RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Carmil1Q6EDY6 1374 aa49,51■■■■■ 5,52
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP49,46■■■■■ 5,51
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fgd6Q69ZL1 1399 aa49,4■■■■■ 5,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP49,39■■■■■ 5,5
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clip1Q922J3 1391 aa49,28■■■■■ 5,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adamts12Q811B3 1600 aa49,27■■■■■ 5,48
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa49,23■■■■■ 5,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP49,2■■■■■ 5,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 WizO88286 1684 aaKnown RBP49,2■■■■■ 5,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Myt1lP97500 1187 aa49,2■■■■■ 5,47
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca16E9PWJ7 1678 aa49,15■■■■■ 5,46
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP49,14■■■■■ 5,46
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PxdnQ3UQ28 1475 aa49,13■■■■■ 5,46
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc2Q8VI47 1543 aa49,07■■■■■ 5,45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CadpsQ80TJ1 1355 aa49,07■■■■■ 5,45
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgap27A2AB59 869 aa49,06■■■■■ 5,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rpap1Q80TE0 1409 aa49,06■■■■■ 5,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AknaQ80VW7 1404 aa49,02■■■■■ 5,44
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa48,99■■■■■ 5,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP48,97■■■■■ 5,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dnajc5P60904 198 aa48,97■■■■■ 5,43
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map3k4O08648 1597 aa48,93■■■■■ 5,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cux1P53564 1515 aa48,93■■■■■ 5,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col17a1Q07563 1470 aa48,9■■■■■ 5,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Soga1E1U8D0 1418 aa48,89■■■■■ 5,42
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fyco1Q8VDC1 1437 aa48,85■■■■■ 5,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abcc1O35379 1528 aa48,85■■■■■ 5,41
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca5Q8K448 1642 aa48,79■■■■■ 5,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Neo1P97798 1493 aa48,78■■■■■ 5,4
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC005561E9Q5E2 1589 aa48,74■■■■■ 5,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slx4Q6P1D7 1565 aa48,72■■■■■ 5,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP48,7■■■■■ 5,39
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa48,68■■■■■ 5,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ankrd26Q811D2 1581 aa48,66■■■■■ 5,38
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm14025A2AP89 1413 aa48,62■■■■■ 5,37
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Chd1P40201 1711 aa48,59■■■■■ 5,37
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 WrnO09053 1401 aa48,56■■■■■ 5,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cep170Q6A065 1588 aa48,53■■■■■ 5,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP48,53■■■■■ 5,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setd5Q5XJV7 1441 aa48,52■■■■■ 5,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Jph4Q80WT0 628 aa48,5■■■■■ 5,36
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eea1Q8BL66 1411 aa48,5■■■■■ 5,35
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP48,43■■■■■ 5,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Erich3F6QRE9 1637 aa48,39■■■■■ 5,34
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrl3Q80TS3 1537 aa48,37■■■■■ 5,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm156Q58A37 223 aa48,37■■■■■ 5,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aebp1Q640N1 1128 aa48,36■■■■■ 5,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PtprtQ99M80 1454 aa48,34■■■■■ 5,33
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP48,23■■■■■ 5,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP48,22■■■■■ 5,31
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BlmO88700 1416 aa48,17■■■■■ 5,3
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arap1Q4LDD4 1452 aa48,13■■■■■ 5,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pcf11G3X9Z4 1553 aa48,12■■■■■ 5,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa48,11■■■■■ 5,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa48,11■■■■■ 5,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kif27Q7M6Z4 1394 aa48,08■■■■■ 5,29
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 AI481877A2ALV5 1481 aa48,05■■■■■ 5,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP48,04■■■■■ 5,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm5bQ80Y84 1544 aa48,01■■■■■ 5,28
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa47,99■■■■■ 5,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CntlnA2AM05 1397 aa47,97■■■■■ 5,27
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa47,93■■■■■ 5,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Igf1rQ60751 1373 aa47,93■■■■■ 5,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa47,93■■■■■ 5,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncoa2Q61026 1462 aa47,89■■■■■ 5,26
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Setbp1Q9Z180 1582 aa47,85■■■■■ 5,25
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pprc1Q6NZN1 1644 aa47,76■■■■■ 5,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa47,75■■■■■ 5,24
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mroh2aD3Z750 1679 aa47,73■■■■■ 5,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa47,71■■■■■ 5,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Naip1Q9QWK5 1403 aa47,7■■■■■ 5,23
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NhsB1AV60 1647 aa47,69■■■■■ 5,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Magi1Q6RHR9 1471 aa47,66■■■■■ 5,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Peg3Q3URU2 1571 aa47,66■■■■■ 5,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arhgef11Q68FM7 1552 aa47,66■■■■■ 5,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tiam1Q60610 1591 aa47,64■■■■■ 5,22
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fancd2Q80V62 1450 aa47,62■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa47,62■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cul7Q8VE73 1689 aa47,61■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa47,6■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ncoa3O09000 1398 aa47,59■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Wdr7Q920I9 1489 aa47,58■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ak9G3UYQ4 1894 aa47,58■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gcc2Q8CHG3 1679 aa47,58■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam163aQ8CAA5 168 aa47,57■■■■■ 5,21
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mug1P28665 1476 aa47,55■■■■■ 5,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa47,52■■■■■ 5,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP47,52■■■■■ 5,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Lmod2Q3UHZ5 550 aa47,52■■■■■ 5,2
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atp10dQ8K2X1 1416 aa47,5■■■■■ 5,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf608Q56A10 1511 aa47,49■■■■■ 5,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arid3cA6PWV5 409 aa47,45■■■■■ 5,19
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa47,44■■■■■ 5,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa47,39■■■■■ 5,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa47,38■■■■■ 5,18
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Prex2Q3LAC4 1598 aa47,38■■■■■ 5,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa47,35■■■■■ 5,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP47,35■■■■■ 5,17
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Abca8bQ8K440 1620 aa47,3■■■■■ 5,16
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa47,28■■■■■ 5,16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,3 ms