RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393928.5

P3H4-202, Transcript of prolyl 3-hydroxylase family member 4 (non-enzymatic), humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H4, Length 2,601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4-202ENST00000393928 PBRM1Q86U86 1689 aa29.62■■■□□ 2.33
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P3H4-202ENST00000393928 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.54■■■□□ 2.32
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P3H4-202ENST00000393928 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.51■■■□□ 2.32
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P3H4-202ENST00000393928 ADAMTS12P58397 1594 aa29.47■■■□□ 2.31
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P3H4-202ENST00000393928 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.19■■■□□ 2.26
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P3H4-202ENST00000393928 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.02■■■□□ 2.24
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P3H4-202ENST00000393928 NUP160Q12769 1436 aa28.96■■■□□ 2.23
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P3H4-202ENST00000393928 KIAA0556O60303 1618 aa28.94■■■□□ 2.22
P3H4-202ENST00000393928 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.94■■■□□ 2.22
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P3H4-202ENST00000393928 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
P3H4-202ENST00000393928 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
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P3H4-202ENST00000393928 CHD1O14646 1710 aa28.81■■■□□ 2.2
P3H4-202ENST00000393928 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.77■■■□□ 2.2
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P3H4-202ENST00000393928 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.57■■■□□ 2.16
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P3H4-202ENST00000393928 PTPRGP23470 1445 aa28.54■■■□□ 2.16
P3H4-202ENST00000393928 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
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P3H4-202ENST00000393928 ATP10BO94823 1461 aa28.44■■■□□ 2.14
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P3H4-202ENST00000393928 DAPK1P53355 1430 aa28.17■■■□□ 2.1
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P3H4-202ENST00000393928 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.15■■■□□ 2.1
P3H4-202ENST00000393928 KCNH8Q96L42 1107 aa28.14■■■□□ 2.09
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