RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 PBRM1Q86U86 1689 aa22.37■■□□□ 1.17
NICN1-201ENST00000273598 GRIN2BQ13224 1484 aa22.37■■□□□ 1.17
NICN1-201ENST00000273598 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.34■■□□□ 1.17
NICN1-201ENST00000273598 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.34■■□□□ 1.17
NICN1-201ENST00000273598 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NICN1-201ENST00000273598 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NICN1-201ENST00000273598 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.28■■□□□ 1.16
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTS12P58397 1594 aa22.26■■□□□ 1.15
NICN1-201ENST00000273598 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.26■■□□□ 1.15
NICN1-201ENST00000273598 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NICN1-201ENST00000273598 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
NICN1-201ENST00000273598 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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NICN1-201ENST00000273598 FBLN2P98095 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
NICN1-201ENST00000273598 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NICN1-201ENST00000273598 FMN1Q68DA7 1419 aa22.15■■□□□ 1.14
NICN1-201ENST00000273598 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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NICN1-201ENST00000273598 TIAM1Q13009 1591 aa22.12■■□□□ 1.13
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NICN1-201ENST00000273598 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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NICN1-201ENST00000273598 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-201ENST00000273598 MAP3K1Q13233 1512 aa22.1■■□□□ 1.13
NICN1-201ENST00000273598 GRIN2AQ12879 1464 aa22.09■■□□□ 1.13
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NICN1-201ENST00000273598 CEP170Q5SW79 1584 aa21.93■■□□□ 1.1
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NICN1-201ENST00000273598 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.82■■□□□ 1.08
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NICN1-201ENST00000273598 CHD1O14646 1710 aa21.72■■□□□ 1.07
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NICN1-201ENST00000273598 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.71■■□□□ 1.07
NICN1-201ENST00000273598 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.71■■□□□ 1.07
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NICN1-201ENST00000273598 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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NICN1-201ENST00000273598 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NICN1-201ENST00000273598 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.67■■□□□ 1.06
NICN1-201ENST00000273598 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
NICN1-201ENST00000273598 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NICN1-201ENST00000273598 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.61■■□□□ 1.05
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NICN1-201ENST00000273598 PTPRGP23470 1445 aa21.59■■□□□ 1.05
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF11O15085 1522 aa21.59■■□□□ 1.05
NICN1-201ENST00000273598 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-201ENST00000273598 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.54■■□□□ 1.04
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.52■■□□□ 1.04
NICN1-201ENST00000273598 ABCA8O94911 1581 aa21.52■■□□□ 1.03
NICN1-201ENST00000273598 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NICN1-201ENST00000273598 MIA2Q96PC5 1412 aa21.49■■□□□ 1.03
NICN1-201ENST00000273598 PTPRKQ15262 1439 aa21.48■■□□□ 1.03
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NICN1-201ENST00000273598 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.47■■□□□ 1.03
NICN1-201ENST00000273598 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
NICN1-201ENST00000273598 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.44■■□□□ 1.02
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NICN1-201ENST00000273598 UACAQ9BZF9 1416 aa21.43■■□□□ 1.02
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NICN1-201ENST00000273598 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.41■■□□□ 1.02
NICN1-201ENST00000273598 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NICN1-201ENST00000273598 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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NICN1-201ENST00000273598 MAPKBP1O60336 1514 aa21.31■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 ABCC2Q92887 1545 aa21.3■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 NEUROD1Q13562 356 aa21.29■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.29■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 ABCC5O15440 1437 aa21.29■■□□□ 1
NICN1-201ENST00000273598 OSCARQ8IYS5 282 aa21.28■■□□□ 1
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