RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116376.8

Sh3bp5l-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp5l, Length 3,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Il27Q8K3I6 234 aa18.67■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Peg3Q3URU2 1571 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Slx4Q6P1D7 1565 aa18.63■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Carmil1Q6EDY6 1374 aa18.62■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cux2P70298 1426 aa18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CntlnA2AM05 1397 aa18.59■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fam135aQ6NS59 1506 aa18.58■□□□□ 0.57
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 BlmO88700 1416 aa18.56■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cux1P53564 1515 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Duox2A2AQ99 1517 aa18.53■□□□□ 0.56
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 SynmQ70IV5 1561 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fyco1Q8VDC1 1437 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rpap1Q80TE0 1409 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fhad1A6PWD2 1420 aa18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Samd9lQ69Z37 1561 aa18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ubl4bQ9CQ84 188 aa18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mia2Q91ZV0 1396 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 UacaQ8CGB3 1411 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccer2J3QPU5 274 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Vps8Q0P5W1 1427 aa18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Crocc2F6XLV1 1638 aa18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Eid3Q3V124 375 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kif21aQ9QXL2 1672 aa18.35■□□□□ 0.53
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Csrnp3P59055 597 aa18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Naip2Q9QUK4 1447 aa18.33■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa18.32■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Aebp1Q640N1 1128 aa18.31■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Camsap2Q8C1B1 1461 aa18.3■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Aplp2Q06335 707 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa18.29■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fhod3Q76LL6 1578 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abca5Q8K448 1642 aa18.27■□□□□ 0.52
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cul7Q8VE73 1689 aa18.25■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rad54l2Q99NG0 1466 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pla2r1Q62028 1487 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lmod2Q3UHZ5 550 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 A2mQ6GQT1 1474 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gcc2Q8CHG3 1679 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gpatch8A2A6A1 1505 aa18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Magi3Q9EQJ9 1476 aa18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CadpsQ80TJ1 1355 aa18.17■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Gm13697A2AK42 830 aa18.16■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Adamts12Q811B3 1600 aa18.15■□□□□ 0.5
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ccnb3Q810T2 1396 aa18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 CenpbP27790 599 aa18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mrc2Q64449 1479 aa18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Tnnt3Q9QZ47 272 aa18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 NclP09405 707 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rfx7F8VPJ6 1459 aa18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Grin2aP35436 1464 aa18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Naip5Q9R016 1403 aa18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Setbp1Q9Z180 1582 aa18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Soga1E1U8D0 1418 aa18.08■□□□□ 0.49
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kif27Q7M6Z4 1394 aa18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ncoa2Q61026 1462 aa18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 NexmifQ5DTT1 1515 aa18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 WizO88286 1684 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 BC005561E9Q5E2 1589 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Disp1Q3TDN0 1521 aa18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Stra8P70278 393 aa18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Myt1Q8CFC2 1127 aa18■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Setd1bQ8CFT2 1985 aa17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Plb1Q3TTY0 1478 aa17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Pprc1Q6NZN1 1644 aa17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Ift140E9PY46 1464 aa17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abca16E9PWJ7 1678 aa17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Znf710Q3U288 666 aa17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 PxdnQ3UQ28 1475 aa17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mug1P28665 1476 aa17.92■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Kif21bQ9QXL1 1668 aa17.9■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Abcc5Q9R1X5 1436 aa17.89■□□□□ 0.46
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Mphosph9A6H5Y1 991 aa17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Chic2Q9D9G3 165 aa17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa17.88■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 Plekhh2Q8C115 1491 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms