RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.71■■■□□ 2.35
RTKN-201ENST00000233330 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.69■■■□□ 2.34
RTKN-201ENST00000233330 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
RTKN-201ENST00000233330 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.66■■■□□ 2.34
RTKN-201ENST00000233330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
RTKN-201ENST00000233330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.61■■■□□ 2.33
RTKN-201ENST00000233330 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.6■■■□□ 2.33
RTKN-201ENST00000233330 PBRM1Q86U86 1689 aa29.59■■■□□ 2.33
RTKN-201ENST00000233330 P3H3Q8IVL6 736 aa29.57■■■□□ 2.32
RTKN-201ENST00000233330 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.56■■■□□ 2.32
RTKN-201ENST00000233330 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.54■■■□□ 2.32
RTKN-201ENST00000233330 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.53■■■□□ 2.32
RTKN-201ENST00000233330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.321e-6■■■■□ 20.2
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RTKN-201ENST00000233330 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.5■■■□□ 2.31
RTKN-201ENST00000233330 WDR62O43379 1518 aa29.48■■■□□ 2.31
RTKN-201ENST00000233330 FMN1Q68DA7 1419 aa29.45■■■□□ 2.31
RTKN-201ENST00000233330 ADAMTS12P58397 1594 aa29.43■■■□□ 2.3
RTKN-201ENST00000233330 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.41■■■□□ 2.3
RTKN-201ENST00000233330 IFT140Q96RY7 1462 aa29.4■■■□□ 2.3
RTKN-201ENST00000233330 GRIN2BQ13224 1484 aa29.38■■■□□ 2.29
RTKN-201ENST00000233330 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.37■■■□□ 2.29
RTKN-201ENST00000233330 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RTKN-201ENST00000233330 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
RTKN-201ENST00000233330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
RTKN-201ENST00000233330 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.3■■■□□ 2.28
RTKN-201ENST00000233330 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.3■■■□□ 2.28
RTKN-201ENST00000233330 IQGAP2Q13576 1575 aa29.29■■■□□ 2.28
RTKN-201ENST00000233330 ERCC6Q03468 1493 aa29.26■■■□□ 2.28
RTKN-201ENST00000233330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
RTKN-201ENST00000233330 ITGAEP38570 1179 aa29.22■■■□□ 2.27
RTKN-201ENST00000233330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
RTKN-201ENST00000233330 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
RTKN-201ENST00000233330 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.13■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.13■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.12■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 HECW1Q76N89 1606 aa29.09■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.08■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.08■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.08■■■□□ 2.25
RTKN-201ENST00000233330 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.07■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 GRIN2AQ12879 1464 aa29.07■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.06■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 NCOA2Q15596 1464 aa29.03■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
RTKN-201ENST00000233330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 KIAA0556O60303 1618 aa28.99■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 ARHGEF11O15085 1522 aa28.97■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.97■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 MAPKBP1O60336 1514 aa28.97■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 DISP1Q96F81 1524 aa28.96■■■□□ 2.23
RTKN-201ENST00000233330 SYNJ2O15056 1496 aa28.93■■■□□ 2.22
RTKN-201ENST00000233330 CEP170Q5SW79 1584 aa28.9■■■□□ 2.22
RTKN-201ENST00000233330 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
RTKN-201ENST00000233330 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.87■■■□□ 2.21
RTKN-201ENST00000233330 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
RTKN-201ENST00000233330 PTPRKQ15262 1439 aa28.82■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.81■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 HFM1A2PYH4 1435 aa28.78■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 NUP160Q12769 1436 aa28.78■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
RTKN-201ENST00000233330 FBLN2P98095 1184 aa28.72■■■□□ 2.19
RTKN-201ENST00000233330 MIA2Q96PC5 1412 aa28.71■■■□□ 2.19
RTKN-201ENST00000233330 ARID3CA6NKF2 412 aa28.7■■■□□ 2.19
RTKN-201ENST00000233330 NAIPQ13075 1403 aa28.7■■■□□ 2.18
RTKN-201ENST00000233330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
RTKN-201ENST00000233330 UACAQ9BZF9 1416 aa28.63■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.63■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 JPH4Q96JJ6 628 aa28.62■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.61■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.61■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 AKNAQ7Z591 1439 aa28.58■■■□□ 2.17
RTKN-201ENST00000233330 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
RTKN-201ENST00000233330 MIER1Q8N108 512 aa28.56■■■□□ 2.16
RTKN-201ENST00000233330 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.56■■■□□ 2.16
RTKN-201ENST00000233330 NEUROD1Q13562 356 aa28.54■■■□□ 2.16
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RTKN-201ENST00000233330 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.51■■■□□ 2.15
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RTKN-201ENST00000233330 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.49■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.48■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 CHD1O14646 1710 aa28.47■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.46■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 KDM6BO15054 1643 aa28.45■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 DAPK1P53355 1430 aa28.45■■■□□ 2.15
RTKN-201ENST00000233330 KIF14Q15058 1648 aa28.44■■■□□ 2.14
RTKN-201ENST00000233330 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
RTKN-201ENST00000233330 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
RTKN-201ENST00000233330 ABCC5O15440 1437 aa28.4■■■□□ 2.14
RTKN-201ENST00000233330 ROCK1Q13464 1354 aa28.4■■■□□ 2.14
RTKN-201ENST00000233330 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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