RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
SUMO3-204ENST00000411651 TIAM1Q13009 1591 aa30.56■■■□□ 2.48
SUMO3-204ENST00000411651 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.483e-7■■■□□ 16.9
SUMO3-204ENST00000411651 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
SUMO3-204ENST00000411651 PBRM1Q86U86 1689 aa30.52■■■□□ 2.48
SUMO3-204ENST00000411651 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
SUMO3-204ENST00000411651 IFT140Q96RY7 1462 aa30.5■■■□□ 2.47
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.48■■■□□ 2.47
SUMO3-204ENST00000411651 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.48■■■□□ 2.47
SUMO3-204ENST00000411651 SAMD9Q5K651 1589 aa30.47■■■□□ 2.47
SUMO3-204ENST00000411651 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.43■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 FMN1Q68DA7 1419 aa30.43■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS12P58397 1594 aa30.42■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 GRIN2BQ13224 1484 aa30.42■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.41■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.39■■■□□ 2.46
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SUMO3-204ENST00000411651 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.33■■■□□ 2.45
SUMO3-204ENST00000411651 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
SUMO3-204ENST00000411651 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.3■■■□□ 2.44
SUMO3-204ENST00000411651 ERCC6Q03468 1493 aa30.28■■■□□ 2.44
SUMO3-204ENST00000411651 IQGAP2Q13576 1575 aa30.24■■■□□ 2.43
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
SUMO3-204ENST00000411651 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.21■■■□□ 2.43
SUMO3-204ENST00000411651 P3H3Q8IVL6 736 aa30.21■■■□□ 2.43
SUMO3-204ENST00000411651 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
SUMO3-204ENST00000411651 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.15■■■□□ 2.42
SUMO3-204ENST00000411651 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.422e-6■■■■■ 39.8
SUMO3-204ENST00000411651 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.12■■■□□ 2.41
SUMO3-204ENST00000411651 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.08■■■□□ 2.41
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.06■■■□□ 2.4
SUMO3-204ENST00000411651 GRIN2AQ12879 1464 aa30.05■■■□□ 2.4
SUMO3-204ENST00000411651 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.02■■■□□ 2.4
SUMO3-204ENST00000411651 HECW1Q76N89 1606 aa30.02■■■□□ 2.4
SUMO3-204ENST00000411651 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
SUMO3-204ENST00000411651 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.01■■■□□ 2.39
SUMO3-204ENST00000411651 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SUMO3-204ENST00000411651 SYNJ2O15056 1496 aa29.97■■■□□ 2.39
SUMO3-204ENST00000411651 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.96■■■□□ 2.39
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0556O60303 1618 aa29.92■■■□□ 2.38
SUMO3-204ENST00000411651 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SUMO3-204ENST00000411651 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.9■■■□□ 2.38
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF11O15085 1522 aa29.9■■■□□ 2.38
SUMO3-204ENST00000411651 DISP1Q96F81 1524 aa29.88■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.87■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 NCOA2Q15596 1464 aa29.86■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 NUP160Q12769 1436 aa29.83■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.83■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.83■■■□□ 2.37
SUMO3-204ENST00000411651 CEP170Q5SW79 1584 aa29.81■■■□□ 2.36
SUMO3-204ENST00000411651 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SUMO3-204ENST00000411651 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.78■■■□□ 2.36
SUMO3-204ENST00000411651 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SUMO3-204ENST00000411651 ITGAEP38570 1179 aa29.74■■■□□ 2.35
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
SUMO3-204ENST00000411651 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.71■■■□□ 2.35
SUMO3-204ENST00000411651 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SUMO3-204ENST00000411651 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.67■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 MIA2Q96PC5 1412 aa29.67■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.66■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 MAPKBP1O60336 1514 aa29.65■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SUMO3-204ENST00000411651 HFM1A2PYH4 1435 aa29.64■■■□□ 2.33
SUMO3-204ENST00000411651 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SUMO3-204ENST00000411651 AKNAQ7Z591 1439 aa29.56■■■□□ 2.32
SUMO3-204ENST00000411651 JPH4Q96JJ6 628 aa29.54■■■□□ 2.32
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRKQ15262 1439 aa29.54■■■□□ 2.32
SUMO3-204ENST00000411651 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
SUMO3-204ENST00000411651 FBLN2P98095 1184 aa29.49■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 NAIPQ13075 1403 aa29.48■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.47■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.46■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 UACAQ9BZF9 1416 aa29.45■■■□□ 2.31
SUMO3-204ENST00000411651 ABCA8O94911 1581 aa29.45■■■□□ 2.3
SUMO3-204ENST00000411651 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.44■■■□□ 2.3
SUMO3-204ENST00000411651 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.43■■■□□ 2.3
SUMO3-204ENST00000411651 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SUMO3-204ENST00000411651 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.37■■■□□ 2.29
SUMO3-204ENST00000411651 CHD1O14646 1710 aa29.35■■■□□ 2.29
SUMO3-204ENST00000411651 SHROOM2Q13796 1616 aa29.34■■■□□ 2.29
SUMO3-204ENST00000411651 ROCK1Q13464 1354 aa29.34■■■□□ 2.29
SUMO3-204ENST00000411651 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SUMO3-204ENST00000411651 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SUMO3-204ENST00000411651 DAPK1P53355 1430 aa29.28■■■□□ 2.28
SUMO3-204ENST00000411651 ARID3CA6NKF2 412 aa29.26■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 ATP10BO94823 1461 aa29.23■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 KIF14Q15058 1648 aa29.22■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC5O15440 1437 aa29.22■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRGP23470 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
SUMO3-204ENST00000411651 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.18■■■□□ 2.26
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.16■■■□□ 2.26
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.16■■■□□ 2.26
SUMO3-204ENST00000411651 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.14■■■□□ 2.26
SUMO3-204ENST00000411651 ADGRL2O95490 1459 aa29.12■■■□□ 2.25
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