RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PBRM1Q86U86 1689 aa30.3■■■□□ 2.44
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.2■■■□□ 2.43
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GRIN2BQ13224 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
RAB11FIP4-201ENST00000394744 P3H3Q8IVL6 736 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ADAMTS12P58397 1594 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TIAM1Q13009 1591 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAP3K1Q13233 1512 aa30.06■■■□□ 2.4
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SAMD9Q5K651 1589 aa29.94■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.93■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.93■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.93■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.92■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SYNJ2O15056 1496 aa29.9■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FMN1Q68DA7 1419 aa29.89■■■□□ 2.38
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.87■■■□□ 2.37
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GRIN2AQ12879 1464 aa29.86■■■□□ 2.37
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FBLN2P98095 1184 aa29.8■■■□□ 2.36
RAB11FIP4-201ENST00000394744 IQGAP2Q13576 1575 aa29.78■■■□□ 2.36
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHD1O14646 1710 aa29.78■■■□□ 2.36
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.76■■■□□ 2.35
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CEP170Q5SW79 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUP160Q12769 1436 aa29.66■■■□□ 2.34
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITGAEP38570 1179 aa29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.64■■■□□ 2.34
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.63■■■□□ 2.33
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.61■■■□□ 2.33
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.58■■■□□ 2.33
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HECW1Q76N89 1606 aa29.51■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.5■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DISP1Q96F81 1524 aa29.49■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIAA0556O60303 1618 aa29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.31
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NCOA2Q15596 1464 aa29.45■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.42■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4-201ENST00000394744 JPH4Q96JJ6 628 aa29.37■■■□□ 2.29
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGEF11O15085 1522 aa29.35■■■□□ 2.29
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SHROOM2Q13796 1616 aa29.34■■■□□ 2.29
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARID3CA6NKF2 412 aa29.3■■■□□ 2.28
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.27■■■□□ 2.28
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OSCARQ8IYS5 282 aa29.26■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.23■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.22■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PTPRKQ15262 1439 aa29.21■■■□□ 2.27
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MAPKBP1O60336 1514 aa29.2■■■□□ 2.26
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.15■■■□□ 2.26
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HFM1A2PYH4 1435 aa29.11■■■□□ 2.25
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MIA2Q96PC5 1412 aa29.1■■■□□ 2.25
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NAIPQ13075 1403 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PTPRGP23470 1445 aa29■■■□□ 2.23
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ABCA8O94911 1581 aa28.99■■■□□ 2.23
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.95■■■□□ 2.23
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 UACAQ9BZF9 1416 aa28.93■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.92■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AKNAQ7Z591 1439 aa28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.9■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.89■■■□□ 2.22
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KIF14Q15058 1648 aa28.89■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NEUROD1Q13562 356 aa28.88■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATP10BO94823 1461 aa28.87■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DAPK1P53355 1430 aa28.86■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.83■■■□□ 2.21
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ABCC5O15440 1437 aa28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms