RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306823.10

GPS1-201, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPS1, Length 1,842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-201ENST00000306823 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.36■■□□□ 1.97
GPS1-201ENST00000306823 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.35■■□□□ 1.97
GPS1-201ENST00000306823 P3H3Q8IVL6 736 aa27.33■■□□□ 1.97
GPS1-201ENST00000306823 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
GPS1-201ENST00000306823 TIAM1Q13009 1591 aa27.31■■□□□ 1.96
GPS1-201ENST00000306823 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.29■■□□□ 1.96
GPS1-201ENST00000306823 WDR62O43379 1518 aa27.25■■□□□ 1.95
GPS1-201ENST00000306823 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.953e-8■□□□□ 10.6
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GPS1-201ENST00000306823 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.22■■□□□ 1.95
GPS1-201ENST00000306823 PBRM1Q86U86 1689 aa27.21■■□□□ 1.95
GPS1-201ENST00000306823 IFT140Q96RY7 1462 aa27.21■■□□□ 1.95
GPS1-201ENST00000306823 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.2■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.19■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.19■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 SAMD9Q5K651 1589 aa27.17■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 GRIN2BQ13224 1484 aa27.16■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.16■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 FMN1Q68DA7 1419 aa27.15■■□□□ 1.94
GPS1-201ENST00000306823 ADAMTS12P58397 1594 aa27.12■■□□□ 1.93
GPS1-201ENST00000306823 ERCC6Q03468 1493 aa27.12■■□□□ 1.93
GPS1-201ENST00000306823 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
GPS1-201ENST00000306823 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
GPS1-201ENST00000306823 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.08■■□□□ 1.93
GPS1-201ENST00000306823 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.06■■□□□ 1.92
GPS1-201ENST00000306823 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
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GPS1-201ENST00000306823 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
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GPS1-201ENST00000306823 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.89■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.86■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.85■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 GRIN2AQ12879 1464 aa26.85■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
GPS1-201ENST00000306823 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.8■■□□□ 1.88
GPS1-201ENST00000306823 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.79■■□□□ 1.88
GPS1-201ENST00000306823 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.78■■□□□ 1.88
GPS1-201ENST00000306823 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-201ENST00000306823 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
GPS1-201ENST00000306823 SYNJ2O15056 1496 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 HECW1Q76N89 1606 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 DISP1Q96F81 1524 aa26.75■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 NCOA2Q15596 1464 aa26.74■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.72■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
GPS1-201ENST00000306823 KIAA0556O60303 1618 aa26.7■■□□□ 1.86
GPS1-201ENST00000306823 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
GPS1-201ENST00000306823 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.69■■□□□ 1.86
GPS1-201ENST00000306823 ARHGEF11O15085 1522 aa26.69■■□□□ 1.86
GPS1-201ENST00000306823 CEP170Q5SW79 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
GPS1-201ENST00000306823 NUP160Q12769 1436 aa26.62■■□□□ 1.85
GPS1-201ENST00000306823 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
GPS1-201ENST00000306823 FBLN2P98095 1184 aa26.6■■□□□ 1.85
GPS1-201ENST00000306823 MAPKBP1O60336 1514 aa26.59■■□□□ 1.85
GPS1-201ENST00000306823 PTPRKQ15262 1439 aa26.58■■□□□ 1.85
GPS1-201ENST00000306823 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GPS1-201ENST00000306823 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.54■■□□□ 1.84
GPS1-201ENST00000306823 JPH4Q96JJ6 628 aa26.53■■□□□ 1.84
GPS1-201ENST00000306823 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.53■■□□□ 1.84
GPS1-201ENST00000306823 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GPS1-201ENST00000306823 ARID3CA6NKF2 412 aa26.51■■□□□ 1.83
GPS1-201ENST00000306823 HFM1A2PYH4 1435 aa26.5■■□□□ 1.83
GPS1-201ENST00000306823 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.48■■□□□ 1.83
GPS1-201ENST00000306823 MIA2Q96PC5 1412 aa26.47■■□□□ 1.83
GPS1-201ENST00000306823 NAIPQ13075 1403 aa26.43■■□□□ 1.82
GPS1-201ENST00000306823 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GPS1-201ENST00000306823 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.41■■□□□ 1.82
GPS1-201ENST00000306823 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.36■■□□□ 1.81
GPS1-201ENST00000306823 UACAQ9BZF9 1416 aa26.35■■□□□ 1.81
GPS1-201ENST00000306823 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GPS1-201ENST00000306823 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.32■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 AKNAQ7Z591 1439 aa26.31■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 ABCA8O94911 1581 aa26.29■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 NEUROD1Q13562 356 aa26.29■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.28■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.28■■□□□ 1.8
GPS1-201ENST00000306823 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.24■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 MIER1Q8N108 512 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 CHD1O14646 1710 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 DAPK1P53355 1430 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.21■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 ATP10BO94823 1461 aa26.21■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 ABCC5O15440 1437 aa26.2■■□□□ 1.79
GPS1-201ENST00000306823 ROCK1Q13464 1354 aa26.19■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 PTPRGP23470 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 KIF14Q15058 1648 aa26.17■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.16■■□□□ 1.78
GPS1-201ENST00000306823 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
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