RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 PBRM1Q86U86 1689 aa28.14■■■□□ 2.1
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HOXC11-201ENST00000243082 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
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HOXC11-201ENST00000243082 MAP3K1Q13233 1512 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXC11-201ENST00000243082 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.08■■■□□ 2.09
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
HOXC11-201ENST00000243082 GRIN2BQ13224 1484 aa28.07■■■□□ 2.08
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HOXC11-201ENST00000243082 SAMD9Q5K651 1589 aa27.99■■■□□ 2.07
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HOXC11-201ENST00000243082 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.95■■■□□ 2.06
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HOXC11-201ENST00000243082 FMN1Q68DA7 1419 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC11-201ENST00000243082 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.91■■■□□ 2.06
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HOXC11-201ENST00000243082 HECW1Q76N89 1606 aa27.55■■■□□ 2
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.55■■■□□ 2
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HOXC11-201ENST00000243082 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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HOXC11-201ENST00000243082 UACAQ9BZF9 1416 aa26.98■■□□□ 1.91
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HOXC11-201ENST00000243082 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 DAPK1P53355 1430 aa26.93■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC5O15440 1437 aa26.92■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.91■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
HOXC11-201ENST00000243082 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.88■■□□□ 1.89
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