RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000238558.4

GSC-201, Transcript of goosecoid homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GSC, Length 1,264 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC-201ENST00000238558 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.68■■■■■ 4.74
GSC-201ENST00000238558 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
GSC-201ENST00000238558 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
GSC-201ENST00000238558 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.57■■■■■ 4.73
GSC-201ENST00000238558 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.33■■■■■ 4.69
GSC-201ENST00000238558 IQGAP2Q13576 1575 aa44.2■■■■■ 4.67
GSC-201ENST00000238558 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.1■■■■■ 4.65
GSC-201ENST00000238558 PTPRGP23470 1445 aa44.06■■■■■ 4.64
GSC-201ENST00000238558 PRXQ9BXM0 1461 aa44.04■■■■■ 4.64
GSC-201ENST00000238558 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.03■■■■■ 4.64
GSC-201ENST00000238558 ADCY10Q96PN6 1610 aa44.02■■■■■ 4.64
GSC-201ENST00000238558 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.01■■■■■ 4.64
GSC-201ENST00000238558 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
GSC-201ENST00000238558 DISP1Q96F81 1524 aa43.98■■■■■ 4.63
GSC-201ENST00000238558 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.97■■■■■ 4.63
GSC-201ENST00000238558 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.89■■■■■ 4.62
GSC-201ENST00000238558 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.86■■■■■ 4.61
GSC-201ENST00000238558 MAPKBP1O60336 1514 aa43.85■■■■■ 4.61
GSC-201ENST00000238558 KIAA0556O60303 1618 aa43.8■■■■■ 4.6
GSC-201ENST00000238558 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.79■■■■■ 4.6
GSC-201ENST00000238558 EEA1Q15075 1411 aa43.78■■■■■ 4.6
GSC-201ENST00000238558 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.75■■■■■ 4.59
GSC-201ENST00000238558 UACAQ9BZF9 1416 aa43.73■■■■■ 4.59
GSC-201ENST00000238558 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.72■■■■■ 4.59
GSC-201ENST00000238558 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.71■■■■■ 4.59
GSC-201ENST00000238558 ABCC2Q92887 1545 aa43.71■■■■■ 4.59
GSC-201ENST00000238558 GOLGA3Q08378 1498 aa43.67■■■■■ 4.58
GSC-201ENST00000238558 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.66■■■■■ 4.58
GSC-201ENST00000238558 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
GSC-201ENST00000238558 DIP2BQ9P265 1576 aa43.63■■■■■ 4.58
GSC-201ENST00000238558 ASXL2Q76L83 1435 aa43.51■■■■■ 4.56
GSC-201ENST00000238558 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.5■■■■■ 4.55
GSC-201ENST00000238558 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
GSC-201ENST00000238558 P3H3Q8IVL6 736 aa43.4■■■■■ 4.54
GSC-201ENST00000238558 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
GSC-201ENST00000238558 ABCA8O94911 1581 aa43.37■■■■■ 4.53
GSC-201ENST00000238558 KIF21BO75037 1637 aa43.36■■■■■ 4.53
GSC-201ENST00000238558 SAMD9Q5K651 1589 aa43.32■■■■■ 4.52
GSC-201ENST00000238558 TSPOAP1O95153 1857 aa43.3■■■■■ 4.52
GSC-201ENST00000238558 GLI2P10070 1586 aa43.29■■■■■ 4.52
GSC-201ENST00000238558 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
GSC-201ENST00000238558 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
GSC-201ENST00000238558 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.18■■■■■ 4.5
GSC-201ENST00000238558 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.14■■■■■ 4.5
GSC-201ENST00000238558 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
GSC-201ENST00000238558 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.08■■■■■ 4.49
GSC-201ENST00000238558 ARID3CA6NKF2 412 aa43.08■■■■■ 4.49
GSC-201ENST00000238558 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
GSC-201ENST00000238558 KDM6BO15054 1643 aa43.08■■■■■ 4.49
GSC-201ENST00000238558 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.05■■■■■ 4.48
GSC-201ENST00000238558 ATP10BO94823 1461 aa43.05■■■■■ 4.48
GSC-201ENST00000238558 KCNH8Q96L42 1107 aa43.02■■■■■ 4.48
GSC-201ENST00000238558 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.01■■■■■ 4.48
GSC-201ENST00000238558 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.01■■■■■ 4.48
GSC-201ENST00000238558 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.91■■■■■ 4.46
GSC-201ENST00000238558 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
GSC-201ENST00000238558 CD109Q6YHK3 1445 aa42.87■■■■■ 4.45
GSC-201ENST00000238558 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.83■■■■■ 4.45
GSC-201ENST00000238558 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
GSC-201ENST00000238558 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
GSC-201ENST00000238558 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
GSC-201ENST00000238558 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.79■■■■■ 4.44
GSC-201ENST00000238558 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
GSC-201ENST00000238558 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.75■■■■■ 4.43
GSC-201ENST00000238558 FMN1Q68DA7 1419 aa42.64■■■■■ 4.42
GSC-201ENST00000238558 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.64■■■■■ 4.42
GSC-201ENST00000238558 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.63■■■■■ 4.41
GSC-201ENST00000238558 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
GSC-201ENST00000238558 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
GSC-201ENST00000238558 HECW1Q76N89 1606 aa42.47■■■■■ 4.39
GSC-201ENST00000238558 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.44■■■■■ 4.38
GSC-201ENST00000238558 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.44■■■■■ 4.38
GSC-201ENST00000238558 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.43■■■■■ 4.38
GSC-201ENST00000238558 NEO1Q92859 1461 aa42.37■■■■■ 4.37
GSC-201ENST00000238558 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
GSC-201ENST00000238558 CLIP1P30622 1438 aa42.31■■■■■ 4.36
GSC-201ENST00000238558 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
GSC-201ENST00000238558 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.29■■■■■ 4.36
GSC-201ENST00000238558 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.26■■■■■ 4.36
GSC-201ENST00000238558 RAPGEF3O95398 923 aa42.25■■■■■ 4.35
GSC-201ENST00000238558 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.23■■■■■ 4.35
GSC-201ENST00000238558 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
GSC-201ENST00000238558 ADGRL1O94910 1474 aa42.22■■■■■ 4.35
GSC-201ENST00000238558 FANCAO15360 1455 aa42.2■■■■■ 4.35
GSC-201ENST00000238558 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
GSC-201ENST00000238558 AKNAQ7Z591 1439 aa42.18■■■■■ 4.34
GSC-201ENST00000238558 PLCH2O75038 1416 aa42.13■■■■■ 4.34
GSC-201ENST00000238558 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.13■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.12■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.11■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.11■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 KIF14Q15058 1648 aa42.1■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
GSC-201ENST00000238558 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42■■■■■ 4.31
GSC-201ENST00000238558 RICTORQ6R327 1708 aa42■■■■■ 4.31
GSC-201ENST00000238558 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.99■■■■■ 4.31
GSC-201ENST00000238558 CEP162Q5TB80 1403 aa41.98■■■■■ 4.31
GSC-201ENST00000238558 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.94■■■■■ 4.3
GSC-201ENST00000238558 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.91■■■■■ 4.3
GSC-201ENST00000238558 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.87■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms