RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 CUL7Q14999 1698 aa26.59■■□□□ 1.85
NSL1-201ENST00000366976 SHROOM2Q13796 1616 aa26.54■■□□□ 1.84
NSL1-201ENST00000366976 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.52■■□□□ 1.84
NSL1-201ENST00000366976 JPH4Q96JJ6 628 aa26.51■■□□□ 1.83
NSL1-201ENST00000366976 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.47■■□□□ 1.83
NSL1-201ENST00000366976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.41■■□□□ 1.82
NSL1-201ENST00000366976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.4■■□□□ 1.82
NSL1-201ENST00000366976 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NSL1-201ENST00000366976 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.34■■□□□ 1.81
NSL1-201ENST00000366976 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.28■■□□□ 1.8
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NSL1-201ENST00000366976 EEA1Q15075 1411 aa26.21■■□□□ 1.79
NSL1-201ENST00000366976 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.21■■□□□ 1.79
NSL1-201ENST00000366976 IQGAP2Q13576 1575 aa26.19■■□□□ 1.78
NSL1-201ENST00000366976 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.14■■□□□ 1.78
NSL1-201ENST00000366976 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.11■■□□□ 1.77
NSL1-201ENST00000366976 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.11■■□□□ 1.77
NSL1-201ENST00000366976 PTPRGP23470 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
NSL1-201ENST00000366976 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
NSL1-201ENST00000366976 DISP1Q96F81 1524 aa26.04■■□□□ 1.76
NSL1-201ENST00000366976 GOLGA3Q08378 1498 aa25.98■■□□□ 1.75
NSL1-201ENST00000366976 MAPKBP1O60336 1514 aa25.98■■□□□ 1.75
NSL1-201ENST00000366976 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.97■■□□□ 1.75
NSL1-201ENST00000366976 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.96■■□□□ 1.75
NSL1-201ENST00000366976 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.96■■□□□ 1.75
NSL1-201ENST00000366976 UACAQ9BZF9 1416 aa25.92■■□□□ 1.74
NSL1-201ENST00000366976 KIAA0556O60303 1618 aa25.92■■□□□ 1.74
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NSL1-201ENST00000366976 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.89■■□□□ 1.73
NSL1-201ENST00000366976 DIP2BQ9P265 1576 aa25.89■■□□□ 1.73
NSL1-201ENST00000366976 TSPOAP1O95153 1857 aa25.87■■□□□ 1.73
NSL1-201ENST00000366976 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NSL1-201ENST00000366976 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.84■■□□□ 1.73
NSL1-201ENST00000366976 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.81■■□□□ 1.72
NSL1-201ENST00000366976 KIF21BO75037 1637 aa25.81■■□□□ 1.72
NSL1-201ENST00000366976 KDM6BO15054 1643 aa25.8■■□□□ 1.72
NSL1-201ENST00000366976 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.79■■□□□ 1.72
NSL1-201ENST00000366976 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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NSL1-201ENST00000366976 ASXL2Q76L83 1435 aa25.71■■□□□ 1.71
NSL1-201ENST00000366976 SAMD9Q5K651 1589 aa25.7■■□□□ 1.71
NSL1-201ENST00000366976 ABCA8O94911 1581 aa25.69■■□□□ 1.7
NSL1-201ENST00000366976 GLI2P10070 1586 aa25.66■■□□□ 1.7
NSL1-201ENST00000366976 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.66■■□□□ 1.7
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NSL1-201ENST00000366976 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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NSL1-201ENST00000366976 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
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NSL1-201ENST00000366976 ATP10BO94823 1461 aa25.5■■□□□ 1.67
NSL1-201ENST00000366976 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.47■■□□□ 1.67
NSL1-201ENST00000366976 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.46■■□□□ 1.67
NSL1-201ENST00000366976 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.45■■□□□ 1.66
NSL1-201ENST00000366976 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.44■■□□□ 1.66
NSL1-201ENST00000366976 FMN1Q68DA7 1419 aa25.41■■□□□ 1.66
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NSL1-201ENST00000366976 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.38■■□□□ 1.65
NSL1-201ENST00000366976 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.37■■□□□ 1.65
NSL1-201ENST00000366976 CD109Q6YHK3 1445 aa25.37■■□□□ 1.65
NSL1-201ENST00000366976 KCNH8Q96L42 1107 aa25.36■■□□□ 1.65
NSL1-201ENST00000366976 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.36■■□□□ 1.65
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NSL1-201ENST00000366976 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.31■■□□□ 1.64
NSL1-201ENST00000366976 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NSL1-201ENST00000366976 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
NSL1-201ENST00000366976 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NSL1-201ENST00000366976 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.28■■□□□ 1.64
NSL1-201ENST00000366976 ARID3CA6NKF2 412 aa25.26■■□□□ 1.63
NSL1-201ENST00000366976 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.26■■□□□ 1.63
NSL1-201ENST00000366976 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.26■■□□□ 1.63
NSL1-201ENST00000366976 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.24■■□□□ 1.63
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NSL1-201ENST00000366976 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.18■■□□□ 1.62
NSL1-201ENST00000366976 NEO1Q92859 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
NSL1-201ENST00000366976 CLIP1P30622 1438 aa25.16■■□□□ 1.62
NSL1-201ENST00000366976 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.15■■□□□ 1.62
NSL1-201ENST00000366976 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NSL1-201ENST00000366976 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
NSL1-201ENST00000366976 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.09■■□□□ 1.61
NSL1-201ENST00000366976 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
NSL1-201ENST00000366976 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.06■■□□□ 1.6
NSL1-201ENST00000366976 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
NSL1-201ENST00000366976 PLCH2O75038 1416 aa25.03■■□□□ 1.6
NSL1-201ENST00000366976 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 FANCAO15360 1455 aa24.99■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 AKNAQ7Z591 1439 aa24.98■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 CEP162Q5TB80 1403 aa24.96■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.96■■□□□ 1.59
NSL1-201ENST00000366976 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.94■■□□□ 1.58
NSL1-201ENST00000366976 KIF14Q15058 1648 aa24.94■■□□□ 1.58
NSL1-201ENST00000366976 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
NSL1-201ENST00000366976 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.92■■□□□ 1.58
NSL1-201ENST00000366976 RAPGEF3O95398 923 aa24.91■■□□□ 1.58
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