RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029165.3

1110008F13Rik-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene 1110008F13Rik, Length 1,045 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa43,02■■■■■ 4,48
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Shroom4Q1W617 1475 aa43,01■■■■■ 4,48
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 SynmQ70IV5 1561 aa43■■■■■ 4,47
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abcc1O35379 1528 aa43■■■■■ 4,47
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 PtprtQ99M80 1454 aa42,97■■■■■ 4,47
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Chd1P40201 1711 aa42,84■■■■■ 4,45
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 CadpsQ80TJ1 1355 aa42,83■■■■■ 4,45
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP42,8■■■■■ 4,44
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Zeb1Q64318 1117 aa42,8■■■■■ 4,44
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP42,73■■■■■ 4,43
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa42,7■■■■■ 4,43
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Chic1Q8CBW7 227 aa42,7■■■■■ 4,43
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Soga1E1U8D0 1418 aa42,68■■■■■ 4,42
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Pprc1Q6NZN1 1644 aa42,68■■■■■ 4,42
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abca16E9PWJ7 1678 aa42,65■■■■■ 4,42
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa42,63■■■■■ 4,41
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Neo1P97798 1493 aa42,61■■■■■ 4,41
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgap27A2AB59 869 aa42,58■■■■■ 4,41
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 WizO88286 1684 aaKnown RBP42,57■■■■■ 4,4
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abcc2Q8VI47 1543 aa42,56■■■■■ 4,4
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 BC005561E9Q5E2 1589 aa42,56■■■■■ 4,4
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Map3k4O08648 1597 aa42,56■■■■■ 4,4
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 PxdnQ3UQ28 1475 aa42,49■■■■■ 4,39
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gm14025A2AP89 1413 aa42,49■■■■■ 4,39
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Adamts12Q811B3 1600 aa42,48■■■■■ 4,39
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Setbp1Q9Z180 1582 aa42,45■■■■■ 4,39
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP42,44■■■■■ 4,38
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa42,39■■■■■ 4,38
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Npm2Q80W85 207 aa42,34■■■■■ 4,37
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ak9G3UYQ4 1894 aa42,32■■■■■ 4,37
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 AI481877A2ALV5 1481 aa42,3■■■■■ 4,36
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP42,3■■■■■ 4,36
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa42,28■■■■■ 4,36
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Slx4Q6P1D7 1565 aa42,23■■■■■ 4,35
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP42,23■■■■■ 4,35
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rpap1Q80TE0 1409 aa42,13■■■■■ 4,34
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Carmil1Q6EDY6 1374 aa42,11■■■■■ 4,33
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa42,1■■■■■ 4,33
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Jph4Q80WT0 628 aa42,04■■■■■ 4,32
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa42,04■■■■■ 4,32
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Map3k1P53349 1493 aa42,01■■■■■ 4,32
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP41,92■■■■■ 4,3
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abca5Q8K448 1642 aa41,92■■■■■ 4,3
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP41,9■■■■■ 4,3
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP41,88■■■■■ 4,29
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 AdgbG3UZ78 1657 aa41,85■■■■■ 4,29
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgap35Q91YM2 1499 aa41,84■■■■■ 4,29
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ttc37F8VPK0 1563 aa41,81■■■■■ 4,28
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP41,8■■■■■ 4,28
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 WrnO09053 1401 aa41,78■■■■■ 4,28
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa41,74■■■■■ 4,27
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Igf1rQ60751 1373 aa41,73■■■■■ 4,27
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arid3cA6PWV5 409 aa41,72■■■■■ 4,27
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa41,69■■■■■ 4,26
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kdm5bQ80Y84 1544 aa41,67■■■■■ 4,26
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa41,67■■■■■ 4,26
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gab3Q8BSM5 595 aa41,62■■■■■ 4,25
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Depdc5P61460 1591 aa41,61■■■■■ 4,25
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cux1P53564 1515 aa41,59■■■■■ 4,25
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgef11Q68FM7 1552 aa41,59■■■■■ 4,25
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Clip1Q922J3 1391 aa41,56■■■■■ 4,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Znf608Q56A10 1511 aa41,54■■■■■ 4,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Wdr7Q920I9 1489 aa41,53■■■■■ 4,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Zfyve16Q80U44 1528 aa41,51■■■■■ 4,24
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fyco1Q8VDC1 1437 aa41,49■■■■■ 4,23
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 NhsB1AV60 1647 aa41,43■■■■■ 4,22
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa41,42■■■■■ 4,22
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cul7Q8VE73 1689 aa41,42■■■■■ 4,22
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa41,39■■■■■ 4,22
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fndc1E9Q043 1732 aa41,38■■■■■ 4,21
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Cep162Q6ZQ06 1403 aa41,35■■■■■ 4,21
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Myt1lP97500 1187 aa41,29■■■■■ 4,2
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Atp10dQ8K2X1 1416 aa41,28■■■■■ 4,2
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Alpk3Q924C5 1678 aa41,28■■■■■ 4,2
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Plppr3Q7TPB0 716 aa41,27■■■■■ 4,2
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 AglF8VPN4 1532 aa41,2■■■■■ 4,19
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Gcc2Q8CHG3 1679 aa41,17■■■■■ 4,18
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Mroh2aD3Z750 1679 aa41,13■■■■■ 4,18
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 HrcG5E8J6 738 aa41,09■■■■■ 4,17
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ncoa2Q61026 1462 aa41,08■■■■■ 4,17
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa41,07■■■■■ 4,16
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Ankrd26Q811D2 1581 aa41,06■■■■■ 4,16
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa41,06■■■■■ 4,16
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Fancd2Q80V62 1450 aa41,02■■■■■ 4,16
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Abca8bQ8K440 1620 aa41,01■■■■■ 4,16
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 BlmO88700 1416 aa40,98■■■■■ 4,15
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Dnajc5gQ8C632 165 aa40,97■■■■■ 4,15
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Rnf17Q99MV7 1640 aa40,95■■■■■ 4,15
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Aebp1Q640N1 1128 aa40,93■■■■■ 4,14
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kif27Q7M6Z4 1394 aa40,93■■■■■ 4,14
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Arap1Q4LDD4 1452 aa40,9■■■■■ 4,14
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 A2mQ6GQT1 1474 aa40,9■■■■■ 4,14
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP40,86■■■■■ 4,13
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Magi1Q6RHR9 1471 aa40,84■■■■■ 4,13
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Prex2Q3LAC4 1598 aa40,74■■■■■ 4,11
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa40,72■■■■■ 4,11
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Setd5Q5XJV7 1441 aa40,68■■■■■ 4,1
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Erich3F6QRE9 1637 aa40,67■■■■■ 4,1
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa40,65■■■■■ 4,1
1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP40,65■■■■■ 4,1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9,8 ms