RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1-202ENST00000369864 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
AMIGO1-202ENST00000369864 CLIP1P30622 1438 aa24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1-202ENST00000369864 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP162Q5TB80 1403 aa24.42■■□□□ 1.5
AMIGO1-202ENST00000369864 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.36■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EEA1Q15075 1411 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.32■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA3Q08378 1498 aa24.31■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.3■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 RGS3P49796 1198 aa24.28■■□□□ 1.48
AMIGO1-202ENST00000369864 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.2■■□□□ 1.47
AMIGO1-202ENST00000369864 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.17■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 CCER2I3L3R5 266 aa24.16■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPY4P0CV99 314 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPY10P0CW01 314 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
AMIGO1-202ENST00000369864 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.07■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.06■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.05■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 PLCB2Q00722 1185 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.04■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 NACADO15069 1562 aa24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CASC1Q6TDU7 716 aa24.02■■□□□ 1.44
AMIGO1-202ENST00000369864 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.01■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF27Q86VH2 1401 aa23.97■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 CFAP53Q96M91 514 aa23.97■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 NEUROD2Q15784 382 aa23.96■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 RGL3Q3MIN7 710 aa23.96■■□□□ 1.43
AMIGO1-202ENST00000369864 HSCBQ8IWL3 235 aa23.95■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.94■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CDCA8Q53HL2 280 aa23.93■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 SOGA1O94964 1423 aa23.91■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.9■■□□□ 1.42
AMIGO1-202ENST00000369864 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
AMIGO1-202ENST00000369864 MS4A1P11836 297 aa23.83■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.82■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.78■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 NRDCO43847 1150 aa23.77■■□□□ 1.4
AMIGO1-202ENST00000369864 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 ARID3AQ99856 593 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.75■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GBP4Q96PP9 640 aa23.74■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 USP35Q9P2H5 1018 aa23.73■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 NUDCQ9Y266 331 aa23.72■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.71■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 KCNH8Q96L42 1107 aa23.7■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.7■■□□□ 1.39
AMIGO1-202ENST00000369864 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 PTMSP20962 102 aa23.68■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.67■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.67■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.66■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCC8Q09428 1581 aa23.65■■□□□ 1.38
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 DRC7Q8IY82 874 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-202ENST00000369864 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.63■■□□□ 1.37
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