RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.66■■■□□ 2.02
CLDN4-201ENST00000340958 CUL7Q14999 1698 aa27.62■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 CEP170Q5SW79 1584 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 CEP162Q5TB80 1403 aa27.58■■■□□ 2.01
CLDN4-201ENST00000340958 ARHGEF11O15085 1522 aa27.56■■■□□ 2
CLDN4-201ENST00000340958 NUP160Q12769 1436 aa27.56■■■□□ 2
CLDN4-201ENST00000340958 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CLDN4-201ENST00000340958 CLIP1P30622 1438 aa27.44■■□□□ 1.98
CLDN4-201ENST00000340958 SHROOM2Q13796 1616 aa27.38■■□□□ 1.97
CLDN4-201ENST00000340958 ARAP1Q96P48 1450 aa27.36■■□□□ 1.97
CLDN4-201ENST00000340958 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.32■■□□□ 1.96
CLDN4-201ENST00000340958 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN4-201ENST00000340958 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.27■■□□□ 1.96
CLDN4-201ENST00000340958 JPH4Q96JJ6 628 aa27.25■■□□□ 1.95
CLDN4-201ENST00000340958 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN4-201ENST00000340958 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CLDN4-201ENST00000340958 IQGAP2Q13576 1575 aa27.19■■□□□ 1.94
CLDN4-201ENST00000340958 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN4-201ENST00000340958 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.13■■□□□ 1.93
CLDN4-201ENST00000340958 P3H3Q8IVL6 736 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN4-201ENST00000340958 APLP2Q06481 763 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN4-201ENST00000340958 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CLDN4-201ENST00000340958 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.05■■□□□ 1.92
CLDN4-201ENST00000340958 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.03■■□□□ 1.92
CLDN4-201ENST00000340958 DISP1Q96F81 1524 aa26.99■■□□□ 1.91
CLDN4-201ENST00000340958 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN4-201ENST00000340958 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.98■■□□□ 1.91
CLDN4-201ENST00000340958 KIAA0556O60303 1618 aa26.94■■□□□ 1.9
CLDN4-201ENST00000340958 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CLDN4-201ENST00000340958 SAMD9Q5K651 1589 aa26.91■■□□□ 1.9
CLDN4-201ENST00000340958 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CLDN4-201ENST00000340958 PTPRGP23470 1445 aa26.88■■□□□ 1.89
CLDN4-201ENST00000340958 FMN1Q68DA7 1419 aa26.87■■□□□ 1.89
CLDN4-201ENST00000340958 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CLDN4-201ENST00000340958 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN4-201ENST00000340958 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.85■■□□□ 1.89
CLDN4-201ENST00000340958 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CLDN4-201ENST00000340958 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.75■■□□□ 1.87
CLDN4-201ENST00000340958 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.73■■□□□ 1.87
CLDN4-201ENST00000340958 UACAQ9BZF9 1416 aa26.72■■□□□ 1.87
CLDN4-201ENST00000340958 ABCC2Q92887 1545 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.69■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
CLDN4-201ENST00000340958 MAPKBP1O60336 1514 aa26.64■■□□□ 1.85
CLDN4-201ENST00000340958 ABCA8O94911 1581 aa26.63■■□□□ 1.85
CLDN4-201ENST00000340958 TIAM1Q13009 1591 aa26.63■■□□□ 1.85
CLDN4-201ENST00000340958 MAP3K1Q13233 1512 aa26.62■■□□□ 1.85
CLDN4-201ENST00000340958 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.58■■□□□ 1.85
CLDN4-201ENST00000340958 HECW1Q76N89 1606 aa26.57■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.57■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.55■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 ARID3CA6NKF2 412 aa26.54■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.54■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.52■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.51■■□□□ 1.84
CLDN4-201ENST00000340958 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 DIP2BQ9P265 1576 aa26.5■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 ASXL2Q76L83 1435 aa26.49■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.48■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CLDN4-201ENST00000340958 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.44■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.42■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 ATP10BO94823 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CLDN4-201ENST00000340958 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN4-201ENST00000340958 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.34■■□□□ 1.81
CLDN4-201ENST00000340958 GLI2P10070 1586 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN4-201ENST00000340958 TSPOAP1O95153 1857 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN4-201ENST00000340958 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN4-201ENST00000340958 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CLDN4-201ENST00000340958 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.27■■□□□ 1.8
CLDN4-201ENST00000340958 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 NCOA2Q15596 1464 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 KCNH8Q96L42 1107 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CLDN4-201ENST00000340958 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CLDN4-201ENST00000340958 ITGAEP38570 1179 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN4-201ENST00000340958 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN4-201ENST00000340958 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 CD109Q6YHK3 1445 aa26.1■■□□□ 1.77
CLDN4-201ENST00000340958 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 KDM6BO15054 1643 aa26.05■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 KIF14Q15058 1648 aa26.04■■□□□ 1.76
CLDN4-201ENST00000340958 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms