RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218230.5

PCSK1N-201, Transcript of proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCSK1N, Length 1,050 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1N-201ENST00000218230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
PCSK1N-201ENST00000218230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.35■■■■□ 3.41
PCSK1N-201ENST00000218230 JPH4Q96JJ6 628 aa36.35■■■■□ 3.41
PCSK1N-201ENST00000218230 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.34■■■■□ 3.41
PCSK1N-201ENST00000218230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.32■■■■□ 3.4
PCSK1N-201ENST00000218230 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.25■■■■□ 3.39
PCSK1N-201ENST00000218230 EEA1Q15075 1411 aa36.24■■■■□ 3.39
PCSK1N-201ENST00000218230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.14■■■■□ 3.38
PCSK1N-201ENST00000218230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.1■■■■□ 3.37
PCSK1N-201ENST00000218230 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.08■■■■□ 3.37
PCSK1N-201ENST00000218230 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.08■■■■□ 3.37
PCSK1N-201ENST00000218230 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.07■■■■□ 3.36
PCSK1N-201ENST00000218230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.06■■■■□ 3.36
PCSK1N-201ENST00000218230 PRXQ9BXM0 1461 aa36.05■■■■□ 3.36
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.03■■■■□ 3.36
PCSK1N-201ENST00000218230 MAPKBP1O60336 1514 aa36.01■■■■□ 3.36
PCSK1N-201ENST00000218230 DIP2BQ9P265 1576 aa35.98■■■■□ 3.35
PCSK1N-201ENST00000218230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
PCSK1N-201ENST00000218230 IQGAP2Q13576 1575 aa35.85■■■■□ 3.33
PCSK1N-201ENST00000218230 PTPRGP23470 1445 aa35.83■■■■□ 3.33
PCSK1N-201ENST00000218230 TSPOAP1O95153 1857 aa35.83■■■■□ 3.33
PCSK1N-201ENST00000218230 KDM6BO15054 1643 aa35.77■■■■□ 3.32
PCSK1N-201ENST00000218230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PCSK1N-201ENST00000218230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.75■■■■□ 3.31
PCSK1N-201ENST00000218230 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.75■■■■□ 3.31
PCSK1N-201ENST00000218230 KIF21BO75037 1637 aa35.75■■■■□ 3.31
PCSK1N-201ENST00000218230 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.72■■■■□ 3.31
PCSK1N-201ENST00000218230 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.69■■■■□ 3.3
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCC2Q92887 1545 aa35.66■■■■□ 3.3
PCSK1N-201ENST00000218230 ASXL2Q76L83 1435 aa35.6■■■■□ 3.29
PCSK1N-201ENST00000218230 DISP1Q96F81 1524 aa35.57■■■■□ 3.29
PCSK1N-201ENST00000218230 GOLGA3Q08378 1498 aa35.56■■■■□ 3.28
PCSK1N-201ENST00000218230 UACAQ9BZF9 1416 aa35.53■■■■□ 3.28
PCSK1N-201ENST00000218230 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.53■■■■□ 3.28
PCSK1N-201ENST00000218230 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.5■■■■□ 3.27
PCSK1N-201ENST00000218230 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.48■■■■□ 3.27
PCSK1N-201ENST00000218230 KIAA0556O60303 1618 aa35.47■■■■□ 3.27
PCSK1N-201ENST00000218230 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
PCSK1N-201ENST00000218230 GLI2P10070 1586 aa35.43■■■■□ 3.26
PCSK1N-201ENST00000218230 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PCSK1N-201ENST00000218230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PCSK1N-201ENST00000218230 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.37■■■■□ 3.25
PCSK1N-201ENST00000218230 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
PCSK1N-201ENST00000218230 SAMD9Q5K651 1589 aa35.32■■■■□ 3.24
PCSK1N-201ENST00000218230 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.29■■■■□ 3.24
PCSK1N-201ENST00000218230 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.27■■■■□ 3.24
PCSK1N-201ENST00000218230 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
PCSK1N-201ENST00000218230 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.22■■■■□ 3.23
PCSK1N-201ENST00000218230 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.21■■■■□ 3.23
PCSK1N-201ENST00000218230 ADGRL1O94910 1474 aa35.2■■■■□ 3.23
PCSK1N-201ENST00000218230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.17■■■■□ 3.22
PCSK1N-201ENST00000218230 P3H3Q8IVL6 736 aa35.11■■■■□ 3.21
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCA8O94911 1581 aa35.1■■■■□ 3.21
PCSK1N-201ENST00000218230 KCNH8Q96L42 1107 aa35.08■■■■□ 3.21
PCSK1N-201ENST00000218230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
PCSK1N-201ENST00000218230 ARID3CA6NKF2 412 aa35.03■■■■□ 3.2
PCSK1N-201ENST00000218230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.03■■■■□ 3.2
PCSK1N-201ENST00000218230 CD109Q6YHK3 1445 aa35.01■■■■□ 3.2
PCSK1N-201ENST00000218230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35■■■■□ 3.19
PCSK1N-201ENST00000218230 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.98■■■■□ 3.19
PCSK1N-201ENST00000218230 FMN1Q68DA7 1419 aa34.95■■■■□ 3.19
PCSK1N-201ENST00000218230 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.94■■■■□ 3.18
PCSK1N-201ENST00000218230 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.93■■■■□ 3.18
PCSK1N-201ENST00000218230 CLIP1P30622 1438 aa34.88■■■■□ 3.17
PCSK1N-201ENST00000218230 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.81■■■■□ 3.16
PCSK1N-201ENST00000218230 ATP10BO94823 1461 aa34.8■■■■□ 3.16
PCSK1N-201ENST00000218230 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PCSK1N-201ENST00000218230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.74■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 CEP162Q5TB80 1403 aa34.73■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 HECW1Q76N89 1606 aa34.7■■■■□ 3.15
PCSK1N-201ENST00000218230 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.66■■■■□ 3.14
PCSK1N-201ENST00000218230 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.65■■■■□ 3.14
PCSK1N-201ENST00000218230 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.64■■■■□ 3.14
PCSK1N-201ENST00000218230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.58■■■■□ 3.13
PCSK1N-201ENST00000218230 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.58■■■■□ 3.13
PCSK1N-201ENST00000218230 RAPGEF3O95398 923 aa34.56■■■■□ 3.12
PCSK1N-201ENST00000218230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PCSK1N-201ENST00000218230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PCSK1N-201ENST00000218230 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.53■■■■□ 3.12
PCSK1N-201ENST00000218230 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PCSK1N-201ENST00000218230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.49■■■■□ 3.11
PCSK1N-201ENST00000218230 NEO1Q92859 1461 aa34.49■■■■□ 3.11
PCSK1N-201ENST00000218230 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
PCSK1N-201ENST00000218230 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.45■■■■□ 3.11
PCSK1N-201ENST00000218230 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
PCSK1N-201ENST00000218230 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.39■■■■□ 3.1
PCSK1N-201ENST00000218230 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.39■■■■□ 3.1
PCSK1N-201ENST00000218230 PTPRMP28827 1452 aa34.39■■■■□ 3.1
PCSK1N-201ENST00000218230 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PCSK1N-201ENST00000218230 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.35■■■■□ 3.09
PCSK1N-201ENST00000218230 MADDQ8WXG6 1647 aa34.32■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.32■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.3■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 FANCAO15360 1455 aa34.3■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.3■■■■□ 3.08
PCSK1N-201ENST00000218230 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
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