RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.77■■□□□ 1.72
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FCHO1-201ENST00000252771 TIAM1Q13009 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-201ENST00000252771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 28.6
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FCHO1-201ENST00000252771 WDR62O43379 1518 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 MAP3K1Q13233 1512 aa25.75■■□□□ 1.71
FCHO1-201ENST00000252771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.74■■□□□ 1.71
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FCHO1-201ENST00000252771 IFT140Q96RY7 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
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FCHO1-201ENST00000252771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.65■■□□□ 1.7
FCHO1-201ENST00000252771 ADAMTS12P58397 1594 aa25.64■■□□□ 1.69
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FCHO1-201ENST00000252771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.32■■□□□ 1.64
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FCHO1-201ENST00000252771 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.26■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.25■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 SYNJ2O15056 1496 aa25.25■■□□□ 1.63
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FCHO1-201ENST00000252771 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 KIAA0556O60303 1618 aa25.23■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.639e-6■□□□□ 9.6
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FCHO1-201ENST00000252771 NCOA2Q15596 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.22■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.21■■□□□ 1.63
FCHO1-201ENST00000252771 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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FCHO1-201ENST00000252771 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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FCHO1-201ENST00000252771 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.97■■□□□ 1.59
FCHO1-201ENST00000252771 HFM1A2PYH4 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.94■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 NAIPQ13075 1403 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 MIA2Q96PC5 1412 aa24.91■■□□□ 1.58
FCHO1-201ENST00000252771 CHD1O14646 1710 aa24.86■■□□□ 1.57
FCHO1-201ENST00000252771 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.85■■□□□ 1.57
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FCHO1-201ENST00000252771 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.75■■□□□ 1.55
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FCHO1-201ENST00000252771 KDM6BO15054 1643 aa24.74■■□□□ 1.55
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FCHO1-201ENST00000252771 DAPK1P53355 1430 aa24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FCHO1-201ENST00000252771 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 ABCC5O15440 1437 aa24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 SHROOM2Q13796 1616 aa24.7■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 PTPRGP23470 1445 aa24.68■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.67■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 MIER1Q8N108 512 aa24.66■■□□□ 1.54
FCHO1-201ENST00000252771 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.66■■□□□ 1.54
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