RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176325.7

Apobec3-209, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 2,765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Il27Q8K3I6 234 aa10.14□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa10.14□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mrc2Q64449 1479 aa10.14□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Phf23Q8BSN5 401 aa10.14□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 NrdcQ8BHG1 1161 aa10.13□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pknox2Q8BG99 474 aa10.12□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ccdc18Q640L5 1455 aa10.12□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 UbtfP25976 765 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Znf710Q3U288 666 aa10.1□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Camsap1A2AHC3 1581 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Supt16hQ920B9 1047 aa10.09□□□□□ -0.79
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Plcd4Q8K3R3 807 aa10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-209ENSMUST00000176325 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Calr4Q3TQS0 420 aa10.02□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Grin2bQ01097 1482 aa10.02□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 NrkQ9R0G8 1455 aa9.99□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ccdc27Q3V036 639 aa9.98□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 PtprkP35822 1457 aa9.98□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Irx3P81067 507 aa9.97□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa9.97□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kcna4Q61423 654 aa9.97□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kif21aQ9QXL2 1672 aa9.97□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Npm2Q80W85 207 aa9.96□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Efcab5A0JP43 1406 aa9.96□□□□□ -0.81
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Duox2A2AQ99 1517 aa9.96□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Shroom4Q1W617 1475 aa9.95□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Stra8P70278 393 aa9.94□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rpap1Q80TE0 1409 aa9.92□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Dnajc5P60904 198 aa9.92□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pak3Q61036 559 aa9.92□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Cep162Q6ZQ06 1403 aa9.91□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ipo4Q8VI75 1082 aa9.91□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa9.91□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Plb1Q3TTY0 1478 aa9.91□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Washc2Q6PGL7 1334 aa9.9□□□□□ -0.82
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Crocc2F6XLV1 1638 aa9.9□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Liat1Q810M6 228 aa9.89□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Egfem1Q8C088 590 aa9.89□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arhgap35Q91YM2 1499 aa9.86□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa9.86□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa9.85□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Vsig10D3YX43 558 aa9.85□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Myt1lP97500 1187 aa9.85□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa9.85□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Samd9lQ69Z37 1561 aa9.84□□□□□ -0.83
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kcnn1Q9EQR3 537 aa9.83□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rad54l2Q99NG0 1466 aa9.82□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Disp1Q3TDN0 1521 aa9.82□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ift140E9PY46 1464 aa9.81□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Map3k1P53349 1493 aa9.81□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arid3aQ62431 601 aa9.8□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ipo9Q91YE6 1041 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Clip1Q922J3 1391 aa9.79□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 SynmQ70IV5 1561 aa9.78□□□□□ -0.84
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ccer2J3QPU5 274 aa9.77□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Carmil1Q6EDY6 1374 aa9.76□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Eid3Q3V124 375 aa9.76□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Magi3Q9EQJ9 1476 aa9.76□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Taok2Q6ZQ29 1240 aa9.75□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kdm5bQ80Y84 1544 aa9.75□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Grin2aP35436 1464 aa9.75□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Slc4a1apE9PX68 744 aa9.75□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pla2r1Q62028 1487 aa9.74□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Iqcf3Q9D498 203 aa9.72□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Zfp777B9EKF4 885 aa9.71□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 AampJ3QN89 436 aa9.69□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa9.68□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Eea1Q8BL66 1411 aa9.68□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Setd5Q5XJV7 1441 aa9.68□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rusc2Q80U22 1514 aa9.68□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 4933416C03RikQ3V063 378 aa9.68□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pdcl3Q8BVF2 240 aa9.67□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa9.66□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Cux1P53564 1515 aa9.66□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Setd1bQ8CFT2 1985 aa9.66□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 CadpsQ80TJ1 1355 aa9.65□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gpatch8A2A6A1 1505 aa9.65□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Slc24a1Q91WD8 1130 aa9.65□□□□□ -0.86
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.6 ms