RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378538.7

SPI1-202, Transcript of Spi-1 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPI1, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1-202ENST00000378538 KIF27Q86VH2 1401 aa37.33■■■■□ 3.57
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SPI1-202ENST00000378538 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.12■■■■□ 3.53
SPI1-202ENST00000378538 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.09■■■■□ 3.53
SPI1-202ENST00000378538 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.02■■■■□ 3.52
SPI1-202ENST00000378538 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.01■■■■□ 3.52
SPI1-202ENST00000378538 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.94■■■■□ 3.5
SPI1-202ENST00000378538 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.93■■■■□ 3.5
SPI1-202ENST00000378538 MAPKBP1O60336 1514 aa36.92■■■■□ 3.5
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SPI1-202ENST00000378538 IQGAP2Q13576 1575 aa36.82■■■■□ 3.48
SPI1-202ENST00000378538 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.81■■■■□ 3.48
SPI1-202ENST00000378538 DIP2BQ9P265 1576 aa36.81■■■■□ 3.48
SPI1-202ENST00000378538 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.8■■■■□ 3.48
SPI1-202ENST00000378538 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.75■■■■□ 3.47
SPI1-202ENST00000378538 DISP1Q96F81 1524 aa36.69■■■■□ 3.46
SPI1-202ENST00000378538 ABCC2Q92887 1545 aa36.65■■■■□ 3.46
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SPI1-202ENST00000378538 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.6■■■■□ 3.45
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SPI1-202ENST00000378538 UACAQ9BZF9 1416 aa36.58■■■■□ 3.45
SPI1-202ENST00000378538 ASXL2Q76L83 1435 aa36.54■■■■□ 3.44
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SPI1-202ENST00000378538 KIAA0556O60303 1618 aa36.48■■■■□ 3.43
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SPI1-202ENST00000378538 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.43■■■■□ 3.42
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SPI1-202ENST00000378538 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.41■■■■□ 3.42
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SPI1-202ENST00000378538 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SPI1-202ENST00000378538 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
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SPI1-202ENST00000378538 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.23■■■■□ 3.39
SPI1-202ENST00000378538 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.22■■■■□ 3.39
SPI1-202ENST00000378538 ABCA8O94911 1581 aa36.18■■■■□ 3.38
SPI1-202ENST00000378538 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
SPI1-202ENST00000378538 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.16■■■■□ 3.38
SPI1-202ENST00000378538 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.16■■■■□ 3.38
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SPI1-202ENST00000378538 KCNH8Q96L42 1107 aa36.07■■■■□ 3.36
SPI1-202ENST00000378538 CD109Q6YHK3 1445 aa35.97■■■■□ 3.35
SPI1-202ENST00000378538 ARID3CA6NKF2 412 aa35.97■■■■□ 3.35
SPI1-202ENST00000378538 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
SPI1-202ENST00000378538 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.93■■■■□ 3.34
SPI1-202ENST00000378538 ATP10BO94823 1461 aa35.93■■■■□ 3.34
SPI1-202ENST00000378538 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.92■■■■□ 3.34
SPI1-202ENST00000378538 SAMD9Q5K651 1589 aa35.91■■■■□ 3.34
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SPI1-202ENST00000378538 KIF21BO75037 1637 aa35.63■■■■□ 3.3
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SPI1-202ENST00000378538 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.52■■■■□ 3.28
SPI1-202ENST00000378538 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.52■■■■□ 3.28
SPI1-202ENST00000378538 RAPGEF3O95398 923 aa35.51■■■■□ 3.28
SPI1-202ENST00000378538 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.51■■■■□ 3.28
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SPI1-202ENST00000378538 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.35■■■■□ 3.25
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SPI1-202ENST00000378538 FANCAO15360 1455 aa35.27■■■■□ 3.24
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SPI1-202ENST00000378538 RICTORQ6R327 1708 aa35.22■■■■□ 3.23
SPI1-202ENST00000378538 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.19■■■■□ 3.22
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SPI1-202ENST00000378538 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.15■■■■□ 3.22
SPI1-202ENST00000378538 PLCH2O75038 1416 aa35.14■■■■□ 3.22
SPI1-202ENST00000378538 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.12■■■■□ 3.21
SPI1-202ENST00000378538 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
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SPI1-202ENST00000378538 MADDQ8WXG6 1647 aa35.06■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.06■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.05■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.04■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.02■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.01■■■■□ 3.2
SPI1-202ENST00000378538 KIF14Q15058 1648 aa35.01■■■■□ 3.2
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