RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268042.6

ARRDC4-201, Transcript of arrestin domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC4, Length 4,072 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4-201ENST00000268042 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.9■□□□□ 0.94
ARRDC4-201ENST00000268042 EEA1Q15075 1411 aa20.9■□□□□ 0.94
ARRDC4-201ENST00000268042 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.89■□□□□ 0.94
ARRDC4-201ENST00000268042 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.83■□□□□ 0.93
ARRDC4-201ENST00000268042 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.8■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
ARRDC4-201ENST00000268042 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.918e-7■■■■■ 27.9
ARRDC4-201ENST00000268042 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.76■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.74■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 CFTRP13569 1480 aa20.74■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 NBR1Q14596 966 aa20.74■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.72■□□□□ 0.91
ARRDC4-201ENST00000268042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.68■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 JPH4Q96JJ6 628 aa20.67■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 HMGXB3Q12766 1538 aa20.65■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 IGF1RP08069 1367 aa20.64■□□□□ 0.9
ARRDC4-201ENST00000268042 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.63■□□□□ 0.89
ARRDC4-201ENST00000268042 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ARRDC4-201ENST00000268042 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.59■□□□□ 0.89
ARRDC4-201ENST00000268042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ARRDC4-201ENST00000268042 TSPY4P0CV99 314 aa20.58■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 TSPY10P0CW01 314 aa20.58■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.56■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.56■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 SYNJ1O43426 1573 aa20.55■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ARRDC4-201ENST00000268042 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.5■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 OSCARQ8IYS5 282 aa20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 CUX1P39880 1505 aa20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 TOPBP1Q92547 1522 aa20.48■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ARRDC4-201ENST00000268042 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.41■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ARRDC4-201ENST00000268042 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.39■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 ANP32CO43423 234 aa20.38■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.37■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.36■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.35■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 MSH5O43196 834 aa20.34■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.34■□□□□ 0.85
ARRDC4-201ENST00000268042 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 MLECQ14165 292 aa20.32■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.31■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.31■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.3■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 RGL3Q3MIN7 710 aa20.28■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 PTPRGP23470 1445 aa20.27■□□□□ 0.84
ARRDC4-201ENST00000268042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.25■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 GRIN2BQ13224 1484 aa20.25■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 TOP2BQ02880 1626 aa20.22■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 FMN1Q68DA7 1419 aa20.22■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.21■□□□□ 0.83
ARRDC4-201ENST00000268042 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.2■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.2■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 FOXD1Q16676 465 aa20.19■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 IFT140Q96RY7 1462 aa20.18■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.18■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 TONSLQ96HA7 1378 aa20.17■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 GGT6Q6P531 493 aa20.16■□□□□ 0.82
ARRDC4-201ENST00000268042 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.11■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.09■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 PRXQ9BXM0 1461 aa20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ARRDC4-201ENST00000268042 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ARAP1Q96P48 1450 aa20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.04■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.04■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 IL27Q8NEV9 243 aa20.03■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.02■□□□□ 0.8
ARRDC4-201ENST00000268042 PLEKHG5O94827 1062 aa19.98■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 KIF3BO15066 747 aa19.97■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 KIF21BO75037 1637 aa19.97■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ARRDC4-201ENST00000268042 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ARRDC4-201ENST00000268042 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms