RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380305.4

PSMG4-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PSMG4, Length 489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4-202ENST00000380305 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.59■■■■■ 4.73
PSMG4-202ENST00000380305 JPH4Q96JJ6 628 aa44.59■■■■■ 4.73
PSMG4-202ENST00000380305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.59■■■■■ 4.73
PSMG4-202ENST00000380305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.59■■■■■ 4.73
PSMG4-202ENST00000380305 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
PSMG4-202ENST00000380305 PRXQ9BXM0 1461 aa44.41■■■■■ 4.7
PSMG4-202ENST00000380305 EEA1Q15075 1411 aa44.4■■■■■ 4.7
PSMG4-202ENST00000380305 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.39■■■■■ 4.7
PSMG4-202ENST00000380305 IQGAP2Q13576 1575 aa44.32■■■■■ 4.69
PSMG4-202ENST00000380305 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.28■■■■■ 4.68
PSMG4-202ENST00000380305 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.15■■■■■ 4.66
PSMG4-202ENST00000380305 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.13■■■■■ 4.65
PSMG4-202ENST00000380305 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.08■■■■■ 4.65
PSMG4-202ENST00000380305 DISP1Q96F81 1524 aa44.02■■■■■ 4.64
PSMG4-202ENST00000380305 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.99■■■■■ 4.63
PSMG4-202ENST00000380305 PTPRGP23470 1445 aa43.98■■■■■ 4.63
PSMG4-202ENST00000380305 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
PSMG4-202ENST00000380305 KIF21BO75037 1637 aa43.94■■■■■ 4.62
PSMG4-202ENST00000380305 KIAA0556O60303 1618 aa43.91■■■■■ 4.62
PSMG4-202ENST00000380305 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.62
PSMG4-202ENST00000380305 GOLGA3Q08378 1498 aa43.84■■■■■ 4.61
PSMG4-202ENST00000380305 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.82■■■■■ 4.61
PSMG4-202ENST00000380305 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.75■■■■■ 4.59
PSMG4-202ENST00000380305 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.74■■■■■ 4.59
PSMG4-202ENST00000380305 UACAQ9BZF9 1416 aa43.66■■■■■ 4.58
PSMG4-202ENST00000380305 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.61■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 P3H3Q8IVL6 736 aa43.61■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.61■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 SAMD9Q5K651 1589 aa43.58■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC2Q92887 1545 aa43.58■■■■■ 4.57
PSMG4-202ENST00000380305 MAPKBP1O60336 1514 aa43.54■■■■■ 4.56
PSMG4-202ENST00000380305 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.5■■■■■ 4.55
PSMG4-202ENST00000380305 ABCA8O94911 1581 aa43.43■■■■■ 4.54
PSMG4-202ENST00000380305 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.41■■■■■ 4.54
PSMG4-202ENST00000380305 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.39■■■■■ 4.54
PSMG4-202ENST00000380305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.37■■■■■ 4.53
PSMG4-202ENST00000380305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.37■■■■■ 4.53
PSMG4-202ENST00000380305 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.34■■■■■ 4.53
PSMG4-202ENST00000380305 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
PSMG4-202ENST00000380305 ASXL2Q76L83 1435 aa43.31■■■■■ 4.52
PSMG4-202ENST00000380305 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.31■■■■■ 4.52
PSMG4-202ENST00000380305 DIP2BQ9P265 1576 aa43.29■■■■■ 4.52
PSMG4-202ENST00000380305 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.19■■■■■ 4.51
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.18■■■■■ 4.5
PSMG4-202ENST00000380305 ARID3CA6NKF2 412 aa43.15■■■■■ 4.5
PSMG4-202ENST00000380305 ATP10BO94823 1461 aa43.08■■■■■ 4.49
PSMG4-202ENST00000380305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.08■■■■■ 4.49
PSMG4-202ENST00000380305 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
PSMG4-202ENST00000380305 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
