RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.14■■■□□ 2.74
MALSU1-201ENST00000287543 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
MALSU1-201ENST00000287543 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.07■■■□□ 2.72
MALSU1-201ENST00000287543 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.06■■■□□ 2.72
MALSU1-201ENST00000287543 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.98■■■□□ 2.71
MALSU1-201ENST00000287543 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.86■■■□□ 2.69
MALSU1-201ENST00000287543 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.82■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 IQGAP2Q13576 1575 aa31.8■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 PTPRGP23470 1445 aa31.78■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.77■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.77■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 PRXQ9BXM0 1461 aa31.77■■■□□ 2.68
MALSU1-201ENST00000287543 EEA1Q15075 1411 aa31.73■■■□□ 2.67
MALSU1-201ENST00000287543 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.66■■■□□ 2.66
MALSU1-201ENST00000287543 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
MALSU1-201ENST00000287543 DISP1Q96F81 1524 aa31.62■■■□□ 2.65
MALSU1-201ENST00000287543 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.59■■■□□ 2.65
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGA3Q08378 1498 aa31.55■■■□□ 2.64
MALSU1-201ENST00000287543 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.54■■■□□ 2.64
MALSU1-201ENST00000287543 MAPKBP1O60336 1514 aa31.53■■■□□ 2.64
MALSU1-201ENST00000287543 UACAQ9BZF9 1416 aa31.52■■■□□ 2.64
MALSU1-201ENST00000287543 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.5■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.48■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.46■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 KIAA0556O60303 1618 aa31.46■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 ABCC2Q92887 1545 aa31.46■■■□□ 2.63
MALSU1-201ENST00000287543 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.43■■■□□ 2.62
MALSU1-201ENST00000287543 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.34■■■□□ 2.61
MALSU1-201ENST00000287543 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.32■■■□□ 2.6
MALSU1-201ENST00000287543 ASXL2Q76L83 1435 aa31.3■■■□□ 2.6
MALSU1-201ENST00000287543 DIP2BQ9P265 1576 aa31.27■■■□□ 2.6
MALSU1-201ENST00000287543 P3H3Q8IVL6 736 aa31.26■■■□□ 2.59
MALSU1-201ENST00000287543 KIF21BO75037 1637 aa31.24■■■□□ 2.59
MALSU1-201ENST00000287543 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.21■■■□□ 2.59
MALSU1-201ENST00000287543 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
MALSU1-201ENST00000287543 ABCA8O94911 1581 aa31.17■■■□□ 2.58
MALSU1-201ENST00000287543 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
MALSU1-201ENST00000287543 SAMD9Q5K651 1589 aa31.13■■■□□ 2.57
MALSU1-201ENST00000287543 GLI2P10070 1586 aa31.13■■■□□ 2.57
MALSU1-201ENST00000287543 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
MALSU1-201ENST00000287543 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
MALSU1-201ENST00000287543 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.08■■■□□ 2.57
MALSU1-201ENST00000287543 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.04■■■□□ 2.56
MALSU1-201ENST00000287543 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.03■■■□□ 2.56
MALSU1-201ENST00000287543 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.02■■■□□ 2.56
MALSU1-201ENST00000287543 KCNH8Q96L42 1107 aa31■■■□□ 2.55
MALSU1-201ENST00000287543 ATP10BO94823 1461 aa30.99■■■□□ 2.55
MALSU1-201ENST00000287543 ARID3CA6NKF2 412 aa30.97■■■□□ 2.55
MALSU1-201ENST00000287543 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
MALSU1-201ENST00000287543 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
MALSU1-201ENST00000287543 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.94■■■□□ 2.54
MALSU1-201ENST00000287543 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.91■■■□□ 2.54
MALSU1-201ENST00000287543 CD109Q6YHK3 1445 aa30.89■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 KDM6BO15054 1643 aa30.88■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.86■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 TSPOAP1O95153 1857 aa30.85■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 FMN1Q68DA7 1419 aa30.84■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.84■■■□□ 2.53
MALSU1-201ENST00000287543 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.82■■■□□ 2.52
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.8■■■□□ 2.52
MALSU1-201ENST00000287543 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
MALSU1-201ENST00000287543 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.73■■■□□ 2.51
MALSU1-201ENST00000287543 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
MALSU1-201ENST00000287543 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.7■■■□□ 2.51
MALSU1-201ENST00000287543 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
MALSU1-201ENST00000287543 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
MALSU1-201ENST00000287543 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.62■■■□□ 2.49
MALSU1-201ENST00000287543 HECW1Q76N89 1606 aa30.58■■■□□ 2.49
MALSU1-201ENST00000287543 CLIP1P30622 1438 aa30.57■■■□□ 2.48
MALSU1-201ENST00000287543 NEO1Q92859 1461 aa30.56■■■□□ 2.48
MALSU1-201ENST00000287543 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
MALSU1-201ENST00000287543 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.55■■■□□ 2.48
MALSU1-201ENST00000287543 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.52■■■□□ 2.48
MALSU1-201ENST00000287543 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.45■■■□□ 2.471e-10■■□□□ 13.6
MALSU1-201ENST00000287543 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.44■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.44■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 RAPGEF3O95398 923 aa30.4■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 PLCH2O75038 1416 aa30.39■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 AKNAQ7Z591 1439 aa30.39■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 FANCAO15360 1455 aa30.39■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.39■■■□□ 2.46
MALSU1-201ENST00000287543 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.37■■■□□ 2.45
MALSU1-201ENST00000287543 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
MALSU1-201ENST00000287543 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
MALSU1-201ENST00000287543 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.32■■■□□ 2.45
MALSU1-201ENST00000287543 CEP162Q5TB80 1403 aa30.32■■■□□ 2.44
MALSU1-201ENST00000287543 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.32■■■□□ 2.44
MALSU1-201ENST00000287543 KIF14Q15058 1648 aa30.29■■■□□ 2.44
MALSU1-201ENST00000287543 ADGRL1O94910 1474 aa30.27■■■□□ 2.44
MALSU1-201ENST00000287543 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.26■■■□□ 2.43
MALSU1-201ENST00000287543 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.22■■■□□ 2.43
MALSU1-201ENST00000287543 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.16■■■□□ 2.42
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.16■■■□□ 2.42
MALSU1-201ENST00000287543 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.15■■■□□ 2.42
MALSU1-201ENST00000287543 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.15■■■□□ 2.42
MALSU1-201ENST00000287543 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.14■■■□□ 2.42
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