RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.31■□□□□ 0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.29■□□□□ 0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CCNDBP1-201ENST00000300213 P3H3Q8IVL6 736 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 IL27Q8NEV9 243 aa20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCER2I3L3R5 266 aa20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.22■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-201ENST00000300213 TONSLQ96HA7 1378 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRS2Q9HD23 443 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-201ENST00000300213 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-201ENST00000300213 NEFMP07197 916 aa20.07■□□□□ 0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC184Q52MB2 194 aa20.06■□□□□ 0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR97A6NE52 1622 aa20.05■□□□□ 0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF21BO75037 1637 aa20.04■□□□□ 0.8
CCNDBP1-201ENST00000300213 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.99■□□□□ 0.79
CCNDBP1-201ENST00000300213 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMARCA2P51531 1590 aa19.94■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.9■□□□□ 0.78
CCNDBP1-201ENST00000300213 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.89■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 NACADO15069 1562 aa19.88■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.86■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARAP1Q96P48 1450 aa19.84■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARXQ96QS3 562 aa19.83■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.82■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC4A3P48751 1232 aa19.81■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAPKBP1O60336 1514 aa19.8■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYNJ1O43426 1573 aa19.8■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.8■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.8■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 FOXD1Q16676 465 aa19.78■□□□□ 0.76
CCNDBP1-201ENST00000300213 AKNAQ7Z591 1439 aa19.76■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARID3CA6NKF2 412 aa19.74■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.74■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMC1Q8TDI8 760 aa19.71■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 SKAP1Q86WV1 359 aa19.71■□□□□ 0.75
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.7■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMARCA4P51532 1647 aa19.67■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 PDE4AP27815 886 aa19.66■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.65■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUDCQ9Y266 331 aa19.65■□□□□ 0.74
CCNDBP1-201ENST00000300213 GSE1Q14687 1217 aa19.61■□□□□ 0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.6■□□□□ 0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF27Q86VH2 1401 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 PLIN1O60240 522 aa19.57■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.56■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 CUX2O14529 1486 aa19.54■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 NFKBIBQ15653 356 aa19.53■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.52■□□□□ 0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP35Q9P2H5 1018 aa19.52■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 RGS3P49796 1198 aa19.49■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.47■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRXQ9BXM0 1461 aa19.47■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.47■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.47■□□□□ 0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.45■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC7Q96M83 1385 aa19.45■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.45■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.45■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 BACH2Q9BYV9 841 aa19.44■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.43■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.41■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.4■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.4■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.4■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.4■□□□□ 0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.38■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.37■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.37■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.37■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 CRBNQ96SW2 442 aa19.34■□□□□ 0.69
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 UACAQ9BZF9 1416 aa19.33■□□□□ 0.68
CCNDBP1-201ENST00000300213 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.32■□□□□ 0.68
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