RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267396.8

REM2-201, Transcript of RRAD and GEM like GTPase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene REM2, Length 1,923 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REM2-201ENST00000267396 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.31■■■□□ 2.44
REM2-201ENST00000267396 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
REM2-201ENST00000267396 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.28■■■□□ 2.44
REM2-201ENST00000267396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
REM2-201ENST00000267396 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
REM2-201ENST00000267396 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.22■■■□□ 2.43
REM2-201ENST00000267396 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.22■■■□□ 2.43
REM2-201ENST00000267396 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
REM2-201ENST00000267396 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.2■■■□□ 2.42
REM2-201ENST00000267396 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.17■■■□□ 2.42
REM2-201ENST00000267396 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.16■■■□□ 2.42
REM2-201ENST00000267396 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.15■■■□□ 2.42
REM2-201ENST00000267396 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.14■■■□□ 2.42
REM2-201ENST00000267396 SAMD9Q5K651 1589 aa30.12■■■□□ 2.41
REM2-201ENST00000267396 PBRM1Q86U86 1689 aa30.12■■■□□ 2.41
REM2-201ENST00000267396 FMN1Q68DA7 1419 aa30.1■■■□□ 2.41
REM2-201ENST00000267396 P3H3Q8IVL6 736 aa30.1■■■□□ 2.41
REM2-201ENST00000267396 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
REM2-201ENST00000267396 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.01■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.99■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 WDR62O43379 1518 aa29.97■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 ADAMTS12P58397 1594 aa29.97■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
REM2-201ENST00000267396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
REM2-201ENST00000267396 IFT140Q96RY7 1462 aa29.93■■■□□ 2.38
REM2-201ENST00000267396 GRIN2BQ13224 1484 aa29.92■■■□□ 2.38
REM2-201ENST00000267396 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
REM2-201ENST00000267396 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
REM2-201ENST00000267396 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.86■■■□□ 2.37
REM2-201ENST00000267396 IQGAP2Q13576 1575 aa29.85■■■□□ 2.37
REM2-201ENST00000267396 ITGAEP38570 1179 aa29.82■■■□□ 2.36
REM2-201ENST00000267396 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.8■■■□□ 2.36
REM2-201ENST00000267396 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.79■■■□□ 2.36
REM2-201ENST00000267396 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.75■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.73■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.72■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.72■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.71■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
REM2-201ENST00000267396 HECW1Q76N89 1606 aa29.7■■■□□ 2.34
REM2-201ENST00000267396 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
REM2-201ENST00000267396 ERCC6Q03468 1493 aa29.69■■■□□ 2.34
REM2-201ENST00000267396 MAPKBP1O60336 1514 aa29.65■■■□□ 2.34
REM2-201ENST00000267396 NCOA2Q15596 1464 aa29.65■■■□□ 2.34
REM2-201ENST00000267396 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.63■■■□□ 2.33
REM2-201ENST00000267396 ARHGEF11O15085 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
REM2-201ENST00000267396 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.61■■■□□ 2.33
REM2-201ENST00000267396 GRIN2AQ12879 1464 aa29.58■■■□□ 2.33
REM2-201ENST00000267396 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
REM2-201ENST00000267396 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.55■■■□□ 2.32
REM2-201ENST00000267396 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
REM2-201ENST00000267396 KIAA0556O60303 1618 aa29.53■■■□□ 2.32
REM2-201ENST00000267396 DISP1Q96F81 1524 aa29.5■■■□□ 2.31
REM2-201ENST00000267396 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.5■■■□□ 2.31
REM2-201ENST00000267396 HFM1A2PYH4 1435 aa29.46■■■□□ 2.31
REM2-201ENST00000267396 SYNJ2O15056 1496 aa29.45■■■□□ 2.31
REM2-201ENST00000267396 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
REM2-201ENST00000267396 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
REM2-201ENST00000267396 PTPRKQ15262 1439 aa29.42■■■□□ 2.3
REM2-201ENST00000267396 CEP170Q5SW79 1584 aa29.38■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.37■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.37■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 MIA2Q96PC5 1412 aa29.36■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 NAIPQ13075 1403 aa29.34■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 MIER1Q8N108 512 aa29.33■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
REM2-201ENST00000267396 UACAQ9BZF9 1416 aa29.32■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 NUP160Q12769 1436 aa29.31■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.29■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 AKNAQ7Z591 1439 aa29.28■■■□□ 2.28
REM2-201ENST00000267396 NEUROD1Q13562 356 aa29.26■■■□□ 2.27
REM2-201ENST00000267396 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.24■■■□□ 2.27
REM2-201ENST00000267396 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.21■■■□□ 2.27
REM2-201ENST00000267396 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
REM2-201ENST00000267396 ARID3CA6NKF2 412 aa29.14■■■□□ 2.26
REM2-201ENST00000267396 FBLN2P98095 1184 aa29.14■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 JPH4Q96JJ6 628 aa29.13■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.11■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.1■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.08■■■□□ 2.25
REM2-201ENST00000267396 ROCK1Q13464 1354 aa29.07■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.06■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 DAPK1P53355 1430 aa29.06■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.04■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 ABCA8O94911 1581 aa29.03■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 TONSLQ96HA7 1378 aa29.03■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 KDM6BO15054 1643 aa29.02■■■□□ 2.24
REM2-201ENST00000267396 ABCC5O15440 1437 aa29■■■□□ 2.23
REM2-201ENST00000267396 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms