RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 P3H3Q8IVL6 736 aa34.5■■■■□ 3.11
SNX18-201ENST00000326277 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.5■■■■□ 3.11
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K1Q13233 1512 aa34.5■■■■□ 3.11
SNX18-201ENST00000326277 TIAM1Q13009 1591 aa34.49■■■■□ 3.11
SNX18-201ENST00000326277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.45■■■■□ 3.11
SNX18-201ENST00000326277 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
SNX18-201ENST00000326277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SNX18-201ENST00000326277 PBRM1Q86U86 1689 aa34.39■■■■□ 3.1
SNX18-201ENST00000326277 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
SNX18-201ENST00000326277 WDR62O43379 1518 aa34.36■■■■□ 3.09
SNX18-201ENST00000326277 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.34■■■■□ 3.09
SNX18-201ENST00000326277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.32■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.31■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.29■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.29■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 SAMD9Q5K651 1589 aa34.28■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 IFT140Q96RY7 1462 aa34.28■■■■□ 3.08
SNX18-201ENST00000326277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 ADAMTS12P58397 1594 aa34.24■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 FMN1Q68DA7 1419 aa34.24■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 GRIN2BQ13224 1484 aa34.24■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 ERCC6Q03468 1493 aa34.2■■■■□ 3.07
SNX18-201ENST00000326277 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.17■■■■□ 3.06
SNX18-201ENST00000326277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.13■■■■□ 3.05
SNX18-201ENST00000326277 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
SNX18-201ENST00000326277 IQGAP2Q13576 1575 aa34.06■■■■□ 3.04
SNX18-201ENST00000326277 ITGAEP38570 1179 aa34.03■■■■□ 3.04
SNX18-201ENST00000326277 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SNX18-201ENST00000326277 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
SNX18-201ENST00000326277 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.99■■■■□ 3.03
SNX18-201ENST00000326277 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.93■■■■□ 3.02
SNX18-201ENST00000326277 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SNX18-201ENST00000326277 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.9■■■■□ 3.02
SNX18-201ENST00000326277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.88■■■■□ 3.01
SNX18-201ENST00000326277 GRIN2AQ12879 1464 aa33.87■■■■□ 3.01
SNX18-201ENST00000326277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.84■■■■□ 3.01
SNX18-201ENST00000326277 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.82■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 HECW1Q76N89 1606 aa33.78■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.78■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.78■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.77■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.77■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.76■■■■□ 3
SNX18-201ENST00000326277 NCOA2Q15596 1464 aa33.75■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 SYNJ2O15056 1496 aa33.72■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 DISP1Q96F81 1524 aa33.72■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.72■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 KIAA0556O60303 1618 aa33.71■■■□□ 2.99
SNX18-201ENST00000326277 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
SNX18-201ENST00000326277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
SNX18-201ENST00000326277 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.66■■■□□ 2.98
SNX18-201ENST00000326277 CEP170Q5SW79 1584 aa33.65■■■□□ 2.98
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF11O15085 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
SNX18-201ENST00000326277 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
SNX18-201ENST00000326277 FBLN2P98095 1184 aa33.59■■■□□ 2.97
SNX18-201ENST00000326277 MAPKBP1O60336 1514 aa33.58■■■□□ 2.97
SNX18-201ENST00000326277 NUP160Q12769 1436 aa33.54■■■□□ 2.96
SNX18-201ENST00000326277 ARID3CA6NKF2 412 aa33.53■■■□□ 2.96
SNX18-201ENST00000326277 PTPRKQ15262 1439 aa33.51■■■□□ 2.96
SNX18-201ENST00000326277 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.51■■■□□ 2.96
SNX18-201ENST00000326277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.49■■■□□ 2.95
SNX18-201ENST00000326277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
SNX18-201ENST00000326277 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
SNX18-201ENST00000326277 HFM1A2PYH4 1435 aa33.42■■■□□ 2.94
SNX18-201ENST00000326277 JPH4Q96JJ6 628 aa33.41■■■□□ 2.94
SNX18-201ENST00000326277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.38■■■□□ 2.93
SNX18-201ENST00000326277 MIA2Q96PC5 1412 aa33.36■■■□□ 2.93
SNX18-201ENST00000326277 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.33■■■□□ 2.93
SNX18-201ENST00000326277 NAIPQ13075 1403 aa33.33■■■□□ 2.93
SNX18-201ENST00000326277 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
SNX18-201ENST00000326277 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.26■■■□□ 2.92
SNX18-201ENST00000326277 UACAQ9BZF9 1416 aa33.23■■■□□ 2.91
SNX18-201ENST00000326277 NEUROD1Q13562 356 aa33.21■■■□□ 2.91
SNX18-201ENST00000326277 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.19■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.17■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.16■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 AKNAQ7Z591 1439 aa33.16■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 ABCA8O94911 1581 aa33.15■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 CHD1O14646 1710 aa33.14■■■□□ 2.9
SNX18-201ENST00000326277 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa33.11■■■□□ 2.89
SNX18-201ENST00000326277 MIER1Q8N108 512 aa33.09■■■□□ 2.89
SNX18-201ENST00000326277 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.08■■■□□ 2.89
SNX18-201ENST00000326277 DAPK1P53355 1430 aa33.07■■■□□ 2.89
SNX18-201ENST00000326277 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 KIF14Q15058 1648 aa33.07■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 ABCC5O15440 1437 aa33.04■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 KDM6BO15054 1643 aa33.03■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 ATP10BO94823 1461 aa33.02■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.02■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
SNX18-201ENST00000326277 PTPRGP23470 1445 aa32.99■■■□□ 2.87
SNX18-201ENST00000326277 ROCK1Q13464 1354 aa32.99■■■□□ 2.87
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