PSMG4-202ENST00000380305 GLI2P10070 1586 aa43.03■■■■■ 4.48
PSMG4-202ENST00000380305 FMN1Q68DA7 1419 aa43■■■■■ 4.47
PSMG4-202ENST00000380305 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
PSMG4-202ENST00000380305 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
PSMG4-202ENST00000380305 TSPOAP1O95153 1857 aa42.94■■■■■ 4.46
PSMG4-202ENST00000380305 CLIP1P30622 1438 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMG4-202ENST00000380305 KCNH8Q96L42 1107 aa42.92■■■■■ 4.46
PSMG4-202ENST00000380305 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
PSMG4-202ENST00000380305 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.83■■■■■ 4.45
PSMG4-202ENST00000380305 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.81■■■■■ 4.44
PSMG4-202ENST00000380305 HECW1Q76N89 1606 aa42.8■■■■■ 4.44
PSMG4-202ENST00000380305 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
PSMG4-202ENST00000380305 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
PSMG4-202ENST00000380305 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.73■■■■■ 4.43
PSMG4-202ENST00000380305 CEP162Q5TB80 1403 aa42.71■■■■■ 4.43
PSMG4-202ENST00000380305 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.7■■■■■ 4.43
PSMG4-202ENST00000380305 CD109Q6YHK3 1445 aa42.7■■■■■ 4.43
PSMG4-202ENST00000380305 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PSMG4-202ENST00000380305 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.66■■■■■ 4.42
PSMG4-202ENST00000380305 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.66■■■■■ 4.42
PSMG4-202ENST00000380305 KDM6BO15054 1643 aa42.63■■■■■ 4.41
PSMG4-202ENST00000380305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.6■■■■■ 4.41
PSMG4-202ENST00000380305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.6■■■■■ 4.41
PSMG4-202ENST00000380305 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.55■■■■■ 4.4
PSMG4-202ENST00000380305 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.55■■■■■ 4.4
PSMG4-202ENST00000380305 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
PSMG4-202ENST00000380305 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.49■■■■■ 4.39
PSMG4-202ENST00000380305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.382e-10■■□□□ 11.8
PSMG4-202ENST00000380305 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
PSMG4-202ENST00000380305 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PSMG4-202ENST00000380305 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.37■■■■■ 4.37
PSMG4-202ENST00000380305 KIF14Q15058 1648 aa42.31■■■■■ 4.36
PSMG4-202ENST00000380305 NEO1Q92859 1461 aa42.27■■■■■ 4.36
PSMG4-202ENST00000380305 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.27■■■■■ 4.36
PSMG4-202ENST00000380305 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.23■■■■■ 4.35
PSMG4-202ENST00000380305 FANCAO15360 1455 aa42.19■■■■■ 4.34
PSMG4-202ENST00000380305 PLCH2O75038 1416 aa42.19■■■■■ 4.34
PSMG4-202ENST00000380305 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.19■■■■■ 4.34
PSMG4-202ENST00000380305 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.14■■■■■ 4.34
PSMG4-202ENST00000380305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.14■■■■■ 4.34
PSMG4-202ENST00000380305 AKNAQ7Z591 1439 aa42.12■■■■■ 4.33
PSMG4-202ENST00000380305 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.08■■■■■ 4.33
PSMG4-202ENST00000380305 RAPGEF3O95398 923 aa42.05■■■■■ 4.32
PSMG4-202ENST00000380305 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.04■■■■■ 4.32
PSMG4-202ENST00000380305 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.01■■■■■ 4.32
PSMG4-202ENST00000380305 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PSMG4-202ENST00000380305 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.97■■■■■ 4.31
PSMG4-202ENST00000380305 ADGRL1O94910 1474 aa41.97■■■■■ 4.31
PSMG4-202ENST00000380305 TIAM1Q13009 1591 aa41.95■■■■■ 4.31
PSMG4-202ENST00000380305 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms