RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-201ENST00000252771 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-201ENST00000252771 TIAM1Q13009 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-201ENST00000252771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 28.6
FCHO1-201ENST00000252771 PBRM1Q86U86 1689 aa25.76■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 WDR62O43379 1518 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 MAP3K1Q13233 1512 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 IFT140Q96RY7 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 SAMD9Q5K651 1589 aa25.66■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 ADAMTS12P58397 1594 aa25.64■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 GRIN2BQ13224 1484 aa25.62■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 ERCC6Q03468 1493 aa25.61■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-201ENST00000252771 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-201ENST00000252771 FMN1Q68DA7 1419 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-201ENST00000252771 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-201ENST00000252771 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.53■■□□□ 1.68
FCHO1-201ENST00000252771 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
FCHO1-201ENST00000252771 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.49■■□□□ 1.67
FCHO1-201ENST00000252771 IQGAP2Q13576 1575 aa25.48■■□□□ 1.67
FCHO1-201ENST00000252771 ITGAEP38570 1179 aa25.4■■□□□ 1.66
FCHO1-201ENST00000252771 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
FCHO1-201ENST00000252771 GRIN2AQ12879 1464 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-201ENST00000252771 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-201ENST00000252771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.32■■□□□ 1.64
FCHO1-201ENST00000252771 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
FCHO1-201ENST00000252771 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-201ENST00000252771 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-201ENST00000252771 DISP1Q96F81 1524 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.25■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 SYNJ2O15056 1496 aa25.25■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 HECW1Q76N89 1606 aa25.24■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 KIAA0556O60303 1618 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.639e-6■□□□□ 9.6
FCHO1-201ENST00000252771 CEP170Q5SW79 1584 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 NCOA2Q15596 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.21■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 ARHGEF11O15085 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 FBLN2P98095 1184 aa25.15■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.14■■□□□ 1.62
FCHO1-201ENST00000252771 NUP160Q12769 1436 aa25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 ARID3CA6NKF2 412 aa25.1■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 MAPKBP1O60336 1514 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 PTPRKQ15262 1439 aa25.09■■□□□ 1.61
FCHO1-201ENST00000252771 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
FCHO1-201ENST00000252771 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.05■■□□□ 1.6
FCHO1-201ENST00000252771 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.04■■□□□ 1.6
FCHO1-201ENST00000252771 JPH4Q96JJ6 628 aa25.02■■□□□ 1.6
FCHO1-201ENST00000252771 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-201ENST00000252771 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-201ENST00000252771 HFM1A2PYH4 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 NAIPQ13075 1403 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 MIA2Q96PC5 1412 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 CHD1O14646 1710 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-201ENST00000252771 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-201ENST00000252771 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FCHO1-201ENST00000252771 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 ABCA8O94911 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.81■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 UACAQ9BZF9 1416 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.78■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 NEUROD1Q13562 356 aa24.77■■□□□ 1.56
FCHO1-201ENST00000252771 KIF14Q15058 1648 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.75■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 AKNAQ7Z591 1439 aa24.74■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 KDM6BO15054 1643 aa24.74■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 ATP10BO94823 1461 aa24.73■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 DAPK1P53355 1430 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 ABCC5O15440 1437 aa24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 SHROOM2Q13796 1616 aa24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 PTPRGP23470 1445 aa24.68■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 MIER1Q8N108 512 aa24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms