RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.92■■■■□ 3.34
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CITED1-201ENST00000246139 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.72■■■■□ 3.31
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CITED1-201ENST00000246139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
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CITED1-201ENST00000246139 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CITED1-201ENST00000246139 IQGAP2Q13576 1575 aa35.33■■■■□ 3.25
CITED1-201ENST00000246139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.32■■■■□ 3.24
CITED1-201ENST00000246139 TSPOAP1O95153 1857 aa35.31■■■■□ 3.24
CITED1-201ENST00000246139 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.3■■■■□ 3.24
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CITED1-201ENST00000246139 DISP1Q96F81 1524 aa35.23■■■■□ 3.23
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CITED1-201ENST00000246139 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.14■■■■□ 3.22
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CITED1-201ENST00000246139 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.01■■■■□ 3.19
CITED1-201ENST00000246139 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.01■■■■□ 3.19
CITED1-201ENST00000246139 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.99■■■■□ 3.19
CITED1-201ENST00000246139 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
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CITED1-201ENST00000246139 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.88■■■■□ 3.17
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CITED1-201ENST00000246139 SAMD9Q5K651 1589 aa34.57■■■■□ 3.13
CITED1-201ENST00000246139 CD109Q6YHK3 1445 aa34.56■■■■□ 3.12
CITED1-201ENST00000246139 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.55■■■■□ 3.12
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CITED1-201ENST00000246139 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.29■■■■□ 3.08
CITED1-201ENST00000246139 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.29■■■■□ 3.08
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CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.16■■■■□ 3.06
CITED1-201ENST00000246139 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CITED1-201ENST00000246139 RAPGEF3O95398 923 aa34.14■■■■□ 3.06
CITED1-201ENST00000246139 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.11■■■■□ 3.05
CITED1-201ENST00000246139 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CITED1-201ENST00000246139 NEO1Q92859 1461 aa34.08■■■■□ 3.05
CITED1-201ENST00000246139 FMN1Q68DA7 1419 aa34.08■■■■□ 3.05
CITED1-201ENST00000246139 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.06■■■■□ 3.04
CITED1-201ENST00000246139 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.99■■■■□ 3.03
CITED1-201ENST00000246139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
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CITED1-201ENST00000246139 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
CITED1-201ENST00000246139 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.9■■■■□ 3.02
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CITED1-201ENST00000246139 RICTORQ6R327 1708 aa33.89■■■■□ 3.02
CITED1-201ENST00000246139 AKNAQ7Z591 1439 aa33.88■■■■□ 3.01
CITED1-201ENST00000246139 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.88■■■■□ 3.01
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CITED1-201ENST00000246139 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
CITED1-201ENST00000246139 CLIP1P30622 1438 aa33.86■■■■□ 3.01
CITED1-201ENST00000246139 MADDQ8WXG6 1647 aa33.82■■■■□ 3.01
CITED1-201ENST00000246139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3.01
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.82■■■■□ 3
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CITED1-201ENST00000246139 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.74■■■□□ 2.99
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CITED1-201ENST00000246139 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.71■■■□□ 2.99
CITED1-201ENST00000246139 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
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