RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 CEP170Q5SW79 1584 aa40.46■■■■■ 4.07
NTN3-201ENST00000293973 NUP160Q12769 1436 aa40.45■■■■■ 4.07
NTN3-201ENST00000293973 CEP162Q5TB80 1403 aa40.35■■■■■ 4.05
NTN3-201ENST00000293973 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.35■■■■■ 4.05
NTN3-201ENST00000293973 IQGAP2Q13576 1575 aa40.33■■■■■ 4.05
NTN3-201ENST00000293973 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
NTN3-201ENST00000293973 CLIP1P30622 1438 aa40.23■■■■■ 4.03
NTN3-201ENST00000293973 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
NTN3-201ENST00000293973 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.12■■■■■ 4.01
NTN3-201ENST00000293973 OSCARQ8IYS5 282 aa40.11■■■■■ 4.01
NTN3-201ENST00000293973 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.09■■■■■ 4.01
NTN3-201ENST00000293973 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.08■■■■■ 4.01
NTN3-201ENST00000293973 JPH4Q96JJ6 628 aa40.06■■■■■ 4
NTN3-201ENST00000293973 SAMD9Q5K651 1589 aa40.05■■■■■ 4
NTN3-201ENST00000293973 SHROOM2Q13796 1616 aa40.01■■■■■ 4
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NTN3-201ENST00000293973 ARAP1Q96P48 1450 aa39.95■■■■□ 3.99
NTN3-201ENST00000293973 P3H3Q8IVL6 736 aa39.93■■■■□ 3.98
NTN3-201ENST00000293973 KIAA0556O60303 1618 aa39.93■■■■□ 3.98
NTN3-201ENST00000293973 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.9■■■■□ 3.98
NTN3-201ENST00000293973 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
NTN3-201ENST00000293973 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.88■■■■□ 3.97
NTN3-201ENST00000293973 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.77■■■■□ 3.96
NTN3-201ENST00000293973 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.75■■■■□ 3.95
NTN3-201ENST00000293973 FMN1Q68DA7 1419 aa39.7■■■■□ 3.95
NTN3-201ENST00000293973 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
NTN3-201ENST00000293973 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
NTN3-201ENST00000293973 PTPRGP23470 1445 aa39.56■■■■□ 3.92
NTN3-201ENST00000293973 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.51■■■■□ 3.92
NTN3-201ENST00000293973 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.5■■■■□ 3.91
NTN3-201ENST00000293973 ARHGEF11O15085 1522 aa39.48■■■■□ 3.91
NTN3-201ENST00000293973 PLB1Q6P1J6 1458 aa39.44■■■■□ 3.9
NTN3-201ENST00000293973 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.44■■■■□ 3.9
NTN3-201ENST00000293973 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
NTN3-201ENST00000293973 ABCA8O94911 1581 aa39.4■■■■□ 3.9
NTN3-201ENST00000293973 HECW1Q76N89 1606 aa39.39■■■■□ 3.9
NTN3-201ENST00000293973 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
NTN3-201ENST00000293973 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
NTN3-201ENST00000293973 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.36■■■■□ 3.89
NTN3-201ENST00000293973 UACAQ9BZF9 1416 aa39.32■■■■□ 3.89
NTN3-201ENST00000293973 APLP2Q06481 763 aa39.32■■■■□ 3.88
NTN3-201ENST00000293973 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.31■■■■□ 3.88
NTN3-201ENST00000293973 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
NTN3-201ENST00000293973 ABCC2Q92887 1545 aa39.24■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.24■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 MAP3K1Q13233 1512 aa39.23■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 TIAM1Q13009 1591 aa39.23■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.23■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.22■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa39.2■■■■□ 3.87
NTN3-201ENST00000293973 ARID3CA6NKF2 412 aa39.19■■■■□ 3.86
NTN3-201ENST00000293973 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
NTN3-201ENST00000293973 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.15■■■■□ 3.86
NTN3-201ENST00000293973 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
NTN3-201ENST00000293973 ATP10BO94823 1461 aa39.1■■■■□ 3.85
NTN3-201ENST00000293973 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.07■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.04■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.03■■■■□ 3.84
NTN3-201ENST00000293973 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
NTN3-201ENST00000293973 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.97■■■■□ 3.83
NTN3-201ENST00000293973 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.96■■■■□ 3.83
NTN3-201ENST00000293973 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
NTN3-201ENST00000293973 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.93■■■■□ 3.82
NTN3-201ENST00000293973 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.85■■■■□ 3.81
NTN3-201ENST00000293973 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
NTN3-201ENST00000293973 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.84■■■■□ 3.81
NTN3-201ENST00000293973 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.8■■■■□ 3.8
NTN3-201ENST00000293973 NCOA2Q15596 1464 aa38.72■■■■□ 3.79
NTN3-201ENST00000293973 ASXL2Q76L83 1435 aa38.7■■■■□ 3.79
NTN3-201ENST00000293973 KIF14Q15058 1648 aa38.7■■■■□ 3.79
NTN3-201ENST00000293973 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.69■■■■□ 3.78
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NTN3-201ENST00000293973 KCNH8Q96L42 1107 aa38.59■■■■□ 3.77
NTN3-201ENST00000293973 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.55■■■■□ 3.76
NTN3-201ENST00000293973 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.52■■■■□ 3.76
NTN3-201ENST00000293973 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.51■■■■□ 3.76
NTN3-201ENST00000293973 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.51■■■■□ 3.76
NTN3-201ENST00000293973 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.5■■■■□ 3.75
NTN3-201ENST00000293973 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
NTN3-201ENST00000293973 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.45■■■■□ 3.75
NTN3-201ENST00000293973 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.44■■■■□ 3.74
NTN3-201ENST00000293973 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
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NTN3-201ENST00000293973 FGD6Q6ZV73 1430 aa38.42■■■■□ 3.74
NTN3-201ENST00000293973 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.41■■■■□ 3.74
NTN3-201ENST00000293973 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.38■■■■□ 3.73
NTN3-201ENST00000293973 MIA2Q96PC5 1412 aa38.37■■■■□ 3.73
NTN3-201ENST00000293973 PREX2Q70Z35 1606 aa38.36■■■■□ 3.73
NTN3-201ENST00000293973 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.33■■■■□ 3.73
NTN3-201ENST00000293973 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
NTN3-201ENST00000293973 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.31■■■■□ 3.72
NTN3-201ENST00000293973 DIP2BQ9P265 1576 aa38.31■■■■□ 3.72
NTN3-201ENST00000293973 GLI2P10070 1586 aa38.28■■■■□ 3.72
NTN3-201ENST00000293973 PLCH2O75038 1416 aa38.27■■■■□ 3.72
NTN3-201ENST00000293973 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.25■■■■□ 3.71
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