RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000056233.3

NFE2L3-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L3, Length 3,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3-201ENST00000056233 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3-201ENST00000056233 SMARCA2P51531 1590 aa23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3-201ENST00000056233 MRS2Q9HD23 443 aa23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3-201ENST00000056233 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.27■■□□□ 1.32
NFE2L3-201ENST00000056233 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF21BO75037 1637 aa23.16■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 SMARCA4P51532 1647 aa23.15■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.14■■□□□ 1.3
NFE2L3-201ENST00000056233 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NFE2L3-201ENST00000056233 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3-201ENST00000056233 MSH5O43196 834 aa23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3-201ENST00000056233 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NFE2L3-201ENST00000056233 FOXD1Q16676 465 aa23.11■■□□□ 1.29
NFE2L3-201ENST00000056233 SYNJ1O43426 1573 aa23.08■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 CCER2I3L3R5 266 aa23.07■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF27Q86VH2 1401 aa23.05■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NFE2L3-201ENST00000056233 ARAP1Q96P48 1450 aa23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3-201ENST00000056233 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.01■■□□□ 1.27
NFE2L3-201ENST00000056233 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NFE2L3-201ENST00000056233 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NFE2L3-201ENST00000056233 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC184Q52MB2 194 aa22.94■■□□□ 1.26
NFE2L3-201ENST00000056233 WDR97A6NE52 1622 aa22.93■■□□□ 1.26
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NFE2L3-201ENST00000056233 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.9■■□□□ 1.26
NFE2L3-201ENST00000056233 CUX2O14529 1486 aa22.9■■□□□ 1.26
NFE2L3-201ENST00000056233 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NFE2L3-201ENST00000056233 TMC1Q8TDI8 760 aa22.89■■□□□ 1.25
NFE2L3-201ENST00000056233 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NFE2L3-201ENST00000056233 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.86■■□□□ 1.25
NFE2L3-201ENST00000056233 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.85■■□□□ 1.25
NFE2L3-201ENST00000056233 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3-201ENST00000056233 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 ARXQ96QS3 562 aa22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 NEFMP07197 916 aa22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.72■■□□□ 1.23
NFE2L3-201ENST00000056233 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.69■■□□□ 1.22
NFE2L3-201ENST00000056233 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NFE2L3-201ENST00000056233 PRXQ9BXM0 1461 aa22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.61■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 FBLN2P98095 1184 aa22.6■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 MAPKBP1O60336 1514 aa22.6■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 IGF1RP08069 1367 aa22.58■■□□□ 1.21
NFE2L3-201ENST00000056233 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.57■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.57■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 SLC4A3P48751 1232 aa22.56■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 IL27Q8NEV9 243 aa22.56■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 RGL3Q3MIN7 710 aa22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 AKNAQ7Z591 1439 aa22.54■■□□□ 1.2
NFE2L3-201ENST00000056233 PLIN1O60240 522 aa22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 NUDCQ9Y266 331 aa22.5■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 SKAP1Q86WV1 359 aa22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.49■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 RGS3P49796 1198 aa22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.48■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.45■■□□□ 1.19
NFE2L3-201ENST00000056233 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.43■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 FMN1Q68DA7 1419 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 TOP2BQ02880 1626 aa22.42■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 CUX1P39880 1505 aa22.41■■□□□ 1.18
NFE2L3-201ENST00000056233 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.39■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 CCDC7Q96M83 1385 aa22.38■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 TIAM1Q13009 1591 aa22.38■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.37■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.36■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 PDE4AP27815 886 aa22.35■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 PKD2Q13563 968 aa22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 UACAQ9BZF9 1416 aa22.34■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.33■■□□□ 1.17
NFE2L3-201ENST00000056233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.31■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
NFE2L3-201ENST00000056233 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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