RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268042.6

ARRDC4-201, Transcript of arrestin domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC4, Length 4,072 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4-201ENST00000268042 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.9■□□□□ 0.94
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ARRDC4-201ENST00000268042 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.89■□□□□ 0.94
ARRDC4-201ENST00000268042 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.83■□□□□ 0.93
ARRDC4-201ENST00000268042 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.8■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 27.9
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ARRDC4-201ENST00000268042 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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ARRDC4-201ENST00000268042 CFTRP13569 1480 aa20.74■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 NBR1Q14596 966 aa20.74■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.72■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
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ARRDC4-201ENST00000268042 JPH4Q96JJ6 628 aa20.67■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
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ARRDC4-201ENST00000268042 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
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ARRDC4-201ENST00000268042 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.63■□□□□ 0.89
ARRDC4-201ENST00000268042 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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ARRDC4-201ENST00000268042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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ARRDC4-201ENST00000268042 TSPY10P0CW01 314 aa20.58■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.56■□□□□ 0.88
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ARRDC4-201ENST00000268042 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.5■□□□□ 0.87
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ARRDC4-201ENST00000268042 OSCARQ8IYS5 282 aa20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 CUX1P39880 1505 aa20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 TOPBP1Q92547 1522 aa20.48■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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ARRDC4-201ENST00000268042 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.41■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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ARRDC4-201ENST00000268042 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.37■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.36■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
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ARRDC4-201ENST00000268042 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.34■□□□□ 0.85
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ARRDC4-201ENST00000268042 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.31■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.31■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.3■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 RGL3Q3MIN7 710 aa20.28■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 PTPRGP23470 1445 aa20.27■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.25■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 GRIN2BQ13224 1484 aa20.25■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 TOP2BQ02880 1626 aa20.22■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 FMN1Q68DA7 1419 aa20.22■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.21■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.2■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.2■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 FOXD1Q16676 465 aa20.19■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 IFT140Q96RY7 1462 aa20.18■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.18■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 TONSLQ96HA7 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 GGT6Q6P531 493 aa20.16■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.11■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.09■□□□□ 0.81
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ARRDC4-201ENST00000268042 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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ARRDC4-201ENST00000268042 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.04■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.04■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 IL27Q8NEV9 243 aa20.03■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.02■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 PLEKHG5O94827 1062 aa19.98■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 KIF3BO15066 747 aa19.97■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 KIF21BO75037 1637 aa19.97■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ARRDC4-201ENST00000268042 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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