RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372994.1

C9orf16-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf16, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-201ENST00000372994 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.78■■□□□ 1.72
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C9orf16-201ENST00000372994 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.57■■□□□ 1.68
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C9orf16-201ENST00000372994 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.13■■□□□ 1.61
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C9orf16-201ENST00000372994 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.88■■□□□ 1.57
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C9orf16-201ENST00000372994 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.81■■□□□ 1.56
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C9orf16-201ENST00000372994 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
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C9orf16-201ENST00000372994 NEO1Q92859 1461 aa24.49■■□□□ 1.51
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C9orf16-201ENST00000372994 CLIP1P30622 1438 aa24.37■■□□□ 1.49
C9orf16-201ENST00000372994 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.37■■□□□ 1.49
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C9orf16-201ENST00000372994 RICTORQ6R327 1708 aa24.26■■□□□ 1.47
C9orf16-201ENST00000372994 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.24■■□□□ 1.47
C9orf16-201ENST00000372994 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.24■■□□□ 1.47
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