RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 CHD1O14646 1710 aa32.58■■■□□ 2.81
TMCO3-201ENST00000375391 CEP170Q5SW79 1584 aa32.55■■■□□ 2.8
TMCO3-201ENST00000375391 P3H3Q8IVL6 736 aa32.49■■■□□ 2.79
TMCO3-201ENST00000375391 CLIP1P30622 1438 aa32.49■■■□□ 2.79
TMCO3-201ENST00000375391 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.48■■■□□ 2.79
TMCO3-201ENST00000375391 NUP160Q12769 1436 aa32.47■■■□□ 2.79
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.4■■■□□ 2.78
TMCO3-201ENST00000375391 IQGAP2Q13576 1575 aa32.38■■■□□ 2.77
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.37■■■□□ 2.77
TMCO3-201ENST00000375391 JPH4Q96JJ6 628 aa32.32■■■□□ 2.76
TMCO3-201ENST00000375391 ARAP1Q96P48 1450 aa32.31■■■□□ 2.76
TMCO3-201ENST00000375391 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TMCO3-201ENST00000375391 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.27■■■□□ 2.76
TMCO3-201ENST00000375391 OSCARQ8IYS5 282 aa32.24■■■□□ 2.75
TMCO3-201ENST00000375391 DISP1Q96F81 1524 aa32.19■■■□□ 2.74
TMCO3-201ENST00000375391 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.19■■■□□ 2.74
TMCO3-201ENST00000375391 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.18■■■□□ 2.74
TMCO3-201ENST00000375391 SAMD9Q5K651 1589 aa32.16■■■□□ 2.74
TMCO3-201ENST00000375391 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
TMCO3-201ENST00000375391 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.12■■■□□ 2.73
TMCO3-201ENST00000375391 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.1■■■□□ 2.73
TMCO3-201ENST00000375391 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA0556O60303 1618 aa32.07■■■□□ 2.72
TMCO3-201ENST00000375391 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.07■■■□□ 2.72
TMCO3-201ENST00000375391 SHROOM2Q13796 1616 aa32.03■■■□□ 2.72
TMCO3-201ENST00000375391 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
TMCO3-201ENST00000375391 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.98■■■□□ 2.71
TMCO3-201ENST00000375391 ARID3CA6NKF2 412 aa31.95■■■□□ 2.71
TMCO3-201ENST00000375391 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
TMCO3-201ENST00000375391 FMN1Q68DA7 1419 aa31.88■■■□□ 2.69
TMCO3-201ENST00000375391 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.86■■■□□ 2.69
TMCO3-201ENST00000375391 PTPRGP23470 1445 aa31.84■■■□□ 2.69
TMCO3-201ENST00000375391 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.79■■■□□ 2.68
TMCO3-201ENST00000375391 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
TMCO3-201ENST00000375391 APLP2Q06481 763 aa31.73■■■□□ 2.67
TMCO3-201ENST00000375391 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.73■■■□□ 2.67
TMCO3-201ENST00000375391 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.71■■■□□ 2.67
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGEF11O15085 1522 aa31.7■■■□□ 2.66
TMCO3-201ENST00000375391 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TMCO3-201ENST00000375391 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.67■■■□□ 2.66
TMCO3-201ENST00000375391 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
TMCO3-201ENST00000375391 ABCA8O94911 1581 aa31.64■■■□□ 2.66
TMCO3-201ENST00000375391 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 UACAQ9BZF9 1416 aa31.61■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 TIAM1Q13009 1591 aa31.59■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.58■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 HECW1Q76N89 1606 aa31.58■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.57■■■□□ 2.65
TMCO3-201ENST00000375391 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.51■■■□□ 2.64
TMCO3-201ENST00000375391 ATP10BO94823 1461 aa31.51■■■□□ 2.64
TMCO3-201ENST00000375391 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.49■■■□□ 2.63
TMCO3-201ENST00000375391 ABCC2Q92887 1545 aa31.48■■■□□ 2.63
TMCO3-201ENST00000375391 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.48■■■□□ 2.63
TMCO3-201ENST00000375391 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.46■■■□□ 2.63
TMCO3-201ENST00000375391 MAP3K1Q13233 1512 aa31.45■■■□□ 2.62
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.45■■■□□ 2.62
TMCO3-201ENST00000375391 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.43■■■□□ 2.62
TMCO3-201ENST00000375391 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.38■■■□□ 2.61
TMCO3-201ENST00000375391 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.32■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.31■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.3■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 KCNH8Q96L42 1107 aa31.28■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.27■■■□□ 2.6
TMCO3-201ENST00000375391 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.25■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.24■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 NCOA2Q15596 1464 aa31.23■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 KIF14Q15058 1648 aa31.21■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.59
TMCO3-201ENST00000375391 ASXL2Q76L83 1435 aa31.15■■■□□ 2.58
TMCO3-201ENST00000375391 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
TMCO3-201ENST00000375391 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.07■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.03■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.03■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.02■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
TMCO3-201ENST00000375391 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 TTC37Q6PGP7 1564 aa31■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 ITGAEP38570 1179 aa31■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.99■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
TMCO3-201ENST00000375391 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
TMCO3-201ENST00000375391 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.9■■■□□ 2.54
TMCO3-201ENST00000375391 MAPKBP1O60336 1514 aa30.9■■■□□ 2.54
TMCO3-201ENST00000375391 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.84■■■□□ 2.53
TMCO3-201ENST00000375391 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.83■■■□□ 2.53
TMCO3-201ENST00000375391 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.82■■■□□ 2.52
TMCO3-201ENST00000375391 MIA2Q96PC5 1412 aa30.81■■■□□ 2.52
TMCO3-201ENST00000375391 PLCH2O75038 1416 aa30.78■■■□□ 2.52
TMCO3-201ENST00000375391 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms