RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Carmil1Q6EDY6 1374 aa49.51■■■■■ 5.52
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clip1Q922J3 1391 aa49.28■■■■■ 5.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adamts12Q811B3 1600 aa49.27■■■■■ 5.48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa49.23■■■■■ 5.47
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Myt1lP97500 1187 aa49.2■■■■■ 5.47
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc2Q8VI47 1543 aa49.07■■■■■ 5.45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CadpsQ80TJ1 1355 aa49.07■■■■■ 5.45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgap27A2AB59 869 aa49.06■■■■■ 5.44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rpap1Q80TE0 1409 aa49.06■■■■■ 5.44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AknaQ80VW7 1404 aa49.02■■■■■ 5.44
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cux1P53564 1515 aa48.93■■■■■ 5.42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col17a1Q07563 1470 aa48.9■■■■■ 5.42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Soga1E1U8D0 1418 aa48.89■■■■■ 5.42
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep170Q6A065 1588 aa48.53■■■■■ 5.36
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setd5Q5XJV7 1441 aa48.52■■■■■ 5.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Jph4Q80WT0 628 aa48.5■■■■■ 5.36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eea1Q8BL66 1411 aa48.5■■■■■ 5.35
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrl3Q80TS3 1537 aa48.37■■■■■ 5.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm156Q58A37 223 aa48.37■■■■■ 5.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aebp1Q640N1 1128 aa48.36■■■■■ 5.33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PtprtQ99M80 1454 aa48.34■■■■■ 5.33
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcf11G3X9Z4 1553 aa48.12■■■■■ 5.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif27Q7M6Z4 1394 aa48.08■■■■■ 5.29
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CntlnA2AM05 1397 aa47.97■■■■■ 5.27
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igf1rQ60751 1373 aa47.93■■■■■ 5.26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa47.93■■■■■ 5.26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncoa2Q61026 1462 aa47.89■■■■■ 5.26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setbp1Q9Z180 1582 aa47.85■■■■■ 5.25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pprc1Q6NZN1 1644 aa47.76■■■■■ 5.24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa47.75■■■■■ 5.24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mroh2aD3Z750 1679 aa47.73■■■■■ 5.23
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Naip1Q9QWK5 1403 aa47.7■■■■■ 5.23
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Peg3Q3URU2 1571 aa47.66■■■■■ 5.22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef11Q68FM7 1552 aa47.66■■■■■ 5.22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tiam1Q60610 1591 aa47.64■■■■■ 5.22
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gcc2Q8CHG3 1679 aa47.58■■■■■ 5.21
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arid3cA6PWV5 409 aa47.45■■■■■ 5.19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa47.44■■■■■ 5.18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa47.39■■■■■ 5.18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa47.38■■■■■ 5.18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prex2Q3LAC4 1598 aa47.38■■■■■ 5.17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa47.35■■■■■ 5.17
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