RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SSR4-201ENST00000320857 GRIN2BQ13224 1484 aa26.12■■□□□ 1.77
SSR4-201ENST00000320857 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.1■■□□□ 1.77
SSR4-201ENST00000320857 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.07■■□□□ 1.76
SSR4-201ENST00000320857 ADAMTS12P58397 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
SSR4-201ENST00000320857 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SSR4-201ENST00000320857 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.97■■□□□ 1.75
SSR4-201ENST00000320857 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.97■■□□□ 1.75
SSR4-201ENST00000320857 FBLN2P98095 1184 aa25.93■■□□□ 1.74
SSR4-201ENST00000320857 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SSR4-201ENST00000320857 SAMD9Q5K651 1589 aa25.86■■□□□ 1.73
SSR4-201ENST00000320857 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SSR4-201ENST00000320857 MAP3K1Q13233 1512 aa25.84■■□□□ 1.73
SSR4-201ENST00000320857 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.82■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 P3H3Q8IVL6 736 aa25.8■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 CHD1O14646 1710 aa25.8■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 IQGAP2Q13576 1575 aa25.79■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 GRIN2AQ12879 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 SYNJ2O15056 1496 aa25.79■■□□□ 1.72
SSR4-201ENST00000320857 TIAM1Q13009 1591 aa25.75■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 FMN1Q68DA7 1419 aa25.74■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.72■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.71■■□□□ 1.71
SSR4-201ENST00000320857 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.69■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 OSCARQ8IYS5 282 aa25.68■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.66■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.65■■□□□ 1.7
SSR4-201ENST00000320857 CEP170Q5SW79 1584 aa25.62■■□□□ 1.69
SSR4-201ENST00000320857 NUP160Q12769 1436 aa25.61■■□□□ 1.69
SSR4-201ENST00000320857 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SSR4-201ENST00000320857 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.56■■□□□ 1.68
SSR4-201ENST00000320857 DISP1Q96F81 1524 aa25.54■■□□□ 1.68
SSR4-201ENST00000320857 KIAA0556O60303 1618 aa25.54■■□□□ 1.68
SSR4-201ENST00000320857 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.48■■□□□ 1.67
SSR4-201ENST00000320857 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.45■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 HECW1Q76N89 1606 aa25.45■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.43■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.42■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 JPH4Q96JJ6 628 aa25.42■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.39■■□□□ 1.66
SSR4-201ENST00000320857 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.39■■□□□ 1.65
SSR4-201ENST00000320857 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.37■■□□□ 1.65
SSR4-201ENST00000320857 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SSR4-201ENST00000320857 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.32■■□□□ 1.64
SSR4-201ENST00000320857 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.32■■□□□ 1.64
SSR4-201ENST00000320857 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.646e-8■■□□□ 11.8
SSR4-201ENST00000320857 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SSR4-201ENST00000320857 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SSR4-201ENST00000320857 ITGAEP38570 1179 aa25.26■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 SHROOM2Q13796 1616 aa25.26■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.26■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 NCOA2Q15596 1464 aa25.25■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.25■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.24■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 ARHGEF11O15085 1522 aa25.23■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-201ENST00000320857 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SSR4-201ENST00000320857 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.19■■□□□ 1.62
SSR4-201ENST00000320857 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
SSR4-201ENST00000320857 ABCA8O94911 1581 aa25.17■■□□□ 1.62
SSR4-201ENST00000320857 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.15■■□□□ 1.62
SSR4-201ENST00000320857 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.12■■□□□ 1.61
SSR4-201ENST00000320857 ARID3CA6NKF2 412 aa25.12■■□□□ 1.61
SSR4-201ENST00000320857 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SSR4-201ENST00000320857 PTPRGP23470 1445 aa25.1■■□□□ 1.61
SSR4-201ENST00000320857 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.09■■□□□ 1.61
SSR4-201ENST00000320857 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.04■■□□□ 1.6
SSR4-201ENST00000320857 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SSR4-201ENST00000320857 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SSR4-201ENST00000320857 MIA2Q96PC5 1412 aa25.02■■□□□ 1.6
SSR4-201ENST00000320857 ATP10BO94823 1461 aa25■■□□□ 1.59
SSR4-201ENST00000320857 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.98■■□□□ 1.59
SSR4-201ENST00000320857 UACAQ9BZF9 1416 aa24.97■■□□□ 1.59
SSR4-201ENST00000320857 PTPRKQ15262 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
SSR4-201ENST00000320857 HFM1A2PYH4 1435 aa24.93■■□□□ 1.58
SSR4-201ENST00000320857 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.91■■□□□ 1.58
SSR4-201ENST00000320857 ABCC2Q92887 1545 aa24.89■■□□□ 1.58
SSR4-201ENST00000320857 KIF14Q15058 1648 aa24.89■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 MAPKBP1O60336 1514 aa24.87■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.87■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 NAIPQ13075 1403 aa24.84■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 AKNAQ7Z591 1439 aa24.84■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.83■■□□□ 1.57
SSR4-201ENST00000320857 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.82■■□□□ 1.56
SSR4-201ENST00000320857 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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