RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326974.8

KLHDC3-202, Transcript of kelch domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3-202ENST00000326974 PBRM1Q86U86 1689 aa25.85■■□□□ 1.73
KLHDC3-202ENST00000326974 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
KLHDC3-202ENST00000326974 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
KLHDC3-202ENST00000326974 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
KLHDC3-202ENST00000326974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.77■■□□□ 1.72
KLHDC3-202ENST00000326974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.723e-8■■■■■ 30.9
KLHDC3-202ENST00000326974 TIAM1Q13009 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
KLHDC3-202ENST00000326974 P3H3Q8IVL6 736 aa25.75■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 ADAMTS12P58397 1594 aa25.72■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 MAP3K1Q13233 1512 aa25.71■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.7■■□□□ 1.71
KLHDC3-202ENST00000326974 IFT140Q96RY7 1462 aa25.7■■□□□ 1.7
KLHDC3-202ENST00000326974 SAMD9Q5K651 1589 aa25.69■■□□□ 1.7
KLHDC3-202ENST00000326974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.68■■□□□ 1.7
KLHDC3-202ENST00000326974 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
KLHDC3-202ENST00000326974 GRIN2BQ13224 1484 aa25.64■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.62■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.62■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.59■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.59■■□□□ 1.69
KLHDC3-202ENST00000326974 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.54■■□□□ 1.68
KLHDC3-202ENST00000326974 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.51■■□□□ 1.67
KLHDC3-202ENST00000326974 FMN1Q68DA7 1419 aa25.51■■□□□ 1.67
KLHDC3-202ENST00000326974 IQGAP2Q13576 1575 aa25.51■■□□□ 1.67
KLHDC3-202ENST00000326974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.49■■□□□ 1.67
KLHDC3-202ENST00000326974 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
KLHDC3-202ENST00000326974 GRIN2AQ12879 1464 aa25.39■■□□□ 1.66
KLHDC3-202ENST00000326974 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
KLHDC3-202ENST00000326974 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
KLHDC3-202ENST00000326974 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.32■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 CEP170Q5SW79 1584 aa25.3■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 ITGAEP38570 1179 aa25.29■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.29■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 DISP1Q96F81 1524 aa25.28■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 KIAA0556O60303 1618 aa25.28■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 SYNJ2O15056 1496 aa25.27■■□□□ 1.64
KLHDC3-202ENST00000326974 HECW1Q76N89 1606 aa25.26■■□□□ 1.63
KLHDC3-202ENST00000326974 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.24■■□□□ 1.63
KLHDC3-202ENST00000326974 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.23■■□□□ 1.63
KLHDC3-202ENST00000326974 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
KLHDC3-202ENST00000326974 NCOA2Q15596 1464 aa25.2■■□□□ 1.63
KLHDC3-202ENST00000326974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.2■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.17■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 ARHGEF11O15085 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 NUP160Q12769 1436 aa25.16■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
KLHDC3-202ENST00000326974 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.11■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 FBLN2P98095 1184 aa25.1■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.1■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.09■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.08■■□□□ 1.61
KLHDC3-202ENST00000326974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
KLHDC3-202ENST00000326974 ARID3CA6NKF2 412 aa25.07■■□□□ 1.6
KLHDC3-202ENST00000326974 MAPKBP1O60336 1514 aa25.06■■□□□ 1.6
KLHDC3-202ENST00000326974 PTPRKQ15262 1439 aa25.05■■□□□ 1.6
KLHDC3-202ENST00000326974 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.04■■□□□ 1.6
KLHDC3-202ENST00000326974 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.98■■□□□ 1.59
KLHDC3-202ENST00000326974 CHD1O14646 1710 aa24.97■■□□□ 1.59
KLHDC3-202ENST00000326974 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
KLHDC3-202ENST00000326974 JPH4Q96JJ6 628 aa24.95■■□□□ 1.58
KLHDC3-202ENST00000326974 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
KLHDC3-202ENST00000326974 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
KLHDC3-202ENST00000326974 HFM1A2PYH4 1435 aa24.89■■□□□ 1.58
KLHDC3-202ENST00000326974 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
KLHDC3-202ENST00000326974 ABCA8O94911 1581 aa24.86■■□□□ 1.57
KLHDC3-202ENST00000326974 NAIPQ13075 1403 aa24.85■■□□□ 1.57
KLHDC3-202ENST00000326974 MIA2Q96PC5 1412 aa24.85■■□□□ 1.57
KLHDC3-202ENST00000326974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
KLHDC3-202ENST00000326974 KIF14Q15058 1648 aa24.81■■□□□ 1.56
KLHDC3-202ENST00000326974 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
KLHDC3-202ENST00000326974 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.8■■□□□ 1.56
KLHDC3-202ENST00000326974 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.79■■□□□ 1.56
KLHDC3-202ENST00000326974 SHROOM2Q13796 1616 aa24.77■■□□□ 1.56
KLHDC3-202ENST00000326974 KDM6BO15054 1643 aa24.76■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.74■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 UACAQ9BZF9 1416 aa24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 ATP10BO94823 1461 aa24.72■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 AKNAQ7Z591 1439 aa24.71■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
KLHDC3-202ENST00000326974 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.7■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.7■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.69■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 DAPK1P53355 1430 aa24.69■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 ABCC5O15440 1437 aa24.67■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.66■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 PTPRGP23470 1445 aa24.66■■□□□ 1.54
KLHDC3-202ENST00000326974 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms