RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224016.1

Ap3m1-208, Transcript of AP-3 complex subunit mu-1, mouse

BASIC

Gene Ap3m1, Length 764 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zbtb7b	Q64321	544 aa		11.01	□□□□□ -0.65
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm13697	A2AK42	830 aa		10.96	□□□□□ -0.65
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Atad2	Q8CDM1	1040 aa		10.96	□□□□□ -0.65
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	TMEM121B	Q99MX7	572 aa		10.96	□□□□□ -0.65
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Repin1	Q5U4E2	545 aa		10.95	□□□□□ -0.66
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fam117b	Q3U3E2	584 aa		10.94	□□□□□ -0.66
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pdap1	Q3UHX2	181 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Osbp	Q3B7Z2	805 aa		10.9	□□□□□ -0.66
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kiaa1522	A2A7S8	1013 aa		10.89	□□□□□ -0.67
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gm45233	A0A0N4SVE0	221 aa		10.85	□□□□□ -0.67
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ecm2	Q5FW85	670 aa		10.82	□□□□□ -0.68
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dmrta2	A2A9A2	531 aa		10.81	□□□□□ -0.68
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Spock2	Q9ER58	423 aa		10.77	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Arhgef1	Q61210	920 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf516	Q7TSH3	1157 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ndufv2	Q9D6J6	248 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tulp1	Q9Z273	543 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nacad	Q5SWP3	1504 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Znf579	Q80VM4	562 aa		10.71	□□□□□ -0.69
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Chrm1	P12657	460 aa		10.67	□□□□□ -0.7
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Bclaf1	Q8K019	919 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rnf225	Q9D7D1	332 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kdm5d	Q62240	1548 aa		10.65	□□□□□ -0.7
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kank4	Q6P9J5	1016 aa		10.65	□□□□□ -0.7
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pak3	Q61036	559 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zxdb	A2CE44	873 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lhx8	O35652	367 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Prim1	P20664	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ferd3l	Q923Z4	168 aa		10.61	□□□□□ -0.71
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	C1qbp	O35658	278 aa		10.57	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pcdhb17	Q91VD8	799 aa		10.57	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dcbld2	Q91ZV3	769 aa		10.57	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ppp6r1	Q7TSI3	856 aa		10.56	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Jph4	Q80WT0	628 aa		10.55	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sycp2	Q9CUU3	1500 aa		10.53	□□□□□ -0.72
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Timeless	Q9R1X4	1197 aa		10.5	□□□□□ -0.73
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fam181b	Q80VF6	417 aa		10.47	□□□□□ -0.73
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Bicra	F8VPZ9	1578 aa		10.44	□□□□□ -0.74
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Evi5	P97366	809 aa		10.41	□□□□□ -0.74
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Zbtb22	Q9Z0G7	638 aa		10.41	□□□□□ -0.74
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fndc3a	Q8BX90	1198 aa		10.38	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Prdm10	Q3UTQ7	1184 aa		10.37	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	St18	Q80TY4	1045 aa		10.37	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Thoc2	B1AZI6	1594 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Stk3	Q9JI10	497 aa		10.35	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Nap1l5	Q9JJF0	156 aa		10.35	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Scnn1b	Q9WU38	638 aa		10.35	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Krtap4-1	Q3UUY3	169 aa		10.34	□□□□□ -0.75
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016		E9Q0B3	247 aa		10.33	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dnajc5	P60904	198 aa		10.32	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Actn4	P57780	912 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pds5b	Q4VA53	1446 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Axin1	O35625	863 aa		10.29	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fkbp4	P30416	458 aa		10.29	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rsph6a	Q8CDR2	708 aa		10.29	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dkk1	O54908	272 aa		10.28	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dcaf1	Q80TR8	1506 aa		10.28	□□□□□ -0.76
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Msh5	Q9QUM7	833 aa		10.27	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc4a2	P13808	1237 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rgl2	Q61193	778 aa		10.23	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Psd	Q5DTT2	1024 aa		10.22	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Stk24	Q99KH8	431 aa		10.22	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ankrd65	F6YK91	380 aa		10.21	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Hmx1	O70218	332 aa		10.21	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Scarf1	Q5ND28	820 aa		10.21	□□□□□ -0.77
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Edaradd	Q8VHX2	208 aa		10.2	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mier1	Q5UAK0	511 aa		10.19	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ier5l	Q99J55	406 aa		10.19	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Stk25	Q9Z2W1	426 aa		10.19	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pdzrn4	E9PUZ9	1014 aa		10.18	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Tox2	A2A472	547 aa		10.17	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cc2d2a	Q8CFW7	1633 aa		10.17	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pelp1	Q9DBD5	1123 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Apba1	B2RUJ5	842 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Slc24a1	Q91WD8	1130 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Irx5	Q9JKQ4	484 aa		10.15	□□□□□ -0.78
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Otop3	Q80UF9	577 aa		10.13	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Uncx	O08934	530 aa		10.11	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Cypt1	Q8CH20	168 aa		10.1	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Adnp2	Q8CHC8	1165 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Erich4	Q3UNU4	136 aa		10.09	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Atad2b	E9Q166	1460 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Ercc6	F8VPZ5	1481 aa		10.07	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Lce6a	D3YV94	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Dnm1l	Q8K1M6	742 aa		10.07	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Gga1	Q8R0H9	635 aa		10.07	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Fam135a	Q6NS59	1506 aa		10.04	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Kdm2a	P59997	1161 aa		10.04	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Neurod1	Q60867	357 aa		10.04	□□□□□ -0.8
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Catip	B9EKE5	520 aa		10.02	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Pcdh10	E9PXQ7	1057 aa		10.02	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Rb1cc1	Q9ESK9	1588 aa		10.01	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sptlc1	O35704	473 aa		9.99	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Eln	P54320	860 aa		9.99	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sgip1	Q8VD37	806 aa		9.98	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Mnx1	Q9QZW9	404 aa		9.98	□□□□□ -0.81
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Baz1b	Q9Z277	1479 aa		9.96	□□□□□ -0.82
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Noa1	Q9JJG9	693 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Sall2	Q9QX96	1004 aa		9.94	□□□□□ -0.82
Ap3m1-208	ENSMUST00000224016	Thap8	E9Q695	213 aa		9.93	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.3 ms