RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP15-201ENST00000280377 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.63□□□□□ -1.03
USP15-201ENST00000280377 ITGAEP38570 1179 aa8.62□□□□□ -1.03
USP15-201ENST00000280377 CUL7Q14999 1698 aa8.61□□□□□ -1.03
USP15-201ENST00000280377 WDR62O43379 1518 aa8.59□□□□□ -1.03
USP15-201ENST00000280377 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 FBLN2P98095 1184 aa8.57□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 IFT140Q96RY7 1462 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 PBRM1Q86U86 1689 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 GRIN2BQ13224 1484 aa8.56□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.55□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 ARID3CA6NKF2 412 aa8.55□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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USP15-201ENST00000280377 ADAMTS12P58397 1594 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 TIAM1Q13009 1591 aa8.53□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
USP15-201ENST00000280377 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
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USP15-201ENST00000280377 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.5□□□□□ -1.05
USP15-201ENST00000280377 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.5□□□□□ -1.05
USP15-201ENST00000280377 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP15-201ENST00000280377 FMN1Q68DA7 1419 aa8.49□□□□□ -1.05
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USP15-201ENST00000280377 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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USP15-201ENST00000280377 GRIN2AQ12879 1464 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-201ENST00000280377 MAP3K1Q13233 1512 aa8.47□□□□□ -1.05
USP15-201ENST00000280377 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.47□□□□□ -1.05
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USP15-201ENST00000280377 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.45□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.44□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 JPH4Q96JJ6 628 aa8.44□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 SYNJ2O15056 1496 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 DISP1Q96F81 1524 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 CEP170Q5SW79 1584 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.42□□□□□ -1.06
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USP15-201ENST00000280377 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
USP15-201ENST00000280377 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.4□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 NCOA2Q15596 1464 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 KIAA0556O60303 1618 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 NUP160Q12769 1436 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
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USP15-201ENST00000280377 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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USP15-201ENST00000280377 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-201ENST00000280377 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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USP15-201ENST00000280377 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 CHD1O14646 1710 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 ARHGEF11O15085 1522 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 NEUROD1Q13562 356 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.3□□□□□ -1.08
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USP15-201ENST00000280377 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP15-201ENST00000280377 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.29□□□□□ -1.08
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USP15-201ENST00000280377 PTPRGP23470 1445 aa8.29□□□□□ -1.08
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USP15-201ENST00000280377 NAIPQ13075 1403 aa8.28□□□□□ -1.08
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USP15-201ENST00000280377 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.27□□□□□ -1.09
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USP15-201ENST00000280377 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
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USP15-201ENST00000280377 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 TRIM52Q96A61 297 aa8.24□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 KDM6BO15054 1643 aa8.24□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 FOXD1Q16676 465 aa8.24□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 ABCC5O15440 1437 aa8.23□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 KCNH8Q96L42 1107 aa8.23□□□□□ -1.09
USP15-201ENST00000280377 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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