RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.75■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.73■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 MAP3K1Q13233 1512 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC83-201ENST00000280245 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CCDC83-201ENST00000280245 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.66■■□□□ 1.54
CCDC83-201ENST00000280245 PBRM1Q86U86 1689 aa24.64■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.64■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.61■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.6■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 WDR62O43379 1518 aa24.6■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.58■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 SAMD9Q5K651 1589 aa24.58■■□□□ 1.53
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.55■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 FMN1Q68DA7 1419 aa24.55■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 ADAMTS12P58397 1594 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 IFT140Q96RY7 1462 aa24.53■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 GRIN2BQ13224 1484 aa24.52■■□□□ 1.52
CCDC83-201ENST00000280245 ITGAEP38570 1179 aa24.5■■□□□ 1.51
CCDC83-201ENST00000280245 ERCC6Q03468 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
CCDC83-201ENST00000280245 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CCDC83-201ENST00000280245 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.43■■□□□ 1.5
CCDC83-201ENST00000280245 IQGAP2Q13576 1575 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC83-201ENST00000280245 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CCDC83-201ENST00000280245 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CCDC83-201ENST00000280245 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCDC83-201ENST00000280245 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.35■■□□□ 1.49
CCDC83-201ENST00000280245 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.33■■□□□ 1.49
CCDC83-201ENST00000280245 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.32■■□□□ 1.48
CCDC83-201ENST00000280245 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CCDC83-201ENST00000280245 GRIN2AQ12879 1464 aa24.27■■□□□ 1.48
CCDC83-201ENST00000280245 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.27■■□□□ 1.48
CCDC83-201ENST00000280245 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.25■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.23■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 NCOA2Q15596 1464 aa24.23■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 HECW1Q76N89 1606 aa24.21■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.21■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CCDC83-201ENST00000280245 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.2■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 DISP1Q96F81 1524 aa24.19■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 KIAA0556O60303 1618 aa24.17■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.16■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 SYNJ2O15056 1496 aa24.15■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 MAPKBP1O60336 1514 aa24.15■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGEF11O15085 1522 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC83-201ENST00000280245 CEP170Q5SW79 1584 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC83-201ENST00000280245 ARID3CA6NKF2 412 aa24.13■■□□□ 1.45
CCDC83-201ENST00000280245 FBLN2P98095 1184 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC83-201ENST00000280245 PTPRKQ15262 1439 aa24.11■■□□□ 1.45
CCDC83-201ENST00000280245 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.05■■□□□ 1.44
CCDC83-201ENST00000280245 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CCDC83-201ENST00000280245 NUP160Q12769 1436 aa24.03■■□□□ 1.44
CCDC83-201ENST00000280245 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.01■■□□□ 1.43
CCDC83-201ENST00000280245 HFM1A2PYH4 1435 aa24■■□□□ 1.43
CCDC83-201ENST00000280245 JPH4Q96JJ6 628 aa23.96■■□□□ 1.43
CCDC83-201ENST00000280245 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CCDC83-201ENST00000280245 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.95■■□□□ 1.43
CCDC83-201ENST00000280245 NAIPQ13075 1403 aa23.95■■□□□ 1.42
CCDC83-201ENST00000280245 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.94■■□□□ 1.42
CCDC83-201ENST00000280245 MIA2Q96PC5 1412 aa23.91■■□□□ 1.42
CCDC83-201ENST00000280245 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.9■■□□□ 1.42
CCDC83-201ENST00000280245 NEUROD1Q13562 356 aa23.89■■□□□ 1.42
CCDC83-201ENST00000280245 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.87■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 MIER1Q8N108 512 aa23.86■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 UACAQ9BZF9 1416 aa23.86■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.85■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CCDC83-201ENST00000280245 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CCDC83-201ENST00000280245 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.79■■□□□ 1.4
CCDC83-201ENST00000280245 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CCDC83-201ENST00000280245 AKNAQ7Z591 1439 aa23.77■■□□□ 1.4
CCDC83-201ENST00000280245 KDM6BO15054 1643 aa23.76■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 ABCA8O94911 1581 aa23.75■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.75■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 CHD1O14646 1710 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 KIF14Q15058 1648 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 DAPK1P53355 1430 aa23.74■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 ABCC5O15440 1437 aa23.71■■□□□ 1.39
CCDC83-201ENST00000280245 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.7■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CCDC83-201ENST00000280245 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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