RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306666.9

PTGER3-201, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-201ENST00000306666 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
PTGER3-201ENST00000306666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.65■■■□□ 2.02
PTGER3-201ENST00000306666 IFT140Q96RY7 1462 aa27.63■■■□□ 2.01
PTGER3-201ENST00000306666 PBRM1Q86U86 1689 aa27.62■■■□□ 2.01
PTGER3-201ENST00000306666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PTGER3-201ENST00000306666 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.56■■■□□ 2
PTGER3-201ENST00000306666 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
PTGER3-201ENST00000306666 GRIN2BQ13224 1484 aa27.5■■□□□ 1.99
PTGER3-201ENST00000306666 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PTGER3-201ENST00000306666 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PTGER3-201ENST00000306666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.46■■□□□ 1.99
PTGER3-201ENST00000306666 ADAMTS12P58397 1594 aa27.45■■□□□ 1.98
PTGER3-201ENST00000306666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PTGER3-201ENST00000306666 P3H3Q8IVL6 736 aa27.41■■□□□ 1.98
PTGER3-201ENST00000306666 MAP3K1Q13233 1512 aa27.38■■□□□ 1.97
PTGER3-201ENST00000306666 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.37■■□□□ 1.97
PTGER3-201ENST00000306666 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.37■■□□□ 1.97
PTGER3-201ENST00000306666 TIAM1Q13009 1591 aa27.37■■□□□ 1.97
PTGER3-201ENST00000306666 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.33■■□□□ 1.97
PTGER3-201ENST00000306666 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.32■■□□□ 1.96
PTGER3-201ENST00000306666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.32■■□□□ 1.96
PTGER3-201ENST00000306666 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
PTGER3-201ENST00000306666 SAMD9Q5K651 1589 aa27.28■■□□□ 1.96
PTGER3-201ENST00000306666 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.27■■□□□ 1.96
PTGER3-201ENST00000306666 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PTGER3-201ENST00000306666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTGER3-201ENST00000306666 IQGAP2Q13576 1575 aa27.21■■□□□ 1.95
PTGER3-201ENST00000306666 ITGAEP38570 1179 aa27.21■■□□□ 1.95
PTGER3-201ENST00000306666 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PTGER3-201ENST00000306666 GRIN2AQ12879 1464 aa27.2■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.19■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 FMN1Q68DA7 1419 aa27.16■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.15■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.14■■□□□ 1.94
PTGER3-201ENST00000306666 SYNJ2O15056 1496 aa27.14■■□□□ 1.93
PTGER3-201ENST00000306666 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.14■■□□□ 1.93
PTGER3-201ENST00000306666 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
PTGER3-201ENST00000306666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTGER3-201ENST00000306666 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.11■■□□□ 1.93
PTGER3-201ENST00000306666 FBLN2P98095 1184 aa27.07■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 NEUROD1Q13562 356 aa27.07■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.07■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.06■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 CEP170Q5SW79 1584 aa27.04■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.02■■□□□ 1.92
PTGER3-201ENST00000306666 SETD5Q9C0A6 1442 aa27■■□□□ 1.91
PTGER3-201ENST00000306666 MIER1Q8N108 512 aa26.98■■□□□ 1.91
PTGER3-201ENST00000306666 DISP1Q96F81 1524 aa26.97■■□□□ 1.91
PTGER3-201ENST00000306666 NUP160Q12769 1436 aa26.97■■□□□ 1.91
PTGER3-201ENST00000306666 KIAA0556O60303 1618 aa26.94■■□□□ 1.9
PTGER3-201ENST00000306666 MAPKBP1O60336 1514 aa26.89■■□□□ 1.9
PTGER3-201ENST00000306666 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
PTGER3-201ENST00000306666 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.86■■□□□ 1.89
PTGER3-201ENST00000306666 JPH4Q96JJ6 628 aa26.85■■□□□ 1.89
PTGER3-201ENST00000306666 HECW1Q76N89 1606 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGER3-201ENST00000306666 CHD1O14646 1710 aa26.82■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.82■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.8■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.77■■□□□ 1.88
PTGER3-201ENST00000306666 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.76■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 NCOA2Q15596 1464 aa26.73■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.72■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.72■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 ARID3CA6NKF2 412 aa26.71■■□□□ 1.87
PTGER3-201ENST00000306666 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PTGER3-201ENST00000306666 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PTGER3-201ENST00000306666 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.69■■□□□ 1.86
PTGER3-201ENST00000306666 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.68■■□□□ 1.86
PTGER3-201ENST00000306666 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.65■■□□□ 1.86
PTGER3-201ENST00000306666 PTPRKQ15262 1439 aa26.63■■□□□ 1.85
PTGER3-201ENST00000306666 ARHGEF11O15085 1522 aa26.63■■□□□ 1.85
PTGER3-201ENST00000306666 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PTGER3-201ENST00000306666 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.6■■□□□ 1.85
PTGER3-201ENST00000306666 HFM1A2PYH4 1435 aa26.6■■□□□ 1.85
PTGER3-201ENST00000306666 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.57■■□□□ 1.84
PTGER3-201ENST00000306666 SHROOM2Q13796 1616 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGER3-201ENST00000306666 ABCA8O94911 1581 aa26.53■■□□□ 1.84
PTGER3-201ENST00000306666 NAIPQ13075 1403 aa26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-201ENST00000306666 UACAQ9BZF9 1416 aa26.52■■□□□ 1.84
PTGER3-201ENST00000306666 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PTGER3-201ENST00000306666 PTPRGP23470 1445 aa26.48■■□□□ 1.83
PTGER3-201ENST00000306666 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PTGER3-201ENST00000306666 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTGER3-201ENST00000306666 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.45■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.45■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 ATP10BO94823 1461 aa26.41■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 MIA2Q96PC5 1412 aa26.4■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 TONSLQ96HA7 1378 aa26.39■■□□□ 1.82
PTGER3-201ENST00000306666 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.39■■□□□ 1.81
PTGER3-201ENST00000306666 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.38■■□□□ 1.81
PTGER3-201ENST00000306666 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PTGER3-201ENST00000306666 KIF14Q15058 1648 aa26.34■■□□□ 1.81
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