RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.2■■□□□ 1.95
IFT20-201ENST00000322326 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
IFT20-201ENST00000322326 KIF27Q86VH2 1401 aa27.08■■□□□ 1.93
IFT20-201ENST00000322326 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.08■■□□□ 1.93
IFT20-201ENST00000322326 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.07■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 CUL7Q14999 1698 aa27.07■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 MAPKBP1O60336 1514 aa27.06■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.06■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 IGF1RP08069 1367 aa27.06■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.03■■□□□ 1.92
IFT20-201ENST00000322326 DIP2BQ9P265 1576 aa26.99■■□□□ 1.91
IFT20-201ENST00000322326 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.9■■□□□ 1.9
IFT20-201ENST00000322326 PTPRGP23470 1445 aa26.89■■□□□ 1.89
IFT20-201ENST00000322326 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.85■■□□□ 1.89
IFT20-201ENST00000322326 KDM6BO15054 1643 aa26.84■■□□□ 1.89
IFT20-201ENST00000322326 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.83■■□□□ 1.89
IFT20-201ENST00000322326 TSPOAP1O95153 1857 aa26.82■■□□□ 1.88
IFT20-201ENST00000322326 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.82■■□□□ 1.88
IFT20-201ENST00000322326 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
IFT20-201ENST00000322326 IQGAP2Q13576 1575 aa26.79■■□□□ 1.88
IFT20-201ENST00000322326 ABCC2Q92887 1545 aa26.76■■□□□ 1.87
IFT20-201ENST00000322326 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.7■■□□□ 1.87
IFT20-201ENST00000322326 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.69■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 ASXL2Q76L83 1435 aa26.69■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 UACAQ9BZF9 1416 aa26.67■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 GLI2P10070 1586 aa26.66■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 DISP1Q96F81 1524 aa26.65■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.64■■□□□ 1.86
IFT20-201ENST00000322326 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.63■■□□□ 1.85
IFT20-201ENST00000322326 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.6■■□□□ 1.85
IFT20-201ENST00000322326 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
IFT20-201ENST00000322326 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.57■■□□□ 1.84
IFT20-201ENST00000322326 KIAA0556O60303 1618 aa26.54■■□□□ 1.84
IFT20-201ENST00000322326 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
IFT20-201ENST00000322326 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
IFT20-201ENST00000322326 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.5■■□□□ 1.83
IFT20-201ENST00000322326 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.48■■□□□ 1.83
IFT20-201ENST00000322326 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.44■■□□□ 1.82
IFT20-201ENST00000322326 GOLGA3Q08378 1498 aa26.41■■□□□ 1.82
IFT20-201ENST00000322326 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
IFT20-201ENST00000322326 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.4■■□□□ 1.82
IFT20-201ENST00000322326 ADGRL1O94910 1474 aa26.39■■□□□ 1.82
IFT20-201ENST00000322326 ABCA8O94911 1581 aa26.31■■□□□ 1.8
IFT20-201ENST00000322326 EEA1Q15075 1411 aa26.31■■□□□ 1.8
IFT20-201ENST00000322326 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.28■■□□□ 1.8
IFT20-201ENST00000322326 PRXQ9BXM0 1461 aa26.28■■□□□ 1.8
IFT20-201ENST00000322326 CD109Q6YHK3 1445 aa26.27■■□□□ 1.8
IFT20-201ENST00000322326 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.26■■□□□ 1.79
IFT20-201ENST00000322326 KCNH8Q96L42 1107 aa26.26■■□□□ 1.79
IFT20-201ENST00000322326 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
IFT20-201ENST00000322326 P3H3Q8IVL6 736 aa26.1■■□□□ 1.77
IFT20-201ENST00000322326 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.1■■□□□ 1.77
IFT20-201ENST00000322326 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.1■■□□□ 1.77
IFT20-201ENST00000322326 ATP10BO94823 1461 aa26.09■■□□□ 1.77
IFT20-201ENST00000322326 ARID3CA6NKF2 412 aa26.08■■□□□ 1.77
IFT20-201ENST00000322326 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.06■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 SAMD9Q5K651 1589 aa26.03■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 KIF21BO75037 1637 aa26.03■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.02■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.02■■□□□ 1.76
IFT20-201ENST00000322326 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.99■■□□□ 1.75
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
IFT20-201ENST00000322326 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
IFT20-201ENST00000322326 NEO1Q92859 1461 aa25.92■■□□□ 1.74
IFT20-201ENST00000322326 RAPGEF3O95398 923 aa25.88■■□□□ 1.73
IFT20-201ENST00000322326 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
IFT20-201ENST00000322326 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
IFT20-201ENST00000322326 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.84■■□□□ 1.73
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.83■■□□□ 1.73
IFT20-201ENST00000322326 PTPRMP28827 1452 aa25.81■■□□□ 1.72
IFT20-201ENST00000322326 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.81■■□□□ 1.72
IFT20-201ENST00000322326 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.8■■□□□ 1.72
IFT20-201ENST00000322326 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
IFT20-201ENST00000322326 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.77■■□□□ 1.72
IFT20-201ENST00000322326 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.75■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.75■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.73■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 AKNAQ7Z591 1439 aa25.71■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.71■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 FANCAO15360 1455 aa25.71■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 MADDQ8WXG6 1647 aa25.7■■□□□ 1.71
IFT20-201ENST00000322326 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
IFT20-201ENST00000322326 RICTORQ6R327 1708 aa25.7■■□□□ 1.7
IFT20-201ENST00000322326 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
IFT20-201ENST00000322326 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.69■■□□□ 1.7
IFT20-201ENST00000322326 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.65■■□□□ 1.7
IFT20-201ENST00000322326 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.62■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.62■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 FBXO41Q8TF61 875 aa25.6■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.59■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.58■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.58■■□□□ 1.69
IFT20-201ENST00000322326 PLCH2O75038 1416 aa25.54■■□□□ 1.68
IFT20-201ENST00000322326 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.54■■□□□ 1.68
IFT20-201ENST00000322326 FMN1Q68DA7 1419 aa25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms