205ENST00000414009 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HPS1-205ENST00000414009 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.21■■□□□ 1.47
HPS1-205ENST00000414009 KIF21BO75037 1637 aa24.21■■□□□ 1.47
HPS1-205ENST00000414009 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.19■■□□□ 1.46
HPS1-205ENST00000414009 ARAP1Q96P48 1450 aa24.16■■□□□ 1.46
HPS1-205ENST00000414009 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.14■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.14■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.12■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 GOLGA3Q08378 1498 aa24.12■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 RNF39Q9H2S5 420 aa24.1■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.08■■□□□ 1.45
HPS1-205ENST00000414009 KCNA4P22459 653 aa24.06■■□□□ 1.44
HPS1-205ENST00000414009 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.01■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 DISP1Q96F81 1524 aa24■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 PTPRGP23470 1445 aa23.99■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 KIAA0556O60303 1618 aa23.98■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
HPS1-205ENST00000414009 P3H3Q8IVL6 736 aa23.89■■□□□ 1.41
HPS1-205ENST00000414009 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
HPS1-205ENST00000414009 SAMD9Q5K651 1589 aa23.86■■□□□ 1.41
HPS1-205ENST00000414009 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.85■■□□□ 1.41
HPS1-205ENST00000414009 UACAQ9BZF9 1416 aa23.81■■□□□ 1.4
HPS1-205ENST00000414009 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.78■■□□□ 1.4
HPS1-205ENST00000414009 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.76■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.75■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 ABCC2Q92887 1545 aa23.74■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.72■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.72■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HPS1-205ENST00000414009 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.7■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 ABCA8O94911 1581 aa23.69■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 CLIP1P30622 1438 aa23.68■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 FMN1Q68DA7 1419 aa23.66■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.64■■□□□ 1.38
HPS1-205ENST00000414009 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 MAPKBP1O60336 1514 aa23.62■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 CEP162Q5TB80 1403 aa23.6■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HPS1-205ENST00000414009 ARID3CA6NKF2 412 aa23.57■■□□□ 1.36
HPS1-205ENST00000414009 ASXL2Q76L83 1435 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS1-205ENST00000414009 ATP10BO94823 1461 aa23.51■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 HECW1Q76N89 1606 aa23.51■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.49■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.49■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.47■■□□□ 1.35
HPS1-205ENST00000414009 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.45■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 DIP2BQ9P265 1576 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.44■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 KCNH8Q96L42 1107 aa23.41■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HPS1-205ENST00000414009 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HPS1-205ENST00000414009 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.38■■□□□ 1.33
HPS1-205ENST00000414009 GLI2P10070 1586 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS1-205ENST00000414009 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.31■■□□□ 1.32
HPS1-205ENST00000414009 TSPOAP1O95153 1857 aa23.3■■□□□ 1.32
HPS1-205ENST00000414009 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.3■■□□□ 1.32
HPS1-205ENST00000414009 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HPS1-205ENST00000414009 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.26■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.26■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 CD109Q6YHK3 1445 aa23.25■■□□□ 1.31
HPS1-205ENST00000414009 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
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