RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390604.2

IGHV3-16-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-16, Length 425 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIF27Q86VH2 1401 aa26.14■■□□□ 1.77
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.12■■□□□ 1.77
IGHV3-16-201ENST00000390604 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.08■■□□□ 1.77
IGHV3-16-201ENST00000390604 IGF1RP08069 1367 aa26.05■■□□□ 1.76
IGHV3-16-201ENST00000390604 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.01■■□□□ 1.75
IGHV3-16-201ENST00000390604 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.98■■□□□ 1.75
IGHV3-16-201ENST00000390604 MAPKBP1O60336 1514 aa25.98■■□□□ 1.75
IGHV3-16-201ENST00000390604 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.94■■□□□ 1.74
IGHV3-16-201ENST00000390604 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.93■■□□□ 1.74
IGHV3-16-201ENST00000390604 DIP2BQ9P265 1576 aa25.93■■□□□ 1.74
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.91■■□□□ 1.74
IGHV3-16-201ENST00000390604 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.88■■□□□ 1.73
IGHV3-16-201ENST00000390604 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
IGHV3-16-201ENST00000390604 CUL7Q14999 1698 aa25.84■■□□□ 1.73
IGHV3-16-201ENST00000390604 KDM6BO15054 1643 aa25.82■■□□□ 1.72
IGHV3-16-201ENST00000390604 PTPRGP23470 1445 aa25.81■■□□□ 1.72
IGHV3-16-201ENST00000390604 TSPOAP1O95153 1857 aa25.74■■□□□ 1.71
IGHV3-16-201ENST00000390604 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.73■■□□□ 1.71
IGHV3-16-201ENST00000390604 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.71■■□□□ 1.71
IGHV3-16-201ENST00000390604 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.7■■□□□ 1.71
IGHV3-16-201ENST00000390604 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
IGHV3-16-201ENST00000390604 EEA1Q15075 1411 aa25.69■■□□□ 1.7
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCC2Q92887 1545 aa25.68■■□□□ 1.7
IGHV3-16-201ENST00000390604 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
IGHV3-16-201ENST00000390604 ASXL2Q76L83 1435 aa25.67■■□□□ 1.7
IGHV3-16-201ENST00000390604 PRXQ9BXM0 1461 aa25.64■■□□□ 1.69
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.62■■□□□ 1.69
IGHV3-16-201ENST00000390604 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
IGHV3-16-201ENST00000390604 UACAQ9BZF9 1416 aa25.57■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.56■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 GLI2P10070 1586 aa25.56■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 IQGAP2Q13576 1575 aa25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 ADGRL1O94910 1474 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 DISP1Q96F81 1524 aa25.52■■□□□ 1.68
IGHV3-16-201ENST00000390604 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
IGHV3-16-201ENST00000390604 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.46■■□□□ 1.67
IGHV3-16-201ENST00000390604 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.38■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.38■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.37■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.37■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIF21BO75037 1637 aa25.36■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.34■■□□□ 1.65
IGHV3-16-201ENST00000390604 KIAA0556O60303 1618 aa25.31■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 KCNH8Q96L42 1107 aa25.31■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.31■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.28■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 GOLGA3Q08378 1498 aa25.27■■□□□ 1.64
IGHV3-16-201ENST00000390604 CD109Q6YHK3 1445 aa25.25■■□□□ 1.63
IGHV3-16-201ENST00000390604 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
IGHV3-16-201ENST00000390604 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-16-201ENST00000390604 P3H3Q8IVL6 736 aa25.19■■□□□ 1.62
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARID3CA6NKF2 412 aa25.15■■□□□ 1.62
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCA8O94911 1581 aa25.14■■□□□ 1.61
IGHV3-16-201ENST00000390604 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-16-201ENST00000390604 SAMD9Q5K651 1589 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-16-201ENST00000390604 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.01■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATP10BO94823 1461 aa25■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 RAPGEF3O95398 923 aa24.99■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.96■■□□□ 1.59
IGHV3-16-201ENST00000390604 FBXO41Q8TF61 875 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.93■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.91■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 PTPRMP28827 1452 aa24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
IGHV3-16-201ENST00000390604 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-16-201ENST00000390604 CLIP1P30622 1438 aa24.85■■□□□ 1.57
IGHV3-16-201ENST00000390604 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.83■■□□□ 1.57
IGHV3-16-201ENST00000390604 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.83■■□□□ 1.56
IGHV3-16-201ENST00000390604 FMN1Q68DA7 1419 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-16-201ENST00000390604 NEO1Q92859 1461 aa24.82■■□□□ 1.56
IGHV3-16-201ENST00000390604 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
IGHV3-16-201ENST00000390604 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
IGHV3-16-201ENST00000390604 CEP162Q5TB80 1403 aa24.76■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.75■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 MADDQ8WXG6 1647 aa24.72■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
IGHV3-16-201ENST00000390604 HSPA2P54652 639 aa24.69■■□□□ 1.54
IGHV3-16-201ENST00000390604 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
IGHV3-16-201ENST00000390604 AKNAQ7Z591 1439 aa24.67■■□□□ 1.54
IGHV3-16-201ENST00000390604 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.64■■□□□ 1.54
IGHV3-16-201ENST00000390604 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 HECW1Q76N89 1606 aa24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 FANCAO15360 1455 aa24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 MLECQ14165 292 aa24.59■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.59■■□□□ 1.53
IGHV3-16-201ENST00000390604 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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