RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SPNS1-202ENST00000323081 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS1-202ENST00000323081 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.33■■□□□ 1.81
SPNS1-202ENST00000323081 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-202ENST00000323081 P3H3Q8IVL6 736 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-202ENST00000323081 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-202ENST00000323081 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-202ENST00000323081 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-202ENST00000323081 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-202ENST00000323081 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-202ENST00000323081 PBRM1Q86U86 1689 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS1-202ENST00000323081 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS1-202ENST00000323081 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-202ENST00000323081 SAMD9Q5K651 1589 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-202ENST00000323081 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SPNS1-202ENST00000323081 WDR62O43379 1518 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 FMN1Q68DA7 1419 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 ADAMTS12P58397 1594 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
SPNS1-202ENST00000323081 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 IFT140Q96RY7 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 ITGAEP38570 1179 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 GRIN2BQ13224 1484 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS1-202ENST00000323081 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-202ENST00000323081 IQGAP2Q13576 1575 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-202ENST00000323081 ERCC6Q03468 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS1-202ENST00000323081 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-202ENST00000323081 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SPNS1-202ENST00000323081 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.89■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.83■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.83■■□□□ 1.73
SPNS1-202ENST00000323081 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 GRIN2AQ12879 1464 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 NCOA2Q15596 1464 aa25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 HECW1Q76N89 1606 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 MAPKBP1O60336 1514 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 NEUROD1Q13562 356 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF11O15085 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 DISP1Q96F81 1524 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA0556O60303 1618 aa25.7■■□□□ 1.71
SPNS1-202ENST00000323081 MIER1Q8N108 512 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-202ENST00000323081 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-202ENST00000323081 SYNJ2O15056 1496 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRKQ15262 1439 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS1-202ENST00000323081 CEP170Q5SW79 1584 aa25.64■■□□□ 1.69
SPNS1-202ENST00000323081 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-202ENST00000323081 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-202ENST00000323081 HFM1A2PYH4 1435 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 ARID3CA6NKF2 412 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 NUP160Q12769 1436 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS1-202ENST00000323081 FBLN2P98095 1184 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-202ENST00000323081 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-202ENST00000323081 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-202ENST00000323081 NAIPQ13075 1403 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-202ENST00000323081 MIA2Q96PC5 1412 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-202ENST00000323081 UACAQ9BZF9 1416 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-202ENST00000323081 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-202ENST00000323081 JPH4Q96JJ6 628 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-202ENST00000323081 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-202ENST00000323081 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-202ENST00000323081 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-202ENST00000323081 AKNAQ7Z591 1439 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-202ENST00000323081 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-202ENST00000323081 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.33■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 KDM6BO15054 1643 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-202ENST00000323081 ABCA8O94911 1581 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 DAPK1P53355 1430 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 KIF14Q15058 1648 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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