RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zeb1Q64318 1117 aa38.93■■■■□ 3.82
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa38.88■■■■□ 3.81
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa38.64■■■■□ 3.78
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slx4Q6P1D7 1565 aa38.29■■■■□ 3.72
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Jph4Q80WT0 628 aa38.16■■■■□ 3.7
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38.15■■■■□ 3.7
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa38.15■■■■□ 3.7
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gab3Q8BSM5 595 aa38.14■■■■□ 3.7
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Clip1Q922J3 1391 aa37.88■■■■□ 3.65
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cux1P53564 1515 aa37.86■■■■□ 3.65
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arid3cA6PWV5 409 aa37.8■■■■□ 3.64
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cep162Q6ZQ06 1403 aa37.79■■■■□ 3.64
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ttc37F8VPK0 1563 aa37.73■■■■□ 3.63
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf608Q56A10 1511 aa37.65■■■■□ 3.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa37.64■■■■□ 3.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Depdc5P61460 1591 aa37.61■■■■□ 3.61
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa37.6■■■■□ 3.61
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Wdr7Q920I9 1489 aa37.59■■■■□ 3.61
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa37.55■■■■□ 3.6
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zfyve16Q80U44 1528 aa37.49■■■■□ 3.59
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ankrd26Q811D2 1581 aa37.43■■■■□ 3.58
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Atp10dQ8K2X1 1416 aa37.42■■■■□ 3.58
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arhgef11Q68FM7 1552 aa37.41■■■■□ 3.58
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fndc1E9Q043 1732 aa37.35■■■■□ 3.57
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mroh2aD3Z750 1679 aa37.35■■■■□ 3.57
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Aebp1Q640N1 1128 aa37.3■■■■□ 3.56
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa37.3■■■■□ 3.56
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kif27Q7M6Z4 1394 aa37.24■■■■□ 3.55
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fancd2Q80V62 1450 aa37.22■■■■□ 3.55
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arap1Q4LDD4 1452 aa37.12■■■■□ 3.53
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa37.05■■■■□ 3.52
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
Nelfe-202ENSMUST00000165953 A2mQ6GQT1 1474 aa37.02■■■■□ 3.52
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prex2Q3LAC4 1598 aa37.01■■■■□ 3.51
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pcf11G3X9Z4 1553 aa36.96■■■■□ 3.51
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Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eea1Q8BL66 1411 aa36.95■■■■□ 3.5
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