RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365097.1

RN7SKP22-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 22, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP22, Length 293 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP22-201ENST00000365097 TRIM41Q8WV44 630 aa15.52■□□□□ 0.08
RN7SKP22-201ENST00000365097 NUP160Q12769 1436 aa15.51■□□□□ 0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 CEP170Q5SW79 1584 aa15.51■□□□□ 0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 CUL7Q14999 1698 aa15.47■□□□□ 0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.47■□□□□ 0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 ARAP1Q96P48 1450 aa15.46■□□□□ 0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.45■□□□□ 0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.42■□□□□ 0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.39■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 SHROOM2Q13796 1616 aa15.39■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 POTEDQ86YR6 584 aa15.38■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.35■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.35■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 JPH4Q96JJ6 628 aa15.35■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.34■□□□□ 0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 PRXQ9BXM0 1461 aa15.29■□□□□ 0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 IQGAP2Q13576 1575 aa15.25■□□□□ 0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.25■□□□□ 0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 EEA1Q15075 1411 aa15.25■□□□□ 0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.18■□□□□ 0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.17■□□□□ 0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.17■□□□□ 0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 DISP1Q96F81 1524 aa15.17■□□□□ 0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.14■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 PTPRGP23470 1445 aa15.14■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 KIAA0556O60303 1618 aa15.12■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 DMRT2Q9Y5R5 561 aa15.11■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 KIF21BO75037 1637 aa15.1■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.1■□□□□ 0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 GOLGA3Q08378 1498 aa15.07■□□□□ 0
RN7SKP22-201ENST00000365097 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.04■□□□□ -0
RN7SKP22-201ENST00000365097 UACAQ9BZF9 1416 aa15.03■□□□□ -0
RN7SKP22-201ENST00000365097 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
RN7SKP22-201ENST00000365097 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.02■□□□□ -0
RN7SKP22-201ENST00000365097 P3H3Q8IVL6 736 aa15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 ABCC2Q92887 1545 aa15.01□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 SAMD9Q5K651 1589 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 MAPKBP1O60336 1514 aa15□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.99□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 ABCA8O94911 1581 aa14.96□□□□□ -0.01
RN7SKP22-201ENST00000365097 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.95□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.94□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 DIP2BQ9P265 1576 aa14.93□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 ASXL2Q76L83 1435 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.92□□□□□ -0.02
RN7SKP22-201ENST00000365097 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 ARID3CA6NKF2 412 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.86□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 ATP10BO94823 1461 aa14.84□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.83□□□□□ -0.03
RN7SKP22-201ENST00000365097 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 GLI2P10070 1586 aa14.82□□□□□ -0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 TSPOAP1O95153 1857 aa14.79□□□□□ -0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 FMN1Q68DA7 1419 aa14.77□□□□□ -0.04
RN7SKP22-201ENST00000365097 KCNH8Q96L42 1107 aa14.77□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.76□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 CLIP1P30622 1438 aa14.75□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 KCNA4P22459 653 aa14.73□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 HECW1Q76N89 1606 aa14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RN7SKP22-201ENST00000365097 CD109Q6YHK3 1445 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.7□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 KDM6BO15054 1643 aa14.69□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 CEP162Q5TB80 1403 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.68□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.67□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.65□□□□□ -0.06
RN7SKP22-201ENST00000365097 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.63□□□□□ -0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RN7SKP22-201ENST00000365097 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